国家自然科学基金(30571513) 作品数:13 被引量:169 H指数:8 相关作者: 杨传平 魏志刚 刘关君 刘桂丰 张凯旋 更多>> 相关机构: 东北林业大学 教育部 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 黑龙江省重点科技攻关项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
实时荧光定量分析小黑杨应拉木相关基因及转录因子的表达 2011年 利用实时定量RT-PCR技术,比较了不同时期小黑杨应拉木中与木材形成相关的基因及其转录因子的表达模式。研究结果表明,与纤维素合成相关的基因如纤维素合成酶基因(CesA)、蔗糖合成酶基因(SUSY)、ACC氧化酶基因(ACO)等基因胁迫后在弯曲茎的上侧中表达量高于其在弯曲茎的下侧中的表达;尤其是FLA基因家族在弯曲茎的上侧中大量表达,而在弯曲茎的下侧中几乎不表达。与之相反,与木质素合成相关的基因如咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)、苯丙氨酸裂解酶(PAL)、漆酶(laccase)、过氧化物酶(POD)等基因在弯曲茎的上侧中表达量低而在弯曲茎的下侧中表达量高,转录因子MYB基因在弯曲茎的上侧中表达量高于其在弯曲茎的下侧中的。 魏志刚 张凯旋 赵桂媛 刘关君 刘桂丰 杨传平关键词:实时荧光定量 小黑杨 应拉木 SMART策略构建小黑杨茎形成层全长cDNA文库 被引量:10 2010年 为了研究小黑杨木材形成过程中的关键基因,以2年生小黑杨茎形成层组织为试验材料提取RNA,采用SMART(RNA转录过程中的5′末端转换机制)技术合成cDNA第一链,通过LD-PCR合成双链cDNA。利用SfiⅠ限制性酶酶切后将其连接到质粒载体pDNR-LIB上,采用电穿孔法将重组质粒转化到大肠杆菌感受态细胞DH5α中,构建全长cDNA文库。文库质量鉴定表明:原始文库滴度为2.18×106pfu/mL,扩增后的文库滴度为5.46×109pfu/mL,重组率为96%。插入片段长度在0.5~2.0kb之间,平均长度为1.12kb,表明构建的小黑杨茎形成层cDNA文库较为理想。 赵桂媛 魏志刚 刘关君 张凯旋 刘桂丰 杨传平关键词:小黑杨 形成层 SMART CDNA文库 植物纤维素生物合成研究进展 被引量:3 2008年 综述了植物纤维素生物合成研究进展及最新研究情况,并展望了该研究的方向及趋势。 闫绍鹏 王秋玉 杨传平关键词:纤维素 纤维素合酶 木醋杆菌 白桦长纤维性状SCAR标记的分析与鉴定(英文) 被引量:1 2008年 以东北林业大学帽儿山实验林场天然白桦为研究群体,通过分析其中有代表性的100株个体的纤维长度与RAPD分子标记间相互关联性,筛选出一条与长纤维长度相关性系统为0.6144、显著性达1%水平的片段"BFLR-16",对此片段进行克隆、测序后,并将其转化成与长纤维性状相关的SCAR标记。此标记对长纤维白桦的鉴定效率高达92%,说明此SCAR标记对长纤维个体具有高度特异性,与控制纤维性状长度的基因高度连锁,它的存在与白桦纤维长度的增加有明显的相关性。图6参16。 王丹 魏志刚 杨传平 刘关君关键词:分子标记 桦树 小黑杨应拉木上下侧cDNA文库的比较分析 被引量:2 2011年 为了研究小黑杨应拉木的形成机制和相关基因的表达情况,通过模拟重力对小黑杨茎生长产生影响后,进行了以下研究:以小黑杨茎应拉木未成熟木质部组织为材料,分别构建了弯曲茎上侧(TW)与下侧(OW)cDNA文库,共获得了6048条高质量的ESTs序列,代表了5007条单一基因,鉴定出437条可能与应拉木形成有关的ESTs。通过比较TW与OW中的ESTs发现,纤维素合成相关基因、FLA等细胞壁相关蛋白基因以及MYB等转录因子均在TW中高表达,而木质素合成相关基因在OW中表达量较高。