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国家重点基础研究发展计划(2005CB5234012006CB504703)
作品数:
1
被引量:6
H指数:1
相关作者:
乔延江
鲍红娟
张燕玲
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相关机构:
北京中医药大学
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发文基金:
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相关领域:
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张燕玲
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乔延江
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年份
1篇
2008
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磷酸二酯酶4抑制剂药效团模型的构建
被引量:6
2008年
目的构建磷酸二酯酶4(PDE4)抑制剂药效团模型,为中草药的相关虚拟筛选研究提供新的方法。方法以22个具有PDE4抑制活性的化合物作为训练集化合物,其半数抑制浓度(IC50)范围在0.042~23000nmol·L-1。利用Catalyst/HypoGen系统,对训练集化合物进行构象分析,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型。结合数据库搜索命中率筛选最优药效团。结果最优药效团模型包含2个氢键受体、1个脂性疏水基团和1个芳香环特征,排除体积数为6个。模型相关系数、Total cost值、Fixedcost值、Null cost值、△cost值和Configuration cost值分别为0.9047、117.7、90.84、180.4、62.7和15.71。利用所得较优模型对MDL药物数据报道数据库进行搜索,该模型的命中已知活性化合物数与命中已知活性化合物总数比值为58.95%。结论利用Catalyst系统构建的PDE4抑制剂药效团具有较好的预测能力,可作为提问结构用于数据库的搜索,有助于中草药中具有抑制PDE4活性的化合物的虚拟筛选研究。
鲍红娟
张燕玲
乔延江
关键词:
磷酸二酯酶抑制剂
药物设计
中草药
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