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不结球白菜抗芜菁花叶病毒蛋白BcTuRsO的生物信息学分析被引量：3: 2010年; 采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)蛋白BcTuRsO的系统进化、理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位、所含模体及蛋白质结构进行预测和分析。系统进化树分析结果表明,该蛋白在不同物种之间具有保守性。理化性质分析结果显示该酶含194个氨基酸,分子量为21 731.3,理论等电点pI值为6.60。TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本重叠。用Target P server和WOLFPSORTserver程序预测该蛋白为细胞质蛋白。结构域分析结果显示该蛋白含多种磷酸化位点。二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。; 马景蕃侯喜林肖栋孙菲菲单晓政刘同坤; 关键词：不结球白菜生物信息学

芜菁花叶病毒侵染对不结球白菜光合及荧光特性的影响被引量：6: 2010年; 以不结球白菜矮脚黄和短白梗为试验材料,探讨芜菁花叶病毒侵染对其光合及荧光特性的影响。结果表明:感染芜菁花叶病毒后,矮脚黄叶绿素的含量、净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)、蒸腾速率(Tr)均显著降低,而短白梗各个参数下降幅度均不显著;2个品种的PSⅡ有效光化学量子产量(Fv′/Fm′)和最大光化学量子产量(Fv/Fm)降低幅度较小;矮脚黄的PSⅡ实际光化学量子产量(φPSⅡ)、表观光合电子传递速率(ETR)和光化学猝灭系数(qP)均显著降低,而短白梗则降幅较小;非光化学猝灭系数(qN)矮脚黄显著升高,而短白梗升高不明显。; 冯岩侯喜林马景蕃杨学东; 关键词：不结球白菜芜菁花叶病毒光合效率

不结球白菜BcTuRsO基因的克隆及表达: 2010年; 从不结球白菜抗病品种短白梗中克隆到一个抗芜菁花叶病毒(TuMV)相关基因,命名为BcTuRsO(Gen-Bank登录号FJ600376).该基因核苷酸序列全长650 bp,编码194个氨基酸,与已克隆的抗病基因有不同程度的同源性.系统进化树分析表明,该基因在不同物种之间具有保守性.基因组DNA杂交表明,BcTuRsO基因可能以单拷贝形式存在,其表达是组成型的.实时定量PCR检测表明,芜菁花叶病毒能够诱导不结球白菜BcTuRsO基因的转录表达,其在不结球白菜叶片中的表达特征说明它可能参与寄主对病毒的抗性.; 马景蕃侯喜林; 关键词：不结球白菜基因克隆

芜菁花叶病毒对不结球白菜内源激素含量及代谢相关基因转录水平的影响被引量：2: 2011年; 以不结球白菜感病品种‘矮脚黄’为材料,采用ELISA和Real-time PCR技术研究了芜菁花叶病毒(TuMV)侵染后不结球白菜内源生长素(IAA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)和茉莉酸(JA)的动态变化以及内源激素相关基因的表达差异。结果表明:TuMV侵染后,植株发病症状的严重程度与IAA含量呈正相关;光敏色素相关蛋白基因PAP1对IAA的合成起负调控作用。处理植株体内GA3含量及其代谢相关基因,即原表皮因子基因PDF1表达量均明显低于对照植株,而ABA含量则随着接种时间的延长不断积累,始终高于对照植株。且发病症状越严重的植株中,GA3含量越低,ABA含量越高。处理植株JA含量和JA诱导基因,即营养贮藏蛋白基因Vsp1表达量在接种后均出现2次上升,且植株病症越严重,JA含量越低。TuMV侵染后,植株中IAA/ABA和GA3/ABA的值则明显低于对照植株,表明TuMV的侵染破坏了内源激素的平衡,干扰了植物的正常生长发育。; 王淑敏侯喜林李英曹学伟张硕王枫; 关键词：不结球白菜芜菁花叶病毒茉莉酸

