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国家高技术研究发展计划(2003AA223031)
作品数:
3
被引量:7
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相关作者:
郭晓奎
石铁流
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李亦学
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2006
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问号钩端螺旋体基因组DNA芯片的研制
2006年
目的研制并初步评估问号钩端螺旋体(简称钩体)赖型赖株的基因组DNA芯片。方法利用Primegens引物设计软件筛选出问号钩体赖型赖株全基因组中的特异性基因进行引物设计。对成功设计出相应引物的3 290个基因用聚合酶链反应方法进行扩增,以纯化后的产物点样制备芯片。并用双色荧光杂交策略对芯片质量进行了初步平估。结果共获得3 290个基因产物用于点样。参考株自身杂交实验结果表明:该芯片有较高的点一致性、信噪比和较低的假阳性率。结论成功制备了包含问号钩体赖型赖株3 290个目的基因的基因组DNA芯片,并可用于基于该芯片的问号钩体比较基因组学的研究。
盛跃颖
史耀舟
何平
杨杨
胡宝瑜
赵国屏
郭晓奎
关键词:
问号钩端螺旋体
钩端螺旋体致病机制的研究进展
被引量:3
2006年
钩端螺旋体病是一种由致病性钩端螺旋体感染引起的人兽共患病。感染者有多种临床表现,其中重者表现为致死性肺弥漫性出血。目前,钩端螺旋体所引起出血的机制仍未被阐明。本文就近年来对钩体致病物质及其相关作用机制的研究状况作了概述。
徐静
郭晓奎
姜叙诚
关键词:
钩端螺旋体
致病机制
人兽共患病
钩端螺旋体蛋白质相互作用网络预测与系统分析
被引量:4
2006年
问号钩端螺旋体是一种致病菌,能够引起人畜共患病.该细菌全基因组序列测序的完成,为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础.本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵子法)来预测钩端螺旋体赖株蛋白质相互作用网络.对运动和趋化系统、信号传导系统、脂多糖生物合成以及黏附、侵袭等有关蛋白质之间的相互作用进行了详细分析.除此以外,根据蛋白质的相互作用网络以及功能分类,预测了203个未知蛋白质可能的功能.这不仅为进一步研究钩端螺旋体赖株的致病机制提供了一个资料,也为在基因组范围内应用生物信息学方法研究微生物提供了一个实例.
孙景春
徐晋麟
曹建平
刘琪
郭晓奎
石铁流
李亦学
关键词:
问号钩端螺旋体
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