国家自然科学基金(30600416)
- 作品数：6 被引量：55H指数：4
- 相关作者：孔瑾韩振海李擎天李天忠王忆更多>>
- 相关机构：中国农业大学中国农业科学院特产研究所学研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 山葡萄性别相关AFLP标记筛选及SCAR标记转化被引量：24
- 2008年
- 通过AFLP分子标记方法,应用64对引物组合EcoRⅠ-NNN/MseⅠ-NNN对山葡萄雌花、雄花和两性花植株基因池进行筛选,引物E-AGC/M-CTG在雄花和两性花植株基因池DNA中扩增出一条分子量为283bp的特异性条带;经组池个体和其它品系验证,该特异性条带能在雄株和完全植株中稳定出现。将该特异性条带回收、克隆、测序,设计SCAR标记引物,对已知性别的85份山葡萄种质进行盲测,准确率达到97·6%,表明标记转化成功。由于该SCAR标记在绝大多数山葡萄栽培品种和有育种价值的种质资源中得到验证,可利用该SCAR标记对山葡萄杂交后代在苗期进行性别鉴定,提高育种效率。
- 唐美玲孔瑾许雪峰沈育杰王忆李天忠韩振海
- 关键词：山葡萄性别AFLPSCAR分子标记
- 珠眉海棠cDNA-AFLP分析体系的建立被引量：15
- 2008年
- 以珠眉海棠(Malus zumiMats)为研究材料,对cDNA-AFLP反应体系的关键因素(酶切时间、预扩增体系、选择性扩增体系)进行探索,建立了重复性好的cDNA-AFLP分析体系。结果表明,EcoRI和MseI的组合4h可将ds-cDNA酶切完全,与相应接头连接过夜后产物直接用于预扩增,1μl稀释20倍的预扩增产物作为模板用于选择性扩增,可以获得带型丰富且重复性好的结果。珠眉海棠cDNA-AFLP反应体系的建立为进一步的分子生物学研究建立了平台。
- 李志红唐美玲刘佳王忆李天忠韩振海许雪峰孔瑾
- 关键词：ECORI
- 基于RHE元件和拟南芥转录组的根毛发育基因筛选被引量：1
- 2010年
- 拟南芥根毛发育是分子发育生物学的重要模型。本试验通过分析拟南芥根毛突变体bst的芯片数据,并对筛选到的下调表达变化超过2倍的基因的启动子进行根毛顺式作用元件RHE(Root HairElement)的筛查,初步获得了根毛发育候选基因。结果表明,在bst中下调表达变化超过2倍的494个基因中,共有13个基因启动子中有RHE元件,其中5个为已报道的参与根毛发育基因,8个为本研究首次发现的参与根毛发育的候选基因。
- 张素维蒋阿维孙扬吾李擎天黄黎芳孔瑾
- 关键词：BST基因芯片
- 珠眉海棠水通道蛋白MzPIP1;1基因的克隆与表达分析被引量：4
- 2012年
- 通过对珠眉海棠盐胁迫微列阵分析,从盐胁迫cDNA文库中分离得到盐诱导的水通道蛋白基因MzPIP1;1 cDNA序列全长1 135bp,开放阅读框共870bp,5′-UTR和3′-UTR的长度分别是91和174bp。MzPIP1;1编码289个氨基酸,有6个跨膜结构和2个NPA(Asp-Pro-Ala)保守区。聚类分析表明:MzPIP1;1和其他4个物种PIP1类同源性在80%以上,属于质膜水通道蛋白PIP1类。拟南芥原生质体瞬时转化结果表明MzPIP1;1定位在质膜上。半定量RT-PCR表明MzPIP1;1基因受到盐和低温诱导。推断MzPIP1;1基因在盐胁迫下的表达调控与珠眉海棠耐盐能力密切相关。
- 李擎天赵宇周绮云黄黎芳蒋玉妆陈浩孔瑾
- 关键词：盐胁迫
- 苹果砧木珠眉海棠盐胁迫应答基因的微列阵研究被引量：5
- 2009年
- 以盐胁迫下苹果的耐盐砧木珠眉海棠为材料,用SMARTTM方法构建了cDNA文库。随机挑取5 000个cDNA克隆制备芯片,得到差异表达的基因388个,其中249个表达上调、139个表达下调。分析其中变化量在8倍以上的42个基因,并对部分基因进行RT-PCR验证,结果与芯片杂交结果一致。根据功能把这些基因分为5类:光合作用相关基因、物质转运相关基因、基础代谢相关基因、逆境相关基因以及其他基因。其中直接参与盐应答的基因占34%,包括上游调控蛋白、合成植体内小分子渗透调节物的限速酶、胁迫产生的活性氧清除剂、直接调节离子运输和储存的蛋白等。用此cDNA微列阵体系,将基因芯片技术与cDNA文库相结合,成为全面研究盐胁迫下基因表达的有效途径。为进一步研究盐应答基因功能及盐胁迫机制提供参考。
- 刘佳李擎天孔瑾许雪峰韩振海
- 关键词：CDNA文库基因芯片差异表达基因
- 珠美海棠MzWRKY基因家族盐胁迫应答模式研究被引量：8
- 2010年
- 对苹果属植物现有的58个WRKY的EST序列进行分析,得到了37条uniESTs。珠美海棠(Malus zumi Mats)是耐盐的优良苹果砧木,能在土壤全盐含量为0.6%的盐碱地上存活。根据已知的37条uniESTs序列,通过半定量RT-PCR研究了珠美海棠中MzWRKY基因家族的盐应答模式。28个MzWRKY基因能检测到RT-PCR的产物,其中21个基因受盐诱导,1个受盐抑制。根据MzWRKY基因盐应答模式可将这些基因分为两组,基因表达模式的差异说明MzWRKY在珠美海棠的盐应答中角色的多样性。
- 蒋阿维张素维孙杨吾褚欣然赵宇许雪峰孔瑾
- 关键词：珠美海棠WRKY转录因子盐胁迫半定量RT-PCR
