国家科技支撑计划(2013BAD01B04) 作品数:30 被引量:260 H指数:9 相关作者: 李占省 方智远 刘玉梅 庄木 张扬勇 更多>> 相关机构: 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 西南大学 中国农业科学院柑桔研究所 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 国家现代农业产业技术体系建设项目 农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 经济管理 生物学 更多>>
胡萝卜回交渐渗系表型遗传变异研究 2017年 以野生胡萝卜品种松滋野生(Ws)和欧洲橘色栽培品种Amsterdam(Af)为亲本构建的223个回交渐渗系为试材,深入分析Ws染色体片段在回交渐渗系后代中的遗传表现。通过两年对12个农艺性状的调查,结果表明,叶片质量、根质量、根肩宽、根中宽、根尖宽、绿肩、干物质含量、单株质量、叶片质量/根质量、根中宽/根长在两年间呈极显著差异,2014年和2015年前4个主成分累积贡献率分别达到80.36%和83.28%。相关性分析结果表明,根质量和单株质量均与其他性状呈极显著或显著相关;而干物质含量除了与叶片质量/根质量呈极显著正相关外,与根质量、根肩宽、根中宽、根尖宽、单株质量、根中宽/根长均呈极显著或显著负相关。基因型分析与聚类结果表明Ws染色体被随机导入了Af中。 孙婷婷 曹文姬 欧承刚 刘波 赵志伟 庄飞云关键词:胡萝卜 青花菜雄性不育系留种植株整枝方式对开花结实的影响 被引量:4 2015年 以青花菜(Brassica oleracea var.italica)显性细胞核雄性不育系‘DGMS8554’和细胞质雄性不育系‘CMS8554’为试材,研究不同整枝方式对两类不育系留种植株开花结实特性的影响。结果表明:‘DGMS8554’的显球、开花和结荚时间较‘CMS8554’分别早4~5 d、3~4 d和3~6 d,授粉后7~9 d显荚,从结荚到种子褐变45~47 d,由褐变到收获9~11 d;‘DGMS8554’和‘CMS8554’的最佳处理方式分别为主花球上留3个侧球和4个侧球。‘DGMS8554’去除主花球后产生的侧花球能正常开花结实,花期较不去主花球植株晚10~14 d,种子收获期晚10~13 d,显球7 d后去除主花球的种株的单株产籽量和发芽率最大,分别为8.11 g和97.32%,为最优处理;‘CMS8554’去除主花球后产生的侧枝不能正常开花结实。 舒金帅 刘玉梅 李占省 张黎黎 方智远 杨丽梅 庄木 张扬勇 孙培田关键词:青花菜 整枝方式 开花结实特性 我国蔬菜种质资源工作70年回顾与展望 被引量:10 2019年 蔬菜以其独特的营养价值一直是我国人民日常生活中不可替代的副食晶。据2018年农业部统计,我国蔬菜(不含瓜果类)的总播种面积为2233万hm^2,总产量达7.98亿t,总产值已超过2万亿元,在国内农产品中排列第一,名列世界蔬菜产业之首。蔬菜产业已经成为我国农业增效、农民增收、农村发展的支柱产业,在提高人民生活水平和发展国民经济中具有十分重要的作用。然而,在蔬菜生产蓬勃发展的过程中,随着人口的增长和城市化,以及工农业的发展,人类赖以生存的生态环境已被悄然改变,农业自然资源遭到严重破坏。到20世纪50年代,我国主要蔬菜作物的地方品种、野生种及其野生近缘种逐渐消失;70年代后期以来,以少数骨干亲本为材料的几种主要蔬菜高产杂交品种逐渐占据了蔬菜生产和供给的绝大部分,在推动蔬菜生产总量跨越式发展的同时,蔬菜生产结构逐渐显现不合理,可持续发展问题日渐突出。当现代蔬菜产业发展到21世纪20年代的前夕,回望蔬菜种质资源研究工作的发展历程,期望以史为鉴知更替。为此,本期业界观察特邀中国农业科学院蔬菜花卉研究所李锡香研究员就新中国成立后蔬菜种质资源发展70年进行回顾、梳理和展望,以期与更多的相关工作者共同思考、讨论。 阳文龙 李锡香关键词:农业自然资源 国内农产品 蔬菜产业 蔬菜作物 瓜果类 野生近缘种 萝卜叶片干枯基因的定位 被引量:2 2015年 萝卜叶片过早干枯影响植株生长和肉质根的形成,限制萝卜高产潜力的发挥。研究萝卜叶片干枯性状的遗传规律及定位相关基因,对于探索萝卜叶片干枯的发生机理及其调控机制具有重要意义。以萝卜自交系‘pp12Q-4-2’和‘36-2’为亲本构建F2分离群体,对其叶片干枯性状进行调查和遗传分析,同时观测叶片干枯对肉质根根粗和质量的影响。