天津市应用基础与前沿技术研究计划(12JCYBJC33000)
- 作品数：2 被引量：5H指数：2
- 相关作者：马红武武敏李培顺陈涛赵学明更多>>
- 相关机构：天津大学中国科学院中国科学院天津工业生物技术研究所更多>>
- 发文基金：天津市应用基础与前沿技术研究计划国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于代谢网络预测菌种基因改造靶点方法的研究进展被引量：2
- 2016年
- 高产特定产品的人工细胞工厂的构建需要对野生菌株进行大量的基因工程改造,近年来随着大量基因组尺度代谢网络模型的构建,人们提出了多种基于代谢网络分析预测基因改造靶点以使某一目标化合物合成最优的方法。这些方法利用基因组尺度代谢网络模型中的反应计量关系约束和反应不可逆性约束等,通过约束优化的方法预测可使产物合成最大化的改造靶点,避免了传统的通过相关途径的直观分析确定靶点的方法的局限性和主观性,为细胞工厂的理性设计提供了新的思路。以下结合作者的实际研究经验,对这些菌种优化方法的原理、优缺点及适用性等进行详细介绍,并讨论了目前存在的主要问题和未来的研究方向,为人们针对不同目标产品选择合适的方法及预测结果的可靠性评估提供了指导。
- 李培顺马红武赵学明陈涛
- 关键词：代谢网络系统生物学代谢工程
- 基因组尺度集成细胞网络模型研究进展被引量：3
- 2014年
- 细胞网络研究是系统生物学的一个研究热点,通过结合计算机模型和实验技术,从系统角度分析复杂的生物系统,可以为生物实验提供指导和预测。近十年来,国内外许多研究团队致力于基因组规模代谢网络、基因调控网络和信号转导网络模型的构建和分析,并取得了一定成果。而不同类型网络的集成和分析是当前生物网络研究中一个新的方向,并带来了诸多新的挑战。在本文中,主要对基因组尺度集成细胞网络模型的研究进展,特别是对代谢网络和转录网络的集成进行了详细论述,着重于集成网络的构建和分析方法,最后对该领域研究前景进行了展望。
- 武敏马红武
- 关键词：集成网络
