国家自然科学基金(30571619)
- 作品数：6 被引量：18H指数：3
- 相关作者：陈峰赵杨荀鹏程于浩易洪刚更多>>
- 相关机构：南京医科大学东南大学江苏省人民医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 病例同胞对照设计被引量：4
- 2006年
- 目的介绍病例同胞对照设计的研究设计及统计分析方法,并对实际资料进行统计分析。方法以亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T突变与冠心病连锁研究为实例,采用同胞-传递不平衡检验(s-TDT)和同胞组不平衡检验(SDT)等方法进行统计分析。结果采用s-TDT分析,统计量Z=0.27,P>0.05;采用SDT分析,χ2=0.31,P>0.05。提示受累子代与非受累子代T等位基因分布差异无统计学意义。结论病例同胞对照设计使用患者同胞作为对照,避免了人群分层现象,可以用来检测基因与疾病之间的关联或连锁。
- 易洪刚陈峰于浩赵杨娄东华
- 关键词：基因
- logitboost及其在判别分析中的应用被引量：11
- 2006年
- 目的介绍一种基于机器学习的分类方法-logitBoost在判别分析中的应用。方法结合实例和模拟数据介绍了logitBoost的思想,原理,方法和步骤,就模型的拟合效果与Fisher线性判别、二次判别、logistic回归判别进行了比较,并探讨了“logitBoost判别”的优势及其在医学领域中的应用前景等问题。结果与传统方法相比,logitBoost判别在实例以及模拟数据的应用中,均显现出较好的或相似的模型预测效果。结论当传统的判别分析条件得不到满足,或判别效果不佳时,logitBoost能够达到良好的预测效果,在医学领域的判别分析中有较好的应用前景。
- 富春枫荀鹏程赵杨陈峰
- 病例-同胞对照设计统计方法检验效能的比较研究
- 2007年
- 目的比较病例-同胞对照设计三种统计方法的检验效能。方法应用Monte-Carlo模拟方法,使用Slink软件产生的模拟家系资料,比较同胞-传递不平衡检验(s-TDT)、同胞组不平衡检验(SDT)和同胞对关联检验法(SAT)三种统计方法的检验效能。结果(1)SDT方法的I型误差最接近检验水准α=0.05;(2)在三种遗传模式中,s-TDT方法的效能最高,SAT方法的效能最低。结论病例-同胞对照设计使用患者的同胞作为对照,避免了人群分层现象,可以用来评价遗传因素与疾病之间的关联。
- 易洪刚陈峰于浩赵杨娄冬华荀鹏程
- 关键词：MONTE-CARLO模拟
- 不完全病例对照研究中对照组部分基因信息缺失基因-环境交互作用的估计
- 2007年
- 目的探讨不完全病例对照研究中对照组基因信息部分缺失时基因-环境交互作用的估计。方法在Stata 9.0软件上采用Monte Carlo方法模拟不同基因信息缺失比例数据,对缺失数据采用hot deck多重填补程序后分析和删除缺失值分析结果进行比较。结果缺失数据<50%时,hot deck多重填补后分析和删除缺失值分析对环境主效应、基因主效应以及基因-环境交互作用的估计系数接近完全数据的系数,随缺失比例的增加,两种方法的估计方差均增加,但hot deck多重填补估计方差小于删除缺失值分析。结论不完全病例对照研究中,对照组基因信息缺失比例<50%时,可以用hot deck填补方法充分利用已有的信息估计基因-环境的交互作用,提高估计精度。
- 柏建岭荀鹏程赵杨于浩沈洪兵魏庆义陈峰
- 关键词：基因-环境交互作用缺失数据
- 差异表达驱动的微阵列数据降维策略被引量：4
- 2007年
- 目的探究差异表达驱动的微阵列数据之降维策略。方法本文提出permutation检验和99.99%的下单侧可信区间相结合的策略用于"维度粗筛",HotellingT2检验结合逐步筛选的策略用于寻求组间差异表达的"局部变量组合"。结果以"正常成年男子和精子运动能力低下者精子蛋白表达差异研究"之实例展示了该降维策略的实际应用效果,结果发现了"十个蛋白组合"在组间差异表达。结论本文提出差异表达驱动的微阵列数据降维策略是实用可行的。
- 王璐荀鹏程赵纯沙家豪陈峰
- 关键词：微阵列数据
- 特发性室速短期暴露危险因素的病例交叉研究
- 2009年
- 目的探索特发性室速（IVT）短期暴露的危险因素。方法采用病例交叉设计，通过广义估计方程对2007年11月1日至2008年12月31日期间江苏省人民医院和东南大学附属医院IVT病例和短期暴露危险因素之间的联系进行分析。结果多因素分析结果显示的危险因素有强体力活动（OR=2．20，95％CI：1．51—3．19）、生气（OR=1．87，95％CI：1．07—3．27）、悲伤（OR=3．58，95％CI：2．19～5．84）、激动（OR=3．06，95％CI：1．61～5．83）、感染（OR=2．25，95％CI：1．44～3．50）。结论强体力活动、生气、悲伤、激动、感染是IVT的危险因素。病例交叉研究能有效地识别，并揭示其作用强度。
- 王均琴马宁高仲阳魏永越陈峰
- 关键词：特发性室速病例交叉研究广义估计方程