不结球白菜BcTuR1基因的克隆及表达被引量：1: 2009年; 从不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)品种‘短白梗’中克隆到一个抗TuMV相关基因,命名为BcTuR1(GenBank登录号FJ600374)。该基因核苷酸序列全长1 019 bp,编码162个氨基酸。BcTuR1基因与芥菜抗病毒基因相似性最高为96%,其它没有与该基因相似性高于50%的序列。基因组DNA杂交表明,BcTuR1可能属于一个较小的多基因家族。实时定量PCR检测表明,芜菁花叶病毒能够诱导不结球白菜BcTuR1基因的转录表达,其在不结球白菜叶片中的表达特征说明它可能参与寄主对病毒的抗性。; 马景蕃史公军侯喜林孙菲菲冯岩吴海涛; 关键词：不结球白菜

伞形花科5种主要蔬菜作物的核型分析被引量：3: 2010年; 采用卡宝染色压片法对伞形花科5种主要蔬菜作物进行了核型分析和比较。结果表明:芹菜的核型公式为K(2n)=2x=22=6 m+2sm+8st+6t,染色体核型为"3B"型;芫荽的核型公式为K(2n)=2x=22=2 m+2sm+18st,染色体核型为"3A"型;茴香的核型公式为K(2n)=2x=22=14 m+6sm+2st,染色体核型为"2B"型;水芹的核型公式为K(2n)=2x=22=6 m+6sm+10st,染色体核型为"3A"型;胡萝卜的核型公式为K(2n)=2x=18=6 m+10sm+2st,染色体核型为"2A"型。并对他们的亲缘关系、遗传多样性进行了探讨。; 赵冬颜志明张蜀宁李俊星刘惠吉; 关键词：核型分析芹菜芫荽水芹

不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达被引量：7: 2009年; 参照Tyl-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物，分别从10个不结球白菜（Brassica campestris ssp．chinensis）品种的全基因组中均扩增出260bp左右的目标条带。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析，DNAstar分析发现，这些序列存在高度的异质性，28个核苷酸序列变化范围为224～278bp，同源性范围为16．7％～83．0％。28条序列通过核苷酸聚类分为8个家族。推导氨基酸序列有移框突变、终止子突变或二者兼有；与已登录的不同物种同一类型逆转录酶氨基酸系统进化树分析表明，不结球白菜Tyl-copia类逆转座子与芥菜型油菜、拟南芥、芜菁、甜菜可能有共同的起源。半定量和实时定量PCR检测表明，水杨酸（salicylicacid）和Peronospora parasitica均能激活不结球白菜Tyl-copia类逆转座子，逆转座子在不结球白菜叶片中的表达特征说明它可能参与寄主对病原菌的抗性。; 肖栋侯喜林马景蕃王枫齐莉李音孜; 关键词：不结球白菜逆转录酶活性分析

不结球白菜抗芜菁花叶病毒基因的遗传分析及SSR标记被引量：8: 2012年; 为了找到与不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)基因连锁的分子标记,采用群体分离分析法(BSA法)和SSR标记进行了与抗病基因连锁标记的筛选。通过对亲本、F1、BC1和F2群体进行病毒接种,研究了试验材料对TuMV的抗性遗传模型,结果表明:不结球白菜对TuMV的抗性由显性单基因控制。通过SSR引物筛选,得到在双亲间稳定表现多态性的引物54对。用这些引物筛选抗感池,得到1个与芜菁花叶病毒抗病基因连锁的SSR标记Ra3E05,连锁距离为8.7 cM。将该标记测序,得到1条184 bp的序列,根据该序列重新设计引物,将SSR标记转化为序列特异扩展区城(SCAR)标记SCRa2,用F2群体对其验证,带型与原SSR标记表现一致,可用于分子标记辅助育种。; 彭海涛宋小明侯喜林李英; 关键词：不结球白菜分子标记

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江苏省自然科学基金(BK2008035)