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国家自然科学基金(07KJA18016)

作品数:3 被引量:13H指数:2
相关作者:杨光王加连熊晔杨梅周旭明更多>>
相关机构:南京师范大学盐城师范学院徐州医学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
相关领域:生物学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 2篇英文
  • 2篇系统发育
  • 2篇系统发育分析
  • 2篇发育分析
  • 1篇线粒体基因
  • 1篇线粒体基因组
  • 1篇线粒体基因组...
  • 1篇内含子
  • 1篇鲸目
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇发育关系
  • 1篇TREE
  • 1篇ANALYS...
  • 1篇MAMMAL...
  • 1篇草兔
  • 1篇MONOPH...
  • 1篇PHYLOG...
  • 1篇LEAVES

机构

  • 2篇南京师范大学
  • 1篇徐州医学院
  • 1篇盐城师范学院

作者

  • 2篇杨光
  • 1篇张盼
  • 1篇王加连
  • 1篇杨云霞
  • 1篇周旭明
  • 1篇杨梅
  • 1篇熊晔

传媒

  • 2篇兽类学报
  • 1篇Integr...

年份

  • 1篇2015
  • 1篇2012
  • 1篇2011
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
The position of tree shrews in the mammalian tree:Comparing multi-gene analyses with phylogenomic results leaves monophyly of Euarchonta doubtful被引量:2
2015年
The well-accepted Euarchonta grandorder is a pruned version of Archonta nested within the Euarchontoglires(or Supraprimates)clade.At present,it includes tree shrews(Scandentia),flying lemurs(Dermoptera)and primates(Primates).Here,a phylogenomic dataset containing 1912 exons from 22 representative mammals was compiled to investigate the phylogenetic relationships within this group.Phylogenetic analyses and hypothesis testing suggested that tree shrews can be classified as a sister group to Primates or to Glires or even as a basal clade within Euarchontoglires.Further analyses of both modified and original previously published datasets found that the phylogenetic position of tree shrews is unstable.We also found that two of three exonic indels reported as synapomorphies of Euarchonta in a previous study do not unambiguously support the monophyly of such a clade.Therefore,the monophyly of both Euarchonta and Sundatheria(Dermoptera+Scandentia)are suspect.Molecular dating and divergence rate analyses suggested that the ancestor of Euarchontoglires experienced a rapid divergence,which may cause the unresolved position of tree shrews even using the whole genomic data.
Xuming ZHOUFengming SUNShixia XUGuang YANGMing LI
关键词:PHYLOGENOMICS
基于13个内含子的序列探讨鲸目的系统发育关系(英文)被引量:1
2011年
本文基于实验室筛选得到的13对内含子标记,在鲸偶蹄目的15个物种中进行有效扩增,并重建了这15个物种的系统发育关系。结果表明,抹香鲸总科(Physeteroidea)位于齿鲸亚目(Odontoceti)的基部,从而支持了传统的齿鲸亚目的单系性。在海豚总科(Delphinoidea)内部,贝斯分析结果支持了鼠海豚科(Phocoenidae)和一角鲸科(Monodontidae)的姐妹群关系,而后再与海豚科(Delphinidae)相聚。系统发育分析同时还强烈支持了海豚科的四个属(Sousa,Tursiops,Stenella,Delphinus)组成一个单系的"复合体"。另外,我们的分析结果并不支持瓶鼻海豚属(Tursiops)和原海豚属(Stenella)的单系性。基于松散分子钟的分歧时间估算与以往文献中的结果没有明显差异。这些研究结果提示,核基因内含子序列有希望解决一些长期存在的鲸类系统发育问题。
熊晔周旭明杨梅张盼杨云霞杨光
关键词:鲸目内含子系统发育分析
草兔线粒体基因组全序列及其系统发育关系分析(英文)被引量:10
2012年
草兔(Lepuscapensis)在我国数量多,分布广,但人们对草兔的系统地理学、草兔与其他兔类的系统发育关系了解不多,其亚种水平的分类也长期存在争议。本研究通过LA-PCR技术对草兔线粒体基因组全序列进行PCR扩增、序列测定和分析,并基于线粒体基因组12个蛋白质编码基因10776bp的核苷酸序列,采用贝叶斯法(BI)和最大似然法(ML)构建哺乳纲(Mammalia)灵长总目(Euarchontoglires)5个目12种动物的系统发育关系,结果支持兔形目(Lagomorpha)的单系起源,其中草兔与欧洲野兔(L.europaeus)亲缘关系最近,两者互为姐妹群,进而与家兔(Oryctolagus cuniculus)构成姐妹群关系。此外,基于线粒体细胞色素b基因全序列,构建31个兔类个体的系统发育关系,结果显示,草兔与雪兔(L.timidus),云南兔(L.comus)与高原兔(L.oiostolus),东北兔(L.mandschuricus)与塔里木兔(L.yarkandensis)有较近的亲缘关系,而在草兔内部,中国的草兔与南非草兔亲缘关系较远,采自江苏盐城的草兔与来自山东、陕西、四川的草兔聚为一支,具有明显较近的亲缘关系。该研究为更好地探讨草兔系统发育关系提供了进一步的分子生物学资料。
王加连杨光
关键词:线粒体基因组系统发育分析草兔
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