福建省科技计划项目(2007N2011)
- 作品数：5 被引量：26H指数：4
- 相关作者：谢潮添纪德华陈昌生徐燕史修周更多>>
- 相关机构：集美大学厦门大学更多>>
- 发文基金：福建省科技计划项目国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 坛紫菜叶状体RNA提取方法的改良与比较
- 2010年
- 为提取高质量的坛紫菜叶状体总RNA,对常用的几种植物RNA提取方法(CTAB法、SDS法、异硫氰酸胍法)按照去除多糖、多酚的方法进行了改良,并对分离的总RNA根据吸光值、电泳图谱及RT-PCR检测等结果与两种试剂盒(离心柱试剂盒法,RNAiso法)的提取结果进行了比较。结果表明,SDS法、异硫氰酸胍法和RNAiso法3种方法提取的RNA纯度低,质量差,部分RNA已经发生了降解。而改良CTAB法和离心柱试剂盒法提取的总RNA质量可靠,完整性好,纯度高,并且成功去除了可能影响逆转录酶活性的物质,可以进一步应用于cDNA文库构建,基因表达分析等后续实验,但这两种方法各有优缺点,应根据实际情况选用合适方法进行坛紫菜叶状体总RNA的分离。
- 谢潮添梅高尚陈昌生纪德华
- 关键词：坛紫菜叶状体RNA提取
- 坛紫菜遗传连锁图谱的构建被引量：5
- 2010年
- 以野生型坛紫菜纯系(♀)和红色型坛紫菜纯系(♂)作为杂交亲本,结合四分子分析法及单个体细胞克隆的丝状体途径,创建了由157个株系组成的坛紫菜DH作图群体,并用经过筛选的24对SRAP引物和16对SSR引物对父母本及作图群体各株系进行双标记分析,获得了224个多态性标记,其中157个标记符合孟德尔分离规律。根据标记间的连锁规律,首次构建了坛紫菜的分子遗传连锁图谱,所构建的遗传图谱由包含124个标记(含SRAP标记104个,SSR标记20个)的5个连锁群组成,总长度为879.2cM,平均标记间隔为7.09cM,各个连锁群长度为134.2～213.6cM,包含标记18～31个。最后采用3种不同方法计算得到坛紫菜的估计基因组长度平均为955.3cM,由此得到坛紫菜遗传连锁图谱的基因组覆盖率为92.0%。
- 徐燕谢潮添陈昌生纪德华高亚辉
- 关键词：坛紫菜遗传连锁图谱相关序列扩增多态性简单重复序列
- 福建沿海野生坛紫菜主要品质性状分析被引量：9
- 2011年
- 比较研究了福建沿海8个野生坛紫菜种群的藻胆蛋白、叶绿素、粗蛋白、氨基酸等主要品质指标,结果表明:1)野生坛紫菜种群WP3的藻体在粗蛋白、总藻胆蛋白及叶绿素的含量上均具有较高优势,而WP6的藻体尽管粗蛋白的含量最低,但总藻胆蛋白及叶绿素的含量却最高.2)8个野生坛紫菜种群含有丰富的人体必需氨基酸,其质量比达到52～85 mg/g;且氨基酸组成比例均衡,8种必需氨基酸占氨基酸总量的28.3%～32.4%,正好与联合国粮食与农业组织(FAO)制定的人类必需氨基酸的理想模式(26.2%)相近.3)各野生坛紫菜种群含有丰富的起呈味作用的游离氨基酸,游离氨基酸含量最高的WP3种群(1.879 mg/g)比含量最低的WP5种群(1.325 mg/g)高41.8%;种群WP7所含的游离氨基酸种类最多,达15种.
- 纪德华谢潮添史修周徐燕张元
- 关键词：野生坛紫菜藻胆蛋白总氨基酸游离氨基酸
- 5.8S rDNA-ITS区片段的序列分析在坛紫菜种质鉴定中的应用被引量：9
- 2009年
- 为探讨DNA序列标记技术在坛紫菜种质鉴定中的应用,对10个野生坛紫菜种质材料的5.8S rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列分析,结果发现扩增的片段长度在1208～1219bp之间,可以分为ITS1区,5.8S区和ITS2区3个部分,其中5.8S区片段的长度完全一致,均为160bp;ITS1区和ITS2区片段的长度也非常接近,只有几个碱基的差异。多重序列比对发现10个种质材料的ITS区(包括ITS1和ITS2)序列都存在一定差异,序列同源性在95.82%～99.73%之间,而5.8S区序列则完全一致,但与其它种紫菜的5.8S区序列有很大差异,序列同源性在79.7%～95.0%之间。由此认为5.8S rDNA-ITS区这种高度保守区和高变区交替排列的形式可以成为坛紫菜种质鉴定及系统进化分析的强有力工具。
- 赵玲敏谢潮添陈昌生纪德华
- 关键词：坛紫菜RDNA
- 坛紫菜种质材料DNA指纹图谱的构建被引量：9
- 2010年
- 采用20对简单重复序列(SSR)引物对福建省坛紫菜种质资源库中保存的44个坛紫菜种质材料进行了遗传分析,共检测到了81个多态性位点,每对引物检测到的等位基因介于2～6个之间,平均为4.05个,引物的PIC值介于0.15～0.79之间,平均为0.57。然后根据3对引物(Phes08,Phes03和PC13)扩增出的16个多态性位点构建了44个坛紫菜种质材料的指纹图谱库,使得每一种质材料均具有其特异的DNA指纹图谱。并根据指纹图谱中各扩增位点条带的有无,将指纹图谱转化成了计算机可以识别的数码指纹,开发了相应的数码指纹识别软件,为坛紫菜种质的自动化鉴定及坛紫菜种质资源库的信息化管理奠定了基础。
- 谢潮添陈昌生纪德华赵国瑞徐燕史修周
- 关键词：坛紫菜种质材料简单重复序列