此外,一些参与信号转导和多糖代谢的基因在TW和OW中出现不同的表达模式。 张凯旋 赵桂媛 刘关君 刘桂丰 杨传平 魏志刚关键词:小黑杨 应拉木 木质部 CDNA文库 利用多元回归分析鉴定与白桦纤维长度性状相关的分子标记 被引量:10 2006年 通过对天然白桦群体583株个体纤维长度测定,选取其中有代表性的100株个体,利用随机扩增多态性DNA标记(randomamplificationpolymorphismDNA,RAPD)技术对其基因组差异分析,通过扩增条带与性状表现间的多元回归分析,筛选出与白桦纤维长度显著相关的分子标记。经过20个RAPD引物筛选,有6个引物的7个片段与纤维长度显著相关,其中片“段BFL”与纤维长度的相关系数为0.401,相关性达到5%的显著水平。对此片段进行克隆、测序后,成功转化成与长纤维性状相关的序列特征化扩增区域(sequencecharacterizedamplifiedregion,SCAR)标记,此标记对长纤维白桦的鉴定效率达80%。 魏志刚 杨传平 潘华关键词:白桦 RAPD SCAR 白桦EST-SSR信息分析与标记的开发 被引量:35 2008年 对NCBI(美国国立生物技术信息中心)中2548条欧洲白桦ESTs的序列进行分析,结果表明:其中260条ESTs中含有306个SSRs,为全部ESTs序列的10.2%,SSR频率为12.01%。其中,二核苷酸重复比例为81.37%,三核苷酸重复比例为16.67%,四核苷酸重复比例为1.96%。不同软件设计引物的效率不同,Primer3设计出176对SSR引物,在白桦中扩增成功的引物比例为59.09%,而具有多态性的引物比例仅为25.96%;SSR Primer设计出100对引物,在白桦中扩增成功的引物比例为37%,而具有多态性的引物比例为48.65%。 王艳敏 魏志刚 杨传平关键词:欧洲白桦 白桦 EST SSR 白桦核心种质初步构建 以白桦240个家系的胸径、树高、材积和纤维素含量数据为依据,采用不同的抽样比率(5%、10%和15%)、2种距离计算方法(马氏距离和欧氏距离)、8种系统聚类方法(最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法、类平均法、加权... 魏志刚 高玉池 刘桂丰 刘关君 杨传平关键词:白桦 种质资源 核心种质 文献传递 白桦AFLP体系的建立及优化 被引量:11 2007年 以不同白桦个体为材料,通过琼脂糖凝胶电泳法和聚丙烯酰胺凝胶电泳法分析了DNA提取、双酶切、连接、预扩增和选择性扩增过程中的各影响因素,建立了扩增酶切片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism)分析体系,并用E2+M4引物对不同白桦个体进行了扩增,得出优化的关键因素分别为:模板DNA的质量浓度为0.094g/L和0.086g/L,符合AFLP分析中的双酶切要求;酶切反应时间为2h15min;连接最适反应时间为2h;预扩增PCR的退火温度设为60℃。银染结果表明:扩增信号强,无背景干扰,条带清晰。 连莲 魏志刚 杨传平关键词:白桦 AFLP 白桦核心种质构建的聚类方法研究 被引量:5 2009年 以白桦240个家系的胸径、树高、材积和纤维素含量数据为依据,采用马氏距离计算家系间距离、10%的取样比例和优先取样法,研究了最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法、类平均法、加权配对算术平均法、可变法和离差平方和聚类法建构的核心种质与原种质的遗传参数、性状相关性及分布格局。结果表明,最短距离法构建白桦初级核心种质均值差异百分率、极差符合率、方差差异百分率和极差符合率分别为0、100%、75%和143%,4个性状相关性显著、相关系数均超过0.5,保持了原种质资源的空间分布格局,是构建白桦核心种质最佳方法。 魏志刚 高玉池 刘关君 杨传平 刘桂丰关键词:白桦 核心种质 聚类方法