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盐芥谷胱甘肽过氧化物酶基因(ThGPX6)的克隆及表达分析被引量：11: 2012年; 谷胱甘肽过氧化物酶在植物响应盐胁迫中具有重要作用。依据盐芥EST序列进行RACE实验,获得1个新的谷胱甘肽过氧化物酶基因,命名为ThGPX6(GenBank注册号为FJ357244)。该基因的cDNA全长892 bp,包含1个长为702bp的开放读码框,编码234个氨基酸。生物信息学分析表明,该蛋白具有植物GPX的典型结构,即GPX催化活性区(NVASKCGLT)和标志性基序(ILAFPCNQF),以及PHGPX特有序列(KWNF(S/T)KFL)。实时荧光定量PCR分析结果表明,ThGPX6在盐芥叶片和根中表达,其表达受NaCl诱导,显示ThGPX6在植物高盐响应中发挥作用。亚细胞定位结果表明,ThGPX6存在于线粒体和内体中的可能性最大,预示着ThGPX6在清除ROS过程中起着重要作用。; 马亭亭周宜君高飞赵竹隋欣刘楠刘冉; 关键词：盐芥基因克隆亚细胞定位

拟南芥过氧化物酶序列与功能的生物信息学分析被引量：5: 2012年; 植物过氧化物酶(POD)属于多基因家族,不仅是植物体内清除活性氧自由基的重要酶类之一,而且参与多种生理生化过程,在维系植物生长发育过程中发挥重要的作用。采用生物信息学方法对拟南芥过氧化物酶家族的73个基因编码的蛋白质序列的结构和功能进行了分析,其中包含氨基酸的数量、等电点、跨膜结构域、信号肽、二级结构组成及磷酸化位点等,并用Mega4.0软件构建了去除信号肽前后的系统进化树,旨在了解其结构特征。对已经进行功能研究的成员进行结构分析,以此来揭示结构与功能之间的联系,为植物抵御氧化胁迫方面研究提供理论基础。; 马亭亭周宜君高飞余丽刘冉刘楠隋欣; 关键词：拟南芥生物信息学分析

盐芥miRNAs耐盐表达研究: 2012年; 以盐生植物盐芥为实验材料,选择经过Solexa测序筛选的盐芥tsa-miR172a和tsa-miR398b为目标基因,采用茎环的反转录PCR(stem-loop RT-PCR)方法分析其在盐芥根中的耐盐表达模式,以探讨盐芥miRNAs的stem-loop RT-PCR验证体系。结果显示,经过300mmol.L-1 NaCl处理72h后,与对照相比,盐芥根中的tsa-miR172a上调表达,tsa-miR398b下调表达。用stem-loop RT-PCR方法进行tsa-miR172a和tsa-miR398b扩增,对其电泳图进行光密度分析结果显示,盐胁迫处理与对照的比值分别为1.8和0.55,Solexa测序结果分别为2.00和0.44,说明两种方法所得结果基本一致。表明该研究建立了盐芥miRNAs的stem-loop RT-PCR验证体系:每个miRNA设计3个引物(miRNA stem-loop引物、miRNA正向引物和miRNA通用反向引物);扩增条件为94℃2min,94℃15s,55℃45s,23个循环。; 刘冉周立敬周宜君高飞马亭亭隋欣刘楠; 关键词：盐芥 MIRNAS 盐胁迫

盐芥GRP7基因的克隆和逆境表达分析被引量：2: 2016年; 【目的】从抗逆植物盐芥中分离Gl尺P7（glycine-richRNA-bindingprotein7，GRP7）基因，为进一步揭示GRPs基因在盐芥逆境应答中的作用机制及生物学功能奠定基础。【方法】利用盐芥GRP7基因的EST序列设计特异引物，克隆GRP7基因的全长序列，对其保守结构域和系统进化树进行分析，并对TsGRP7基因的启动子区进行预测；利用qRT-PCR技术，检测GRP7基因在不同逆境胁迫、不同组织中的表达情况。【结果】TsGRP7基因编码区全长522bp，编码173个氨基酸；TsGRP7蛋白的N端第9-82位氨基酸之间有1个RNA识别基序（RRM），RRM中含有保守的RNP-1和RNP-2亚结构域；多重序列比对和系统进化树分析表明，盐芥和拟南芥亲缘关系较近；启动子序列分析表明，盐芥GRP7启动子区含有HSE热激响应元件、LTR低温应答元件等多个逆境相关的顺式作用元件，表明盐芥GRP7基因参与逆境响应。qRT-PCR分析表明，盐芥GRP7基因在不同逆境胁迫条件及不同组织中表达不同。【结论】盐芥GRP7基因参与低温、高盐、PEG等逆境响应。; 李景艳高飞周宜君王荣; 关键词：盐芥 QRT-PCR 逆境胁迫

