国家科技重大专项(2011ZX08010-002)
- 作品数：3 被引量：11H指数：2
- 相关作者：杨建平宋梅芳孟凡华李志勇周朋更多>>
- 相关机构：中国农业科学院作物科学研究所中国农业科学院河南农业大学更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项重庆市自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 拟南芥RBCS-1A基因受光调节表达模式及其启动子遗传转化应用评价被引量：6
- 2012年
- RBCS编码光合碳同化关键酶核酮糖1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的小亚基,是控制植物光合作用的重要基因之一。本研究利用实时荧光定量PCR技术分析了拟南芥RBCS-1A受光调节的表达模式,结果表明,AtRBCS-1A表达受到光的诱导,同时具有组织表达特异性;运用生物信息学手段分析发现,该基因启动子序列中存在多个参与光应答的顺式作用元件;采用PCR技术从拟南芥基因组中分离到长度为1691bp的AtRBCS-1A启动子片段,将该片段与GUS报告基因融合构建植物表达载体并转化野生型拟南芥,对获得的转基因植株进行GUS染色,结果显示,AtRBCS-1A启动子是光诱导型和组织特异型启动子。以上结果初步证明,AtRBCS-1A启动子应用于植物遗传转化切实可行,具有重要应用价值。
- 习雨琳周朋宋梅芳李志勇孟凡华杨建平
- 关键词：拟南芥顺式作用元件
- 小麦TaPHYA基因亚家族的克隆及表达分析被引量：5
- 2012年
- 光敏色素是一类与作物农艺性状密切相关的基因家族。本研究克隆了中国春小麦光敏色素TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3基因完整的编码序列,并对它们进行了生物信息学以及转录分析。在NCBI数据库中对其推测的氨基酸序列进行BLAST分析,发现TaPHYA1和TaPHYA3氨基酸序列中包含光敏色素基因完整的功能结构域。系统进化树分析表明,小麦TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3之间进化关系相近,且与单子叶植物玉米、水稻的PHYA聚为一个亚类。另外,TaPHYA的表达丰度具有组织特异性,在茎、叶、穗中表达量分别是根中的1.35、0.34和0.87倍;而在同光质条件下,其表达丰度也具有光质特异性,TaPHYA的总表达量在黑暗和远红光条件下最高,在蓝光条件下次之,而红光和白光条件下最低。该结果为深入研究小麦光敏色素A基因亚家族的功能奠定了基础。
- 王霞马燕斌宋梅芳孟凡华李秀全杨丽吴霞杨克诚杨建平
- 关键词：小麦组织特异性
- 水稻OsPP6C基因的克隆、过表达载体构建与生物信息学分析
- 2013年
- 为克隆水稻蛋白磷酸酶6(PP6)催化亚基基因OsPP6C,并构建该基因的过表达载体以及进行生物信息学分析。采用RT-PCR技术从水稻中花11叶片cDNA中扩增OsPP6C基因全长,并构建与GUS融合的pBI121-OsPP6CGUS表达载体。通过生物信息学方法分析了OsPP6C蛋白的理化性质、与拟南芥AtPP6C(即AtFyPP)之间的同源性以及不同物种间的系统发育关系,此外,对OsPP6C基因的启动子进行了顺式作用元件分析。结果表明,该基因转录序列包含一个912 bp的开放阅读框,编码303个氨基酸残基,蛋白的分子量约为3.47 kDa,等电点为5.13;具有疏水性,但不存在信号肽,属于非分泌型蛋白。OsPP6C与拟南芥AtFyPP1和AtFyPP3氨基酸序列一致性分别为93.73%和93.40%,系统进化树显示OsPP6C与小麦TaPP6C的亲缘关系最近,而与其他物种亲缘关系相对较远。对该基因启动子中含有的顺式作用元件分析表明,该启动子中除TATA盒和CAAT盒外,还含有多种参与光应答、激素(ABA、乙烯、生长素、MeJA和赤霉素等)应答以及低温、热激和干旱等非生物胁迫因子应答的调控元件。为进一步研究水稻OsPP6C基因的表达特性和功能奠定了基础。
- 王青云王润青方聪燕侯佩苏亮李建平宋梅芳杨建平李雪梅吴大付
- 关键词：水稻生物信息学分析
