北京市自然科学基金(7021004)
- 作品数:20 被引量:153H指数:7
- 相关作者:曹务春吴晓明江佳富左曙青汤芳更多>>
- 相关机构:军事医学科学院北京市海淀区疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:北京市自然科学基金山东省医药卫生重大创新研究计划课题国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学更多>>
- 肾综合征出血热流行病学数学模型研究进展被引量:1
- 2003年
- 郭秀花曹务春张习坦
- 关键词:肾综合征出血热流行病学数学模型
- 应用巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP对山东肾综合征出血热病人血清中HV基因检测和分型研究被引量:4
- 2006年
- 目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中的HV进行基因扩增,采用RFLP、SSCP分型,并进行序列测定与分析。结果48份临床和ELISA检测确诊的HFRS病人血清经巢式RT-PCR扩增后,41份阳性,阳性率85.42%。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经HindIII、HinfI酶切后,呈现2种不同的RFLP图谱:33份显示与R22株相似的酶切图谱,应属SEOV型;另外8份显示出与HTN76-118株相似的图谱,属HTNV型,这8份HTNV型标本均为10-12月间收集的病人血清。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经SSCP分析,亦呈现2种不同的图谱:33份具有与R22株相似的SSCP图谱,应属SEOV型;而另8份则与HTN76-118株具有相似的SSCP图谱,属HTNV型。对部分扩增产物序列采用系统进化树分析也得出类似的结果:sdp1、sdp2、sdp3与HTN型76-118株亲缘关系相近,属同一簇,而sdp22、sdp37与SEOV型Z37、R22株亲缘关系相近,属另外一簇,这与RFLP和SSCP获得的结果相一致。结论山东肾综合征出血热重疫区病人基因型以SEOV型为主,但在秋冬季节也存在HTNV型。巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP法可对HV准确分型,而且简便、迅速,适合于大规模流行病学调查。
- 刘运喜赵仲堂许晓群李健高媛江佳富张景兰杨占清曹务春
- 关键词:HV巢式RT-PCRRFLPSSCP
- 聚类分析对中国肾综合征出血热疫区分型的探讨被引量:3
- 2003年
- 目的 用聚类分析探讨中国肾综合征出血热 (HFRS)疫区分型情况。方法 对 1 995~1 999年数据完整的 36个监测点的发病率资料 ,按各年度及计算 5年月平均发病率后分别进行聚类分析。结果 36个HFRS监测点 1 995~ 1 999年资料综合发病率聚成 3类时 ,与 1 980~ 1 992年原分型结果相比 :分型相同的有 2 4个 ,占 66 .7%。在现分型中 ,除了 7个监测点未给出明确的疫区分型外 ,其余 2 9个监测点 1 999年报道分型的结论与 1 999年采用聚类分析进行的疫区分型 ,一致的有 2 3个 ,占 79.3 %。结论 春季和夏季HFRS发病有所增加 ,而秋冬季则相对下降 ;
- 郭秀花曹务春胡良平周诗国张习坦陈化新
- 关键词:聚类分析肾综合征出血热流行病学
- 应用地理信息系统研究我国肾综合征出血热疫区类型与主要宿主动物构成的关系被引量:46
- 2004年
- 目的 分析中国肾综合征出血热(HFRS)疫区的性质与主要宿主动物种群构成的关系。方法 收集中国122个地区1991~1999年HFRS病例血清分型资料和41个监测点的宿主动物种类及数量资料,在ArcGIS 8.1软件的支持下,建立中国HFRS病例分型地理信息系统(GIS)和监测点宿主动物构成GIS,并以此为基础通过反距离加权插值法(IDW)建立中国HFRS主要疫区分型地图,叠合监测点宿主动物构成图;对各监测点的宿主动物构成进行分层聚类分析。结果 中国HFRS不同类型疫区呈现明显的区域性分布,总体表现为从东北至西南方向Ⅰ型汉坦病毒(HV)为主的混合型疫区与Ⅱ型HV为主的混合型疫区交替分布的特征;监测点野外宿主动物种类较多且各地区鼠种构成差异较大,居民区宿主动物种类相对较少,且优势鼠种大多局限于2~3种宿主动物;监测点宿主动物构成的聚类分析结果显示其疫区类型与所在疫区病例血清型基本一致。结论 以空间数据库为基础的GIS及其空间分析能根据HFRS样点信息很好地预测各主要疫区的分型特征。
- 方立群李承毅杨华吴晓明杨红陈化新李小文曹务春
- 关键词:宿主动物HFRS疫区肾综合征出血热鼠种构成
- 应用地理信息系统分析中国肾综合征出血热的空间分布被引量:47
- 2003年
