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小麦种子发育过程中特异表达基因的筛选与表达分析: 从小麦授粉到种子成熟这一过程对小麦最终的产量和品质至关重要，研究小麦种子发育过程中特异表达的基因具有重要的理论意义和实际应用价值。本研究运用NCBI数据库的在线生物信息学工具DDD（digital differentia...; 杨兴露李文慧许红亮胡英考; 关键词：小麦种子发育特异表达基因生物信息学

大豆LEA基因家族全基因组鉴定、分类和表达被引量：31: 2011年; 【目的】鉴定大豆全基因组中的LEA家族基因,对其进行定位、分类以及组织表达分析,为植物LEA基因的功能研究与利用提供基础。【方法】利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定并获得大豆LEA家族基因的全序列、定位和拷贝数信息;通过序列比对进行进化和分类分析;利用大豆发育表达芯片数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。【结果】系统地分析鉴定了36个大豆的LEA家族基因,根据结构域的差异和系统发育分析将这些LEA基因分成8个亚家族。基因定位分析结果表明,这些基因分布于大豆的16条染色体上,启动子分析表明,几乎全部LEA基因的启动子区含有逆境反应顺式作用元件。各个发育阶段表达谱的分析结果表明,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有5个在种子发育时期优势表达,另外5个在其它部位优势表达。【结论】通过全基因组扫描,获得大豆基因组的36个LEA家族基因,它们分属于8个不同的亚家族,分布于16条大豆染色体上,启动子区含有逆境相关顺式作用元件,基因表达具有一定特异性。; 李乐许红亮杨兴露李雅轩胡英考; 关键词：进化分析差异表达基因

小麦牻牛儿牻牛儿基脱氢酶基因的克隆及电子定位与表达分析被引量：1: 2010年; 为更好地了解小麦维生素E的生物合成并将其应用于营养品质改良,以电子和实验克隆相结合的方法克隆分离了小麦牻牛儿牻牛儿基脱氢酶(GGH)基因的cDNA序列,序列号为DQ139268。序列分析结果表明,该cDNA序列含有一个完整的开放读码框,编码462个氨基酸,含有保守的ChlP结构域,氮端有信号肽序列,定位于叶绿体中。氨基酸序列比对和系统发育分析结果显示,不同物种之间GGH基因编码的氨基酸序列同源性都较高。用生物信息学工具将该基因定位于小麦第六部分同源群的长臂上。RT-PCR和电子组织表达分析结果显示该基因在光合器官中表达量丰富,这可能与其亚细胞定位有关。; 胡英考朱敬李雅轩蔡民华; 关键词：小麦基因克隆

综合应用在线生物信息筛选小麦种子发育特异表达基因: 从小麦授粉到种子成熟这一过程对小麦最终的产量和品质至关重要,研究小麦种子发育过程中特异表达的基因具有重要的理论意义和实际应用价值。本研究综合利用网上生物信息学工具和数据库,对小麦种子发育过程中的特异表达基因进行筛选,主要...; 杨兴露许红亮李文慧晏月明胡英考; 文献传递

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国家自然科学基金(30971783)