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PAGE凝胶制备方法和银染方法的改进被引量：18: 2009年; PAGE凝胶分析技术已广泛运用于小分子量PCR产物的分离,但因操作环节多、耗时长,不利于大规模分子标记分析工作的开展。对PAGE凝胶的制备和银染方法作些改进,省去常规凝胶制备中亲和硅烷/剥离硅烷处理过程,以及常规银染过程中的固定和定影两步骤。与常规方法相比,该方法操作简便、耗时短、带谱的分辨率高,可代替常规方法用于SSR等标记的PCR产物的分离。; 胡建斌李静袁鸣胡深李建吾; 关键词：聚丙烯酰胺凝胶银染方法 SSR标记

黄瓜cpSSR引物的多态性与通用性被引量：1: 2010年; 从黄瓜叶绿体基因纽序列中设计15对以A或T为重复单元的微卫星引物，其中12对处于基因组非编码区，3对位于基因编码区。这15对引物在21份黄瓜材料中均有扩增产物，但只有非编码区的微卫星表现出位点多态性。每对引物可检测1～3个等位基因，平均2．0个，引物的多样性值（polymorphic information content PIC）从0至0．484，平均值0．202。15对引物在甜瓜和南瓜中均能通用，13对可在西瓜中通用。这些叶绿体引物可用于黄瓜及其近缘种的叶绿体遗传研究。; 梁芳芳李琼胡建斌李建吾; 关键词：黄瓜多态性

鸡胚不同发育阶段Twist2基因表达谱分析: ＜正＞引言Twist基因是在进化过程中的一个保守转录因子,它属于螺-环-螺（basic helix-loop-helix,bHLH）转录因子家族,可调节胚胎发育过程中的细胞重建,并赋予细胞迁移的能力。研究发现Twist基...; 邢晋祎姜运良; 关键词：鸡胚表达谱; 文献传递

黄瓜叶绿体基因组全序列微卫星分布特征与标记开发被引量：11: 2009年; 对黄瓜叶绿体基因组(chloroplast genomic DNA,cpDNA)全序列中微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)的分布特征进行了全面分析。结果发现,cpSSR主要分布在25～40kb和100～130kb两个区域,主要以完全重复和间隔重复为主。单碱基重复最多,占总数的79.3%,二碱基重复占10.1%,三碱基和三碱基以上重复仅占10.6%。单碱基重复主要以(A)n和(T)n为主,二者共占总数的78.8%,二碱基重复主要是(AT)n,占总数的9.3%。在重复次数分布上,完全重复的(A)n和(T)n均以最低重复次数为主,而间隔重复的(A)n和(T)n以14次或15次为多。设计了6对引物,对7份黄瓜自交系cpDNA进行扩增。结果发现,6对引物均有扩增产物,每对引物平均能检测到2.2个等位基因。几乎所有引物都能在甜瓜、西瓜、葫芦和栝楼中通用,5对引物在1～4种远缘种中有扩增产物。上述结果表明,从黄瓜cpDNA中发掘cpSSR标记是一条可行的途径。; 胡建斌李建吾梁芳芳刘颖; 关键词：黄瓜叶绿体基因组微卫星

多重PCR技术鉴定番茄Ty-1和Mi基因被引量：26: 2008年; 利用同一PCR反应体系,对分别与番茄(Lycopersion esculentum)抗黄化曲叶病毒(Tomato YellowLeaf Curl virus)病的Ty-1基因和番茄抗根结线虫(root-knot nematode)的Mi基因紧密连锁的SCAR标记进行同时扩增筛选,扩增的特异性片段与单引物扩增片段完全吻合。与Ty-1基因紧密连锁的SCAR1标记为共显性标记,抗感材料均产生398bp的特异片段,纯合和杂合抗病基因型存在Taq I酶切位点,酶切后分别产生了303bp和95bp以及398bp、303bp和95bp的特异性片段,而感病基因型无此酶切位点。与Mi基因紧密连锁的SCAR2标记也为共显性标记,抗感材料均产生750bp的特异片段,纯合和杂合抗病基因型存在Taq I酶切位点,酶切后分别产生了570bp和180bp以及750bp、570bp和180bp的特异性片段,而感病基因型无此酶切位点。酶切结果仍为750bp的产物。经反复验证,结果准确可靠,可以用于在同一PCR反应体系中对两个抗病基因进行同时筛选鉴定。; 于力朱龙英万延慧杨少军朱为民薛林宝; 关键词：番茄 MI 多重PCR 分子标记

