国家自然科学基金(20050055037)
- 作品数：1 被引量：2H指数：1
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- αⅡbβ3同源模拟和环形RGD药物小分子设计被引量：2
- 2008年
- 血小板表面的整合蛋白α_(Ⅱb)β_3对血栓的形成具有很重要的调控作用,α_(Ⅱb)β_3与纤维蛋白原上的RGD特征序列结合,促进血小板凝集进而形成血栓。这样可以在理论上设计一个环形RGD小分子(RGD-c)与α_(Ⅱb)β_3蛋白结合,阻断其与纤维蛋白原的结合位点,进而阻断血栓形成。以糖蛋白α_vβ_3(pdb代码1jv2)作为模板,利用modeller8v2软件进行同源模拟得到α_(Ⅱb)β_3三维模型。而小分子则以RGD序列为主,两边各加一个氨基酸X、Y,X和Y之间用一个二硫键相连,通过改变X和Y,重复优化过程则可得到不同的小分子模型,将其与α_(Ⅱb)β_3进行分子对接,可以找出比较理想的XY组合。
- 罗明艳陈梅宗李任植
- 关键词：对接MM