采用BSA法,利用基于萝卜全基因组测序开发的SSR引物对叶片干枯基因进行初定位,对初定位区域采用标记逐步加密的策略得到最终定位结果,并进行遗传图谱构建。研究结果表明:萝卜叶片过早干枯的植株叶绿素含量下降、肉质根生长发育受阻;叶片干枯性状符合质量性状的遗传特点,由隐性单基因控制,正常叶片对干枯叶片表现为显性;通过基因定位,最终将控制叶片干枯的基因定位于萝卜第7号染色体的scaffold89_21520和scaffold89_21545两标记之间,它们之间的遗传距离为0.8 c M,物理距离为211.63 kb,该区域包括43个候选基因。 孙玉燕 邱杨 段蒙蒙 陈晓华 段韫丹 吕美洁 杨好慧 李锡香关键词:萝卜 SSR标记 基因定位 蔬菜变态根茎发育的分子机理研究进展 被引量:15 2015年 变态根茎是许多蔬菜作物重要的产品器官。阐明变态根茎的形成不仅是植物发育生物学研究的重要内容,也是提高相关蔬菜作物产量和品质的重要保障。近年来,关于蔬菜变态根茎形成机理的研究已经取得了重要进展。本文主要以代表性根茎类蔬菜作物萝卜、芜菁、马铃薯、莲藕、榨菜、山药、芋艿为对象,就其变态根茎发育的遗传和分子机理,包括变态根茎发育相关性状的遗传及QTL定位,形态建成的物质和能量代谢,细胞周期及细胞膨大,植物激素、光周期、转录因子等调控机制的研究进展进行了综述。蔬菜变态根茎发育相关性状多为寡基因或多基因控制的数量性状。目前,一系列发育相关性状的QTL位点被鉴定,一些重要性状的连锁标记被开发。作为形态建成物质的淀粉、糖类和蛋白质为变态根茎的发育提供重要的物质、能量和营养来源,诸多基因参与形态建成物质的代谢。细胞周期作为细胞分裂的调节器,决定细胞数目。细胞周期受细胞周期蛋白(cyclins,CYC)、细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent protein kinases,CDKs)以及转录因子RB/E2F的调控。细胞膨大决定细胞大小,受扩展蛋白(expansin,EXP)和木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolases,XTHs)等重要因子调节。植物激素是变态根茎发育的基础调控因子,诸多激素如赤霉素、生长素、脱落酸、细胞分裂素和茉莉酸等参与变态根茎的发育。光周期调控是变态根茎发育的动态信号,大量参与光周期调控的基因,如光敏色素、CONSTANS(CO)、FLOWERING LOCUS T(FT)、APY等在变态根茎形成过程中都起到重要的调控作用。此外,MADS-box、ABF/AREB和homeobox等转录因子也在变态根茎的发育中扮演重要角色。另外,文章就小RNA、表观遗传学、转录组学、蛋白质组学、比较基因组学、全基因组测序和关联分析的研究在变� 孙玉燕 李锡香关键词:蔬菜 发育 分子机理 UPLC-MS/MS快速测定甘蓝类蔬菜中活性成分莱菔硫烷 被引量:2 2015年 [目的]为了建立快速测定甘蓝类蔬菜(甘蓝、青花菜、芥蓝、苤蓝)中莱菔硫烷活性成分的方法。[方法]采用超高效液相色谱-串联质谱UPLC-MS/MS,快速测定甘蓝类蔬菜中莱菔硫烷含量。[结果]采用酶解-乙酸乙酯萃取法提取莱菔硫烷,Waters BEH反相C18(2.1 mm×50.0 mm,1.7μm)分离,质谱采用电喷雾正离子ESI(+)电离,多反应监测扫描模式(MRM)检测。在4种甘蓝类蔬菜(可食性器官)中均检测到莱菔硫烷成分,在0.1~20.0μg/L范围内线性关系良好,相关系数为0.999 4,相对标准偏差(RSD,n=6)为2.4%,检出限(LOD,S/N=3)为0.06~0.15μg/L,定量下限(LOQ,S/N=10)为0.3~0.4μg/L。[结论]该方法准确可靠,能够快速检测甘蓝类蔬菜中莱菔硫烷抗癌活性成分。 李占省 刘玉梅 方智远 杨丽梅 庄木 张扬勇 李凌云 吕红豪 孙培田关键词:超高效液相色谱-串联质谱法 甘蓝类蔬菜 抗癌成分 莱菔硫烷 胡萝卜中类胡萝卜素积累与主要合成基因转录水平相关性分析 被引量:13 2014年 以胡萝卜白色野生资源‘松滋野生’和欧洲橘色栽培品种‘Amsterdam’及其回交重组自交系(BILs)中的5个不同根色株系为试材,研究其根和叶中α–胡萝卜素、β–胡萝卜素合成途径分支点上LCYE、LCYB1、CHXE、CHXB1基因转录表达与类胡萝卜素含量之间的关系。c DNA测序结果表明,松滋野生和Amsterdam之间存在多个SNP变异位点。类胡萝卜素测定发现,Amsterdam叶中α–胡萝卜素含量(87.3μg·g-1)显著高于松滋野生(2.8μg·g-1),而其β–胡萝卜素含量(122.7μg·g-1)显著低于松滋野生(237.9μg·g-1)。