盐芥STZ转录因子基因的克隆及序列分析: 2012年; 【目的】克隆盐芥STZ转录因子基因,对其进行序列分析,为进一步研究ThSTZ转录因子在逆境应答中的作用奠定基础。【方法】利用GenBank数据库中盐芥STZ转录因子的EST序列设计特异引物,通过3′RACE技术克隆ThSTZ基因的全长序列,应用生物信息学手段对该基因编码蛋白的结构与功能、亚细胞定位等进行预测,并对其编码氨基酸序列的同源性和系统进化进行分析。【结果】盐芥STZ转录因子基因全长717bp,编码238个氨基酸。其编码蛋白含有2个C2H2型锌指结构域,位于细胞核内,属于C2H2家族转录因子;多重序列比对和系统进化分析表明,盐芥STZ转录因子与拟南芥属植物同源蛋白的相似性最高。【结论】获得了ThSTZ转录因子基因的全长序列,为进一步探讨ThSTZ转录因子在逆境应答中的功能奠定了基础。; 王荣李晓峰高飞黄继昌周宜君; 关键词：盐芥 C2H2型锌指蛋白

盐芥叶片响应干旱胁迫的蛋白质组学初步分析被引量：4: 2012年; 盐芥是新兴起的植物非生物逆境研究模式植物,研究盐芥叶片蛋白质组对于干旱胁迫的响应,以推进对植物干旱耐受机制的认识。该研究应用双向电泳技术分析了干旱胁迫对于盐芥叶片蛋白质组的影响,结果共鉴定了63个干旱胁迫差异表达蛋白,包括丰度上调的31个,新出现的蛋白点14个,丰度下调的15个,消失的蛋白点3个。应用生物质谱分析技术确定了包括硫氧还蛋白,铁蛋白-1和凝集素在内的9个干旱胁迫响应蛋白的身份,对这些干旱胁迫响应蛋白的功能分类分析表明,盐芥的耐旱机制可能涉及自由基清除能力的增强、能量代谢的调整以及光合作用的维持。; 王荣韩旭思高飞周宜君姜双林; 关键词：盐芥蛋白质组干旱胁迫生物质谱

盐芥根蛋白双向电泳体系的建立被引量：3: 2011年; 为建立根蛋白质组双向电泳体系,对植物种植条件、蛋白提取方法I、PG干胶条的长度和pH范围、等电聚焦及SDS-PAGE参数进行探索和优化,建立了适用于盐芥(Thellungiella halophila)根蛋白质组学研究的双向凝胶电泳技术体系.; 高飞杨欣壮刘冉周宜君张桂芳张根发; 关键词：盐芥双向电泳

中国少数民族地区野生稻遗传资源的研究与利用现状: 2011年; 野生稻遗传资源是水稻育种的关键遗传材料,中国的少数民族地区分布着丰富的野生稻遗传资源。评述了野生稻遗传资源研究和利用的重要意义,从优秀种质资源的评价与鉴定、种质资源优异基因的定位和鉴定、及遗传资源多样性研究等方面综述了中国少数民族地区野生稻遗传资源的研究情况,并重点结合水稻常规育种和杂交育种,简述了中国少数民族地区野生稻遗传资源的利用情况。提出现代分子生物学技术的发展将进一步推进少数民族地区野生稻遗传资源的研究与利用工作。; 高飞韩旭思周宜君王磊沈光涛; 关键词：少数民族地区野生稻遗传资源

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国家民委科研基金(10ZY01)