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广东省良种培育和引进项目([2011]584[2011]143)

作品数:1 被引量:9H指数:1
相关作者:邓瑞云李武罗焕明蔡时可郑锦荣更多>>
相关机构:广东省农业科学院更多>>
发文基金:广东省社会发展科技计划项目广东省农科院院长基金广东省良种培育和引进项目更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇石斛
  • 1篇SSR
  • 1篇SSR标记

机构

  • 1篇广东省农业科...

作者

  • 1篇张蕾
  • 1篇郑希龙
  • 1篇刘晓津
  • 1篇邱道寿
  • 1篇郑锦荣
  • 1篇蔡时可
  • 1篇罗焕明
  • 1篇李武
  • 1篇邓瑞云

传媒

  • 1篇植物科学学报

年份

  • 1篇2013
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
石斛SSR标记的开发及可转移性分析被引量:9
2013年
当前已开发的石斛(Dendrobium)SSR标记仅100余对,难以满足研究的需要。为开发更多石斛分子标记,本研究通过生物信息学方法从公共核酸数据库搜索石斛SSR。结果表明,GenBank收录的3599条石斛DNA序列经拼接获得1343条Uni—DNA序列。经搜索,共检测出283个SSR,分布于205条Uni—DNA序列,平均每2815bp含一个SSR。通过序列比对,剔除86条已开发引物的SSR—DNA序列,从剩余的119条序列设计76对引物,并在石斛属32个种间进行可转移性分析,结果显示47对引物得到有效扩增,种间可转移率为51.1%N95.7%,平均为75.9%。有效扩增引物中有46对在石斛种间具多态性,检测出等位基因数2~8个,平均4.0个。选取10对多态性引物扩增60份铁皮石斛资源,每对引物检测出等位基因数2~5个,平均3.4个。根据SSR扩增带型将60份铁皮石斛资源聚为5大类,同一类型内的表型较类群间接近。对DMl21扩增产物测序表明铁皮石斛种内的SSR等位变异由SSR重复次数差异造成,而石斛种间的SSR等位变异还包含SSR位点侧翼序列的插入缺失以及替换。
邱道寿郑希龙蔡时可郑锦荣罗焕明张蕾邓瑞云李武刘晓津
关键词:石斛SSR多态性
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