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番鸭就巢性状相关基因表达的cDNA-AFLP分析: 2012年; 【目的】寻找与番鸭就巢性状相关的表达基因,了解其就巢调控的分子机理。【方法】采用cDNA-AFLP(cDNA-amplified fragment length polymorphism)技术分析遗传背景相近的RF系白羽番鸭就巢个体和非就巢个体脑垂体基因表达差异。【结果】筛选到与就巢行为相关差异表达片段82条,选取其中15条进行测序。将测序结果在GenBank数据库进行BLAST比较和分析,发现8个片段(53.3%)与已知基因具有较高同源性,涉及与繁殖性能紧密相关的下丘脑-垂体-性腺轴(hypothalamic-pituitary-gonadal,HPG)上的功能基因,如GnRH基因、FSH基因,同时也分离到位于GH/IGF轴上的功能基因,即GH基因;以及在功能上属于信号传导、转录调控、代谢的调节基因,如超氧化物歧化酶基因、角蛋白关联蛋白基因、硫氰酸酶释放硫基转移酶基因等。2个片段与未知功能的基因有同源性,5个与数据库中现有的基因没有明显的相似性。随机选择3个片段进行RT-PCR验证,检测片段的表达模式与cDNA-AFLP结果一致。【结论】揭示番鸭不同就巢性状基因表达调控模式,进一步阐明番鸭就巢的分子机理。; 吴旭严美姣刘丽平傅星源连森阳李昂; 关键词：番鸭表达谱

山麻鸭SCA-2基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析: 2022年; 为了探究Struthiocalcin-2(SCA-2)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,试验选择9只产蛋高峰期(30周龄)的健康山麻鸭,采用SMART-RACE方法对山麻鸭SCA-2基因cDNA序列进行克隆,运用生物信息学软件对SCA-2基因编码蛋白质的理化性质、二级和三级结构进行预测及分析,构建SCA-2基因系统进化树;采集试验山麻鸭心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、肌胃、下丘脑、垂体、卵巢,以及输卵管的漏斗部、膨大部、峡部和子宫部共14个组织,每3只做一次混样处理,每个组织共3个重复,提取组织RNA,通过实时荧光定量PCR分析SCA-2基因mRNA在上述组织中的相对表达量。结果表明:SCA-2基因的cDNA全长为726 bp,该基因编码蛋白的分子式为C_(836)H_(1247)N_(229)O_(247)S_(8),属于不稳定蛋白,其中丝氨酸(12.6%)、亮氨酸(12.0%)、丙氨酸(10.2%)含量较高;蛋白质的二级结构中,α螺旋占23.35%、β折叠占13.77%、无规卷曲占62.87%,且包含信号肽序列,不含跨膜结构;山麻鸭与绿头鸭、凤头潜鸭和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;SCA-2基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在输卵管子宫部和峡部组织中的表达量极显著高于卵巢(P<0.01),明显高于其他组织。说明本试验成功克隆到了SCA-2基因,该基因可能在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要角色。; 张迎燕刘亚楠江林梅慧灵郑定黔田若宁徐丽李昂吴旭; 关键词：山麻鸭基因克隆生物信息学组织表达谱

Kisspeptin/GPR54系统与脊椎动物生殖被引量：1: 2013年; 脊椎动物生殖过程涉及到一系列信号通路的调控,Kisspeptin/GPR54系统对GnRH脉冲释放的激活起重要作用,是性发育启动和脊椎动物生殖的调节器。Kisspeptin能通过GPR54受体激活多种信号,以发挥功能。本文首先对参与脊椎动物生殖调控的Kisspeptin/GPR54系统的概念与发现做简要叙述,并进一步就Kisspeptin/GPR54系统如何调控脊椎动物生殖方面做一综述。; 刘兴廷严美姣李昂连森阳吴旭; 关键词：KISSPEPTIN GNRH 脊椎动物生殖

