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国家重点基础研究发展计划(2005CB5234012006CB504703)

作品数:1 被引量:6H指数:1
相关作者:乔延江鲍红娟张燕玲更多>>
相关机构:北京中医药大学更多>>
发文基金:北京市自然科学基金国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇药物
  • 1篇药物设计
  • 1篇药效团
  • 1篇抑制剂
  • 1篇制剂
  • 1篇中草药
  • 1篇数据库
  • 1篇磷酸
  • 1篇磷酸二酯酶
  • 1篇磷酸二酯酶4...
  • 1篇磷酸二酯酶抑...
  • 1篇酶抑制剂
  • 1篇草药

机构

  • 1篇北京中医药大...

作者

  • 1篇张燕玲
  • 1篇鲍红娟
  • 1篇乔延江

传媒

  • 1篇中国医药生物...

年份

  • 1篇2008
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
磷酸二酯酶4抑制剂药效团模型的构建被引量:6
2008年
目的构建磷酸二酯酶4(PDE4)抑制剂药效团模型,为中草药的相关虚拟筛选研究提供新的方法。方法以22个具有PDE4抑制活性的化合物作为训练集化合物,其半数抑制浓度(IC50)范围在0.042~23000nmol·L-1。利用Catalyst/HypoGen系统,对训练集化合物进行构象分析,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型。结合数据库搜索命中率筛选最优药效团。结果最优药效团模型包含2个氢键受体、1个脂性疏水基团和1个芳香环特征,排除体积数为6个。模型相关系数、Total cost值、Fixedcost值、Null cost值、△cost值和Configuration cost值分别为0.9047、117.7、90.84、180.4、62.7和15.71。利用所得较优模型对MDL药物数据报道数据库进行搜索,该模型的命中已知活性化合物数与命中已知活性化合物总数比值为58.95%。结论利用Catalyst系统构建的PDE4抑制剂药效团具有较好的预测能力,可作为提问结构用于数据库的搜索,有助于中草药中具有抑制PDE4活性的化合物的虚拟筛选研究。
鲍红娟张燕玲乔延江
关键词:磷酸二酯酶抑制剂药物设计中草药数据库
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