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国家高技术研究发展计划(973-2011AA100302)

作品数:1 被引量:10H指数:1
相关作者:高红彭静沈一飞王颖徐宁迎更多>>
相关机构:浙江大学更多>>
发文基金:转基因生物新品种培育专项国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
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  • 1篇物种
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  • 1篇基因编码
  • 1篇基因编码区
  • 1篇白质
  • 1篇编码区

机构

  • 1篇浙江大学

作者

  • 1篇徐宁迎
  • 1篇王颖
  • 1篇沈一飞
  • 1篇彭静
  • 1篇高红

传媒

  • 1篇扬州大学学报...

年份

  • 1篇2014
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
不同物种FABP3基因编码区及蛋白生物信息学分析被引量:10
2014年
利用生物信息学和比较基因组学方法对猪、小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、牛、羊、原鸡、热带爪蟾、非洲爪蟾、斑马鱼、粗尾婴猴、东非狒狒、家猫、狗、野马、普通狨等21个物种的FABP3基因编码区及蛋白质进行分析,探究该基因在种内及种间的遗传分化关系,并全面了解不同物种FABP3蛋白的理化性质、结构、功能位点等。结果表明:21个物种47条编码区共检测到210个多态位点、28种单倍型,不同物种间的核苷酸歧义度、净遗传距离和遗传分化指数的变化范围很大,FABP3基因编码区在种内及种间均存在遗传变异。FABP3蛋白为酸性蛋白,具疏水性,较稳定,是一种定位于细胞质或细胞器(除内质网和线粒体)基质中的非分泌蛋白,其二级结构主要为伊折叠、α-螺旋和自由卷曲。野猪FABP3蛋白的主要结构为10条反平行伊折叠,且有一个重复的+1拓扑结构包绕着一个配基结合位点,属于Calycin结构超家族。其功能保守区为第7~24位氨基酸,推测其主要功能为结合脂肪酸等疏水性分子或有机阴离子。
高红彭静沈一飞王颖徐宁迎
关键词:编码区蛋白质生物信息学分析
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