广东省自然科学基金(07009702)
- 作品数:3 被引量:26H指数:3
- 相关作者:陈燕红喻国辉陈远凤杨紫红程萍更多>>
- 相关机构:珠海市农业科学研究中心更多>>
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- 相关领域:生物学天文地球农业科学更多>>
- 光照、氧气、pH和盐度对沼泽红假单胞菌2-8菌株生长和亚硝酸盐消除的影响被引量:18
- 2010年
- 以1株具有亚硝酸盐消除能力的沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)2-8菌株(简称2-8菌株)为材料,研究了不同光照和氧组合、pH、盐度对菌株生长和亚硝酸盐消除能力的影响。结果发现,光照厌氧条件最利于2-8菌株的生长,该条件下菌株亚硝酸盐消除能力最强,25h消除率达(91.33±1.27)%;菌株在pH7.0时生长和亚硝酸盐消除能力最强,25h亚硝酸盐消除率达到(95.58±4.34)%,在pH9.0以上和5.0以下时基本不生长;菌株在w(NaCl)为0和0.4%的培养基中生长和亚硝酸盐消除能力最强,在w(NaCl)为0.8%~2.0%的培养基中,生长和亚硝酸盐消除能力随w(NaCl)增高而减弱。测定的4个环境因子主要通过影响菌株的生长来影响其对亚硝酸盐的消除能力。
- 陈燕红杨紫红喻国辉陈远凤
- 关键词:沼泽红假单胞菌
- 几种金属离子对沼泽红假单胞菌2-8生长和亚硝酸盐消除的影响被引量:3
- 2011年
- 在培养基中添加一定浓度金属离子,研究了不同浓度铜离子(Cu2+)、镁离子(Mg2+)、锌离子(Zn2+)、铁离子(Fe3+)和锰离子(Mn2+)对沼泽红假单胞菌(Rhodopseudom onas palustris)2-8株生长和亚硝酸盐消除能力的影响。结果发现,1×10-7mol.L-1Cu2+刺激菌株生长和亚硝酸盐消除,1×10-4mol.L-1Cu2+抑制生长和亚硝酸盐消除,1×10-6mol.L-1和1×10-5mol.L-1的Cu2+抑制生长,但刺激亚硝酸盐消除;1×10-4mol.L-1Mg2+刺激菌株生长和亚硝酸盐消除;不同浓度Zn2+对菌体生长影响不显著,但浓度为1×10-6mol.L-1和1×10-7mol.L-1时刺激亚硝酸盐消除,浓度大于1×10-6mol.L-1时抑制亚硝酸盐消除;Fe3+促进生长,浓度越高生长越好,对菌株亚硝酸盐消除的影响则刚好相反;不同浓度Mn2+均抑制菌株生长,1×10-6~1×10-3mol.L-1Mn2+抑制亚硝酸盐消除。受测定的5个金属离子中除1×10-4mol.L-1Cu2+对菌株亚硝酸盐消除能力的抑制较强外,其他离子的抑制会随时间推移逐渐消失。
- 喻国辉陈燕红程萍黎永坚杨紫红陈远凤
- 关键词:金属离子沼泽红假单胞菌
- 沼泽红假单胞菌Rhodopseudomonas palustris2-8的亚硝酸盐还原酶基因克隆和序列分析被引量:7
- 2011年
- 沼泽红假单胞菌2-8具有亚硝酸盐还原能力,根据不同类型亚硝酸盐还原酶保守序列设计引物,通过PCR扩增的方法对2-8菌株的亚硝酸盐还原酶类型进行鉴定,发现该菌株的亚硝酸盐还原酶为Cu型亚硝酸盐还原酶。从2-8菌株基因组中克隆出编码该Cu型亚硝酸盐还原酶的基因(nirK),该基因由1 154个碱基对组成,在GenBank数据库的登录号为GU332847,与沼泽红假单胞菌Rhodopseudomonas palustris TIE和CGA009的nirK序列相似性为90%。互联网数据库及生物信息学分析工具分析显示,该基因编码的由370个氨基酸残基组成的蛋白是铜型亚硝酸盐还原酶,属于一型多铜氧化酶,pI 6.2,是一种稳定蛋白,定位于膜外或周质;由α螺旋、延伸带、随机卷曲和模糊状态组成;有4个2Fe-2S氧化还原蛋白型铁硫结合结构域和一个4Fe-4S氧化还原蛋白型铁硫结合结构域。经Northern杂交分析显示nirK基因在沼泽红假单胞菌2-8中以单拷贝的形式存在并表达。
- 陈燕红程萍喻国辉潘丽晶
- 关键词:沼泽红假单胞菌基因克隆生物信息学