山麻鸭OC-116基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析被引量：1: 2022年; 实验旨在探究OC-116(Ovocleidin-116)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,应用SMART-RACE技术克隆获得了长度为2129 bp的山麻鸭OC-116基因cDNA全长序列,运用生物信息学软件对该基因和蛋白的特征进行分析,结果显示:该基因编码蛋白的分子式为C2710H4331N865O927S12,属于不稳定蛋白,其编码的蛋白中甘氨酸(16.5%)、丙氨酸(11%)、丝氨酸(10.2%)含量较高。蛋白的二级结构中,α螺旋(Hh)占比0.47%、β折叠(Ee)占比17.64%、无规卷曲(Cc)占比81.89%,且包含肽信号,不含跨膜结构;系统进化树显示山麻鸭与绿头鸭、黑天鹅和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;在mRNA的水平上,OC-116基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在垂体、子宫部和峡部中的表达量极显著高于其他组织。子宫部和峡部分别是蛋壳矿化形成和蛋壳膜形成部位,表明OC-116基因在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要的角色。; 张迎燕刘亚楠郑定黔田若宁徐丽李昂吴旭; 关键词：山麻鸭基因克隆生物信息学组织表达谱

番鸭GH基因实时荧光定量PCR检测方法的建立: 建立检测番鸭GH基因mRNA表达水平的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。根据GenBank中近源物种GH的基因序列,在其保守区设计并合成特异性引物,以鸭肌动蛋白(β-actin)为内参,建立实时荧光定量PCR...; 李昂刘丽平肖文权王光瑛连森阳彭亮翁辉吴旭; 关键词：番鸭 GH基因实时荧光定量RT-PCR; 文献传递

番鸭cDNA-AFLP体系的建立: 2011年; 以番鸭脑垂体为材料,用Trizol法提取总RNA,用Superscipt II-RT合成第一链cDNA,RNase H和DNA Polymerase合成第二链cDNA,最后用EcoRⅠ/MseⅠ分步酶切cDNA各2 h,经T4连接酶合成双链cDNA,预扩增反应后产物稀释40倍进行选择性扩增反应.经1%琼脂糖电泳及6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的结果显示,番鸭脑垂体总RNA的提取及cDNA-AFLP预扩增和选择性扩增的效果良好.番鸭cDNA-AFLP反应体系的建立为番鸭就巢的分子机理研究奠定了基础.; 吴旭严美姣刘丽平连森阳傅星源王光瑛李昂; 关键词：番鸭 CDNA-AFLP

自组织映射神经网络在生物信息学中的应用被引量：4: 2011年; 自组织映射神经(Self-organizing maps,SOM)网络是一种无监督学习方法,具有良好的自组织、可视化等特性,现已广泛应用于各个领域。本文介绍了SOM网络在基因组序列分析、单核苷酸多态性检测、基因表达数据分析以及蛋白质结构预测和分类中的应用,同时展望了SOM网络在生物信息学中的应用前景。; 刘丽平李昂连森阳王光瑛吴旭; 关键词：SOM网络生物信息学基因蛋白质

miRNAs介导下丘脑-垂体-性腺轴调控动物生殖的研究进展被引量：11: 2017年; 下丘脑-垂体-性腺(Hypothalamic-Pituitary-Gonadal,HPG)轴在动物繁殖系统发育调控中扮演重要角色,几乎控制了哺乳动物从胎儿发育、青春期到性成熟整个过程。下丘脑-垂体-性腺形成反馈回路共同维持内分泌系统稳定,HPG系统异常会导致动物繁殖性能缺陷。近年来,科学家在多种生物中发现了一类能时序调控发育进程的小分子非编码RNA(miRNA),主要通过转录后调控基因表达。它在进化上高度保守且生物学功能广泛,在动物机体多种生理过程中发挥重要作用。miRNAs表达的改变与动物繁殖性能存在相关性,本文从组织和激素2个层面就miRNAs在HPG轴系统中的表达和功能展开综述,为研究miRNAs与HPG轴系统关系及其在动物繁殖过程的作用机理提供参考。; 曹素梅万雪萍严美姣李昂吴旭; 关键词：MIRNAS 生殖调控

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国家自然科学基金(31001005)

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