- 目的 利用地理信息系统 (GIS)技术分析中国大陆肾综合征出血热 (HFRS)的空间区域分布 ,建立HFRS危险区域分布图。方法 收集中国 41个HFRS监测点 1 995~ 1 998年的人群发病资料建立数据库 ,以中国省级、县级、一级河流数字地图为背景 ,在ArcGIS软件的支持下 ,与建立的数据库关联并对监测点人群发病资料进行反距离权重插值分析 ;收集 1 998年 6月SPOT4卫星覆盖东南亚地区的植被影像 ,逐一提取出各监测点监测区域的归一化植被指数 (NDVI) ,与 1 995~ 1 998年HFRS监测点人群平均发病率进行相关分析 ;根据不同流行强度监测区域的NDVI值 ,对遥感影像使用不同的颜色进行密度分割。结果 HFRS监测点人群发病资料的空间分析预测模型显示 ,中国HFRS主要分布于黑龙江流域、黄河中下游地区、长江中下游地区及京杭大运河 淮河流域地区 ,与1 995~ 1 998年全国各县HFRS平均发病率分布图进行比较 ,发现两者基本一致 ;相关分析显示HFRS发病率与NDVI之间呈现正相关 (r=0 .41 7,P <0 .0 1 ) ,根据各监测点NDVI的差异建立了中国HFRS危险区域分布图。
- 方立群曹务春吴晓明杨红张习坦陈化新王宝光
- 关键词:流行性出血热地理信息系统
- 北京市褐家鼠中汉坦病毒的分离和初步鉴定被引量:5
- 2005年
- 左曙青张泮河吴晓明詹琳江佳富汤芳孙培源王炳才蔡伟张久松杨红曹务春
- 关键词:褐家鼠汉坦病毒肾综合征出血热
- 驻石某部肾综合征出血热流行病学调查被引量:3
- 2006年
- 目的探讨某部肾综合征出血热(HFRS)的流行状况、啮齿动物间汉坦病毒(HV)感染特点及HV基因型,为HFRS的预防控制提供科学依据。方法夹夜法捕鼠,计算鼠密度,确定鼠种构成。针对HV基因M片段部分序列设计2种型特异性引物,应用RTPCR法检测宿主动物带病毒情况。结果共捕获宿主动物14只,血清抗体阳性率为21.43%,RTPCR扩增检测出阳性标本1份,为褐家鼠,分型为汉城型阳性标本。密切接触人群血清抗体阳性率为3.64%。结论该地区存在汉城型HV感染,提示应加强疫情监测,防止疫情的扩大蔓延。
- 汤芳李森林高东旗宋文静左曙青张云霜付云川江佳富曹务春
- 关键词:肾综合征出血热汉坦病毒流行病学
- 北京地区汉坦病毒宿主动物生态流行病学调查
- 2006年
- 目的了解北京地区啮齿动物间汉坦病毒(HV)感染状况、HV基因型及其与宿主动物的关系。方法夹夜法捕鼠,计算鼠密度,确定鼠种构成。针对HV基因M片段部分序列设计2种型特异性引物,应用RT-PCR法检测宿主动物带毒情况,并用ClustalX(5.0)和DNAClub软件对序列进行分析。采用SPSS软件分析宿主动物HV感染的流行病学特征。结果共捕获宿主动物295只,褐家鼠为优势鼠种,占71.53%。其次为小家鼠,占14.58%。RT-PCR检测宿主带病毒率,其中褐家鼠阳性率为18.01%,小家鼠为2.33%。对5份扩增阳性标本进行序列测定并对其核苷酸序列进行分析,结果显示均为汉城型(SEO)病毒。不同性别的褐家鼠HV感染率之间差异无统计学意义(χ2=0.032,P>0.05);不同体重的褐家鼠HV感染率之间差异有统计学意义(χ2=16.900,P<0.001),体表有、无疤痕的褐家鼠之间HV感染,差异有统计学意义(χ2=30.441,P<0.001)。结论北京地区存在较为广泛的汉城型HV感染,目前尚未发现汉滩型HV疫源地。褐家鼠为北京地区HV优势宿主和主要带毒鼠,宿主动物种群特征与HV感染具有不同程度的相关性。
- 汤芳李森林王爱国高东旗吴晓明左曙青王征曹务春
- 关键词:汉坦病毒宿主
- 北京市部分人群和农产品集散地鼠间汉坦病毒感染的研究被引量:5
- 2006年
- 目的了解北京地区鼠间汉坦病毒(HV)感染的可能来源与线索。方法2004年4-5月选取北京城区某大型火车站和郊区某大型农产品贸易集散地,采用夹夜法捕鼠,应用间接ELISA法检测鼠血清IgG抗体;针对HV M和S基因片段设计汉城型病毒(SEOV)特异引物,应用逆转录-聚合酶链反应检测鼠肺中HV,阳性标本直接测序,与GenBank已知序列进行两两比较,对获得序列进行多重比较分析并构建系统发育树。结果共捕获鼠类24只,平均密度3.49%(24/690),火车站和农产品集散地平均鼠密度分别为1.25%(3/240)和4.67%(21/450),血清抗体阳性率分别为0.0%和9.5%。优势种分别为小家鼠和褐家鼠,带病毒率分别为14.28%(1/7)和5.89%(1/17)。序列比较结果显示:2份扩增阳性标本M片段核苷酸差异为7.6%,来自火车站的dc501与山东省SD227、河北省Hebei4株亲缘关系较近。来自集贸市场的BjFT01株与GenBank中已注册的其他北京市SEOV株比较,存在一些独特的基因差异,并与海南省HN71株、浙江省K24-E7株多个位点变异类型一致,同源性较高,构成一个支系。而其S片段与韩国80-39株同源性最高(96.4%),与浙江K24-E7同源性为95.5%。结论北京市人群及农产品集散地鼠类HV感染对肾综合征出血热流行的潜在危险较大,家栖鼠携带并传播的SEOV由上述类似地区从外埠输入到北京的可能性较大,但有待进一步研究。
- 江佳富吴晓明王日明左曙青徐伟才郭天宇陈立泉曹务春
- 关键词:汉坦病毒啮齿动物
- 肾综合征出血热发病率季节性时间序列预测模型被引量:7
- 2003年
- 郭秀花曹务春胡良平赵秋敏张泮河
- 关键词:肾综合征出血热发病率季节性时间序列