山东省自然科学基金(2002B13)
- 作品数：3 被引量：15H指数：3
- 相关作者：张洪海马建章徐纯柱孟超更多>>
- 相关机构：曲阜师范大学东北农业大学东北林业大学更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”山东省自然科学基金山东省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 紫貂线粒体基因组全序列结构及其进化被引量：5
- 2010年
- 利用PCR方法和直接测序技术获得的紫貂线粒体基因组全长为16523bp,包含13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码基因控制区(D-Loop区),碱基组成为A32.0%、C27.6%、G14.7%、T25.8%;在编码蛋白质基因的密码子第3位点处具有AC高偏向性(72.6%),并且频繁利用不完全终止密码子T或TA(7个)。将紫貂线粒体基因组序列提交到GenBank,并获得检索号为FJ429093。结合GenBank中已公布的鼬科其他6种动物的线粒体基因组全序列及貂属6种D-Loop区部分序列,分别以虎和狗獾为外类群,应用最大简约法构建鼬科和貂属物种的系统进化树。结果表明:鼬科7个物种分成3大支系,分别为水獭亚科和臭鼬亚科群、日本貂和貂熊群以及紫貂和狗獾群,说明鼬科并非是一个单系群,紫貂与鼬科中的獾亚科亲缘关系较近,而与貂属中的美洲貂和石貂亲缘关系最近。
- 徐纯柱张洪海马建章
- 关键词：紫貂线粒体基因组进化
- 中国狼(Canis lupus chanco)线粒体全基因组序列分析被引量：8
- 2008年
- 参照近缘物种线粒体全基因组序列,设计14对特异引物,采用PCR产物直接测序法测得中国狼线粒体基因组全序列,并分析其基因组特点和各基因的定位.用pDRAW32软件,预测12种限制性酶的酶切图谱.结果表明,中国狼线粒体基因组全长16774bp,包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区.除ND2、ND3和ND5基因以ATA作为起始密码子外,其它基因的起始密码子均为ATG.除COXⅢ、ND4、ND3基因的终止密码子分别为不完全的T,T,TA;ND2,COXⅡ,Cytb基因的终止密码子分别是TAG、TAG、AGA外;其余基因均以TAA作为终止密码子,而欧亚狼和狗COXⅡ基因则以TAA终止.基于近缘哺乳动物15种近缘物种的线粒体基因组的12S rRNA和16S rRNA基因全序列,用邻近法、最大简约法和最大似然法构建系统进化树,系统进化关系与传统的系统分类基本一致.并在已有文献的基础上,探讨了中国狼的进化地位.
- 孟超张洪海陈玉才
- 关键词：线粒体基因组系统发育
- 鼬科动物线粒体DNA控制区结构分析被引量：4
- 2009年
- 利用PCR技术获得紫貂(Martes zibellina)和黄喉貂(Martes flavigula)线粒体DNA控制区全序列,并结合从GenBank中下载的9种鼬科动物相应序列,用ClustalX排序后对控制区结构进行分析,识别出延长终止序列区、中央区和保守序列区3个区域,指出了一个终止相关序列ETAS1及8个保守序列(CSB-F、E、D、C、B、1、2和3),并给出了序列通式,在CSB1和CSB2之间发现不同形式的短重复序列。此外,以狼为外类群,应用邻接法构建鼬科线粒体控制区全序列的系统进化树,结果表明:臭鼬亚科最先从鼬科中分化出来,随后剩余类群分为两大支系,即貂属种类与貂熊聚为一支,并与獾亚科的狗獾形成姐妹群;另一支为水獭亚科的物种与鼬属的林鼬形成姐妹群,再与虎鼬聚在一起,狗獾与貂属的紫貂亲缘关系最近,水獭亚科与鼬属亲缘关系最近。
- 张洪海徐纯柱马建章
- 关键词：鼬科线粒体DNA控制区系统发育