q RT-PCR结果显示,LCYE、LCYB1、CHXE和CHXB1在不同材料的根和叶中均表达,其中LCYE与根中α–胡萝卜素、β–胡萝卜素及总类胡萝卜素含量之间呈显著正相关;与叶中叶黄素和总类胡萝卜素含量之间呈显著负相关,说明LCYE对类胡萝卜素积累起着关键性作用。 王慧 欧承刚 庄飞云 赵志伟 马振国关键词:胡萝卜 类胡萝卜素 转录表达 杂柑“甘平”在重庆北碚的引种表现及栽培技术 被引量:7 2017年 2012年从韩国济州引进杂柑品种"甘平"至重庆北碚试栽,连续3年进行了引种观察。该品种幼树直立生长性较强,结果后树姿开张,以有叶花序枝的着果率较高。在引种地表现出果实大、糖度高、果皮薄、易裂果的固有特征。果实11月中旬转色,翌年1月上旬成熟,可溶性固形物达15.0%。单果质量240g,果皮橙红,果肉浓橙色,肉质细嫩化渣,汁多味甜,品质优良,香气较浓,果实完全无核,混栽会产生少量种子。生产中,防裂果是难点,主要措施有选用香橙砧、适时均衡供水、增施钾肥、叶面喷施赤霉素和三十烷醇等。此外,需注意通过促放秋梢的数量来调控载果量,以提高果实整齐度和避免大小年。 江东 孙珍珠 王婷 王小柯 刘小丰 冉志林关键词:柑桔 引种 利用GBS技术研究240份宽皮柑橘的系统演化 被引量:27 2017年 【目的】GBS(genotyping-by-sequencing)是一种高效而经济的SNP(单核苷酸多态性)发掘和基因分型技术。采用GBS技术对240份宽皮柑橘进行基因分型,以阐明一些野生宽皮柑橘和地方品种的遗传背景,为其起源和演化研究提供更可靠的证据。【方法】选用国家柑橘种质重庆资源圃保存的具有广泛遗传多样性和地理起源的240份宽皮柑橘作为材料,利用Eco R I限制性内切酶消化基因组DNA后构建GBS文库;然后进行Illumina HiSeqPE150二代测序获得短读序列,通过BWA软件将序列映射到克里曼丁参考基因组上,再利用SAMTOOLS软件鉴定SNP位点。依据SNP的基因分型结果,采用邻近法构建系统演化树,并进行主成分分析。【结果】利用GBS简化基因组测序技术对240份宽皮柑橘进行测序,共获得96.3 Gb的测序数据,平均每个样本测序数据为401.26 Mb,经过测序深度为4X、Miss0.2、次要等位基因频率(MAF)>0.01的筛选条件过滤,最后共获得了114 200个高质量的SNP位点。主成分分析结果显示240份宽皮柑橘被分为4大类,其中温州蜜柑亚群、野生宽皮柑橘亚群可明显区分于其他宽皮柑橘。利用系统演化树可将240份宽皮柑橘划分到11个类群中。系统演化树和主成分分析都揭示了不同地理来源和特定形态的宽皮柑橘在遗传水平上存在明显的差异,比如来源于日本的温州蜜柑、欧美的克里曼丁橘及其杂种后代,以及中国南方的野生宽皮柑橘由于地理分布不同而形成了较为独特的类型,彼此间能够相互区分开。进化树结果表明中国南、北不同地域的宽皮柑橘可能存在不同的演化路径,南岭山脉及南方地区的野生宽皮柑橘、酸橘和目前南方地区栽培的砂糖橘存在较近的起源演化联系,而北方宽皮柑橘的演化却与宽皮柑橘中的古老地方品种存在紧密联系。人工杂交育种、长期的人工选择和驯化形成了不同类型的宽皮柑橘,同时� 王小柯 江东 孙珍珠关键词:GBS 宽皮柑橘 黄瓜抗黑星病相关基因的差异表达分析 被引量:5 2013年 以抗黑星病黄瓜材料HX1为试材,接种黑星病菌(Cladosporium cucumerinum)2 h、8 h、20 h、32 h和72 h的叶片作为试验方(Tester),相应的未接种叶片作为对照方(Driver),利用SSH技术,构建了黑星病菌侵染初期的正向和反向cDNA-SSH文库。用巢式引物PCR检测插入片段,获得了200个阳性克隆,通过测序,除去重复序列,共得到105个Unique ESTs,其中50个为singleton,55个为contings。与非冗余蛋白数据库进行BLASTx比对,结果显示,17条ESTs未找到同源序列,88条非重复序列和已知基因的同源性较高,占全部ESTs序列的83.8%,其中86条ESTs与非冗余蛋白数据库已知功能的蛋白具有高度的相似性。结合高密度点阵膜杂交差异筛选,阳性率为75.0%。经初步分析这些序列的功能,差异表达的ESTs功能涉及能量和基础代谢、信号转导、蛋白和核酸代谢、光合作用及逆境中特异表达的基因等方面,为研究黄瓜抗黑星病基因提供了依据。 李全辉 李锡香 王海平 邱杨 宋江萍 张晓辉 沈镝关键词:黄瓜 黑星病 抑制性消减杂交