四川省畜禽育种攻关项目(01NG029-18)
- 作品数：9 被引量：10H指数：2
- 相关作者：张翔宇吴登俊周明亮杨平贵王琪更多>>
- 相关机构：四川农业大学四川省畜牧科学研究院四川省草原科学研究院更多>>
- 发文基金：四川省畜禽育种攻关项目公益性行业(农业)科研专项四川省科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 对凉山半细毛羊内脏组织总RNA提取方法的研究
- 2009年
- 提取高质量的RNA是从基因表达水平上对与动物生产性状相关的遗传信息进行研究的基础和前提。本文通过对TaKaRa RNAiso Reagent法进行改进,从而获得了提取高质量凉山半细毛羊内脏组织总RNA的方法。
- 吴亚姗
- 关键词：凉山半细毛羊
- 绵羊IGFBP-3基因的克隆及序列分析被引量：1
- 2017年
- 旨在克隆IGFBP-3基因的CDS序列及其生物信息学分析,试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-3基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明:IGFBP-3基因的CDS序列为882bp,编码293个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为94%、83%、81%,氨基酸序列同源性分别为91%、77%、79%,GenBank登录号为FJ752574;IGFBP-3基因的氨基酸分子量为31.5KD,理论等电点(pI)为8.98;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与鸡、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-3基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有一个信号肽、25个磷酸化位点、7个N-糖基化位点和4个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为73.04%、13.99%、12.97%;三级结构分析显示存在IGFBP-N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。为进一步研究绵羊IGFBP-3基因的功能奠定基础。
- 周明亮杨平贵吴登俊张翔宇
- 关键词：IGFBP-3克隆基因绵羊
- 绵羊IGFBP-7基因的克隆及序列分析
- 2015年
- 试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明,凉山半细毛羊IGFBP-7基因的CDS序列为846 bp,编码282个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为99%、95%、90%,氨基酸序列同源性分别为98%、93%、89%,Gen Bank登录号为FJ589640.1;IGFBP-7基因的氨基酸分子质量为29.0 ku,理论等电点(p I)为8.25;进化分析显示其与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与斑马鱼、鲍等亲缘关系较远;IGFBP-7基因的蛋白质疏水性区域与亲水性区域间隔较为均匀分布,有1个信号肽、2个跨膜区、16个磷酸化位点、4个N-糖基化位点和1个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为64.89%、19.86%、15.25%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和Ig-like功能域。该试验为进一步研究绵羊IGFBP-7基因的功能奠定了基础。
- 周明亮杨平贵吴登俊张翔宇
- 关键词：绵羊克隆
- 绵羊IGFBP-1基因的克隆及序列分析
- 2015年
- 试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-1基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明,IGFBP-1基因的CDS序列为792 bp,编码263个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为97%、76%和74%,氨基酸序列同源性分别为97%、69%和71%,Gen Bank登录号为FJ589639.1;IGFBP-1基因的氨基酸分子量为27.8 k D,理论等电点(p I)为5.99;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与鸡、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-1基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有一个信号肽、一个跨膜区、16个磷酸化位点、6个N-糖基化位点和8个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为61.98%、24.33%、13.69%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。为进一步研究绵羊IGFBP-1基因的功能奠定基础。
- 周明亮杨平贵吴登俊张翔宇
- 关键词：克隆绵羊
- 凉山半细毛羊初生重性状分形特征分析被引量：3
- 2008年
- 首次以非线性理论中的分形理论对凉山半细毛羊的初生重数据进行分析,计算了1996～2004年间初生重性状的信息维数、关联维数、无标度区及性状测度范围。结果表明:(1)从1996～2004年凉山半细毛羊的初生重性状的信息维数都集中在0.66529～0.90675,而且无标度区较大,测度范围广。该结果说明,每年羔羊初生重信息维数都较大,群体存在十分丰富的变异,变异范围广,具有十分巨大的育种潜力;(2)相应的关联维数则集中在0.62438～0.86528之间,表明群体内个体遗传结构具有较强的相关性;(3)这两个分形维数能够分别从两个不同的角度揭示群体遗传结构的分形特征。
- 吴辉生吴登俊周明亮张翔宇
- 关键词：初生重凉山半细毛羊
- 绵羊IGF-Ⅰ基因的表达及其SNPs与生长性状的相关分析研究被引量：6
