广东省科技计划工业攻关项目(2011B031500011)
- 作品数：1 被引量：6H指数：1
- 相关作者：方美玉白志军任瑞文狄飚张培更多>>
- 相关机构：广州军区疾病预防控制中心广州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：美国国立卫生研究院基金广东省科技计划工业攻关项目广州市医药卫生科技项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 广东省流行的3株登革热2型病毒基因组全序列测定及分析被引量：6
- 2013年
- 目的测定广东省3株登革热2型病毒的全序列,探讨其来源及基因型。方法运用RT PCR法扩增来自广东省的登革热2型GD09/93、GD05/98和GD19/2001病毒株的全序列,采用遗传距离法构建进化树。结果3株登革热2型病毒的全基因组长度均为10 723 nt,5′及3′端各有一非编码区,结构基因和非结构基因位于基因组97~10 269 nt之间,共编码3391个氨基酸,读码结构完全相同。GD05/98与GD09/93、GD05/98与GD19/2001、GD09/93与GD19/2001之间的碱基序列同源性分别为93.3%、92.4%和97.6%,氨基酸序列同源性分别为96.7%、96.5%和98.5%。结论3株登革热2型病毒均对乳鼠致病,与对乳鼠不致病的参考株（DEN2-04株）比较共有18个氨基酸位点的差异引起极性或电荷变化,PrM-134、NS2A-153、NS4B-102所带电荷的变化对抗原性影响较大。GD05/98株与泰国分离株同为Ⅱ基因型,GD09/93和GD19/2001株与印度尼西亚、澳大利亚、台湾株分在Ⅳ基因型;表明我国登革热2型病毒有不同的基因型,而不同时期也存在同一种基因型传播。
- 白志军张培洪文艳刘建伟狄飚杨智聪任瑞文方美玉林立辉
- 关键词：登革热病毒全序列系统发生树基因型聚合酶链反应