甜瓜EST序列中微卫星的分布特征被引量：16: 2009年; GenBank中35547条甜瓜EST经去冗余处理后,得到总长度为250.3Mb的无冗余EST34438条。这些序列中有2813个微卫星简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR),分布于2107条EST中,出现频率为8.16%,平均分布距离为8.90kb。三核苷酸重复是主导重复类型,占SSR总数的47.14%;其次是二核苷酸和单核苷酸重复,分别占SSR总数的20.72%和16.99%。AAG/TTC是优势重复基元,占微卫星总数的29.26%,AG/CT和A/T分别占14.61%和16.25%。在所有的SSR中,重复次数为4～10次的占70.32%,长度为12～20bp的占51.12%。并对这些SSR的多态性潜能进行了评价。; 胡建斌刘颖王兰菊李建吾; 关键词：甜瓜 EST序列微卫星

不同代次猪胎儿成纤维细胞CLK1基因差异表达分析: 引言CLKs(CDC-2-like kinase homologs)激酶家族存在于包括果蝇、小鼠、人类等许多生物中,是进化上保守的双特异性激酶。而CLK1(CDC-2-like kinase 1)是CLKs激酶家族的一员...; 颉孝贤贺艳芬李加琪; 关键词：胎儿成纤维细胞实时荧光定量; 文献传递

猪E-FABP基因在不同猪种组织的差异表达: ＜正＞引言脂肪酸结合蛋白（Fatty acid-binding proteins,FABPs）是低分子（14～15 kDa）细胞溶质蛋白,能够特异地与脂肪酸结合,是细胞内运输脂肪酸的重要蛋白。目前,在哺乳动物中发现了9种...; 钟玉宜杨莉李加琪颉孝贤; 关键词：十二指肠背最长肌背膘; 文献传递

猪CAT基因克隆及在不同代次猪胎儿成纤维细胞中的表达规律: 引言过氧化氢酶(catalase,CAT)广泛存在于动物、植物和微生物体内,它以HO为底物,通过催化一对电子的转移而最终将其分解为水和氧气,是体内清除自由基的重要酶之一。测定CAT基因在不同代次猪胎儿成纤维细; 冯小曼侯海军李加琪; 关键词：胎儿成纤维细胞基因克隆生物信息学分析基因表达; 文献传递

黄瓜cpSSR-PCR反应体系优化及应用被引量：1: 2009年; 叶绿体微卫星(chloroplast microsatellite,cpSSR)是近几年发展起来的新型高效分子标记,在植物系统发育和基因漂移研究中有广泛应用。在前期开发黄瓜cpSSR引物的研究基础上,本文研究了Taq酶量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA质量和浓度、循环次数等参数对cpSSR-PCR扩增效果的影响,获得优化的反应体系,即15μL体积包括:1×Taq酶缓冲液,0.5UTaq聚合酶,0.2μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs,1.5mmol/LMgCl2,约10ng模板DNA,循环25次。采用该优化体系,以已开发的黄瓜cpSSR引物,对12份黄瓜材料进行了重复性PCR扩增。结果发现国外种质中存在3种单倍型,而在国内种质中只检测到2种单倍型,说明在本研究所用的材料中,国外种质叶绿体遗传差异明显大于国内栽培种。此结果说明优化的cpSSR反应体系具有稳定性和可靠性。; 胡建斌梁芳芳李建吾袁鸣董小结侯卫真; 关键词：黄瓜 CPSSR 单倍型

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国家高技术研究发展计划(2007AA10Z100)