- 2013年
- 试验旨在研究IGF-I基因调控绵羊生长发育的表达模式和其SNPs位点与生长性状的相关性，采用qRT—PCR技术检测绵羊的大脑、肌肉、皮肤、肝脏和心脏组织的IGF-I基因在15、60、105、150、195和240d等6个时间点的变化，利用SSCP技术分析IGF-I基因的SNPs位点与生长性状的相关性。结果表明：5个组织在105d时出现第1个表达拐点，15～105d时肌肉、大脑和肝脏组织的表达降低后再升高，而皮肤和心脏组织在15和60d时的表达无显著差异，105d时才显著或极显著升高；105d后，肝脏组织的表达逐渐降低，肌肉、心脏、大脑和皮肤组织在195d时出现第2个拐点，但肌肉和心脏组织并未引起表达的显著差异，而大脑和皮肤组织在195d时的表达显著高于150和240d，提示IGF-I基因在5个组织的表达具有一定的同步性；IGpI基因的外显子前导区和外显子3的2个SNP位点为中低度多态性，P-1引物扩增的SNP位点与凉山半细毛羊的初生重具有显著的关联性（P〈O．05）；P-2引物扩增的SNP位点与断奶日增重和断奶重具有显著的关联性（P〈0．05）。IGF-I基因在不同的组织中表现出比较一致的表达模式，其SNP位点与绵羊的早期生长性状存在较强的相关性，为凉山半细毛羊的生长调控机理和SNPs辅助选择育种提供理论基础。
- 周明亮张翔宇綦松智王琪吴登俊杨平贵
- 关键词：凉山半细毛羊生长性状SNP
- 绵羊IGFBP-5基因的克隆及序列分析
- 2015年
- 为了克隆IGFBP-5基因的CDS序列及其生物信息学分析,试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-5基因的CDS全序列,并用生物信息学方法深入分析其序列。结果表明:IGFBP-5基因的CDS序列为816 bp,编码271个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为97%、94%、89%,氨基酸序列同源性分别为98%、98%、95%,Gen Bank登录号为EU727460.1;IGFBP-5基因的氨基酸分子质量为30.3 ku,理论等电点(p I)为8.56;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与蟾、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-5基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、22个磷酸化位点、2个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为66.42%、22.51%、11.07%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。
- 周明亮杨平贵吴登俊张翔宇
- 关键词：克隆绵羊蛋白质
- 凉山半细毛羊IGF-Ⅰ基因的表达规律研究
- 试验采用Real time PCR技术研究了IGF-Ⅰ在绵羊不同组织的各个时间点的表达。结果表明:5个组织在105 d时出现第一个表达拐点,15 d→105 d时肌肉、大脑和肝脏组织的表达降低后再升高,而皮肤和心脏组织在...
- 周明亮綦松智张翔宇王琪吴登俊杨平贵
- 关键词：凉山半细毛羊
- 文献传递
- 绵羊IGFBP-4基因的克隆及序列分析
- 2016年
- 试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-4基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明:IGFBP-4基因的CDS序列为777bp,编码258个氨基酸,与山羊、牛、人的CDS同源性分别为99%、98%、95%,氨基酸序列同源性分别为100%、98%、97%,Gen Bank登录号为EU882037.1;IGFBP-4基因的氨基酸分子量为27.9KD,理论等电点(p I)为7.10;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与鸡、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-4基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、12个磷酸化位点和2个N-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为67.44%、22.48%、10.08%;三级结构分析显示存在IGFBP-N功能域序列和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。为进一步研究绵羊IGFBP-4基因的功能奠定基础。
- 周明亮杨平贵吴登俊张翔宇
- 关键词：克隆基因绵羊
- 绵羊IGFBP-6基因的克隆及序列分析
- 2015年
- 以凉山半细毛羊为研究对象,克隆了其胰岛素样生长因子结合蛋白6基因(IGFBP-6),采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对IGFBP-6蛋白的理化性质进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,绵羊IGFBP-6基因的CDS全长序列为711 bp,编码236个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为96%、84%、74%,氨基酸序列同源性分别为95%、80%、69%;IGFBP-6蛋白大小为24.9 ku,理论等电点(p I)为8.83。遗传进化分析结果显示,绵羊IGFBP-6基因与山羊、牛等哺乳动物关系较近,与鱼类的亲缘关系较远。IGFBP-6蛋白存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、14个磷酸化位点、3个N-糖基化位点和7个O-糖基化位点;二级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠区域比例分别为77.54%、19.92%、2.54%;三级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。
- 周明亮杨平贵吴登俊张翔宇
- 关键词：绵羊克隆生物信息学
