国家自然科学基金(30700714)
- 作品数：3 被引量：41H指数：2
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- 相关机构：解放军第302医院中国人民解放军总医院北京地坛医院更多>>
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- Altered expression profiles of microRNAs in a stable hepatitis B virus-expressing cell line被引量：38
- 2009年
- 背景 MicroRNAs (miRNAs ) 是调停的 18-25 核苷酸(nt ) 的高度保存的小非编码的 RNA post-transcriptional 基因规定。肝炎 B 病毒(HBV ) 能引起尖锐或长期的肝炎 B，并且是为肝肝硬化和 hepatocellular 癌的一个高风险因素。一些哺乳动物的病毒被显示了调制表示招待细胞的 miRNAs。然而，在 HBV 之间的相互作用和主人细胞的 miRNAs 大部分是未知的。方法 miRNA microarray 和北弄污分析被用来比较稳定的表示 HBV 房间行 HepG2.2.15 和它的父母房间行 HepG2 的细胞的 miRNAs 的表示侧面。mRNA microarray 试金和人权保护的节目被用来预言 miRNA 目标。流动 cytometric 试金进一步被用来调查人的白血球的表示抗原(HLA ) A。结果十八 miRNAs 是在二房间行之间表示的差别。在他们之中，十一是起来调整的，七在 HepG2.2.15 房间是下面调整的。北弄污分析证实 miR-181a， miR-181b， miR-200b 和 miR-146a 的表示是起来调整的， miR-15a 的表示是下面调整的，它在与 microarray 分析的结果一致。而且，一些通常认为的 miRNA 目标被预言并且验证了与 mRNA 表示被连接。HLA 的 3'-UTR -- 基因为 miR-181a 和 miR-181a 力量下面调整有一个部分互补的地点 HLA 的表示 -- 一。结论 HBV 复制调制表达式招待细胞的 miRNAs，它可以在 HBV 相关的肝疾病的致病起一个作用。
- LIU YanZHAO Jian-JunWANG Chun-meiLI Mian-yangHAN PingWANG LinCHENG Yong-qianFabien ZoulimMA XuXU Dong-ping
- 关键词：基因调节
- miR-181a在转染乙型肝炎病毒基因组的HepG2.2.15细胞中的表达研究被引量：3
- 2008年
- 目的鉴定分析microRNA(miRNA)miR-181a在转染了乙型肝炎病毒(HBV)基因组的HepG2.2.15细胞中的表达情况,探讨miR-181a在与HBV相关的肝脏疾病中的作用。方法以本课题组基因芯片结果为基础,设计并合成miR-181a探针,采用Northernblotting检测miR-181a在HepG2.2.15和HepG2细胞(对照组)中的表达水平,应用生物信息学方法结合mRNA表达谱芯片结果预测miR-181a的靶基因,选取靶基因HLA-A2,应用流式细胞仪分析HLA-A2分子在上述2种细胞中的表达。结果Northernblotting结果显示,与对照组相比,miR-181a在HepG2.2.15细胞中的表达量显著增高;miR-181a可能的靶基因包括C8A、IDH1和HLA-A等,miR-181a可能通过其种子序列与其靶基因HLA-A的3′-UTR区部分互补结合来调节HLA-A的表达;流式分析也显示HLA-A2分子在HepG2.2.15细胞中的表达量(43.9%)显著低于HepG2细胞(96.6%)。结论miR-181a在HBV转染的HepG2.2.15细胞中高表达,并可能下调靶基因HLA-A的表达,推测这可能是HBV感染后病毒逃避免疫反应、持续复制的机制之一。
- 刘妍王春梅李绵洋王琳程勇前张玲霞徐东平
- 关键词：乙型肝炎病毒HLA抗原
- 钙离子调节亲环素配体及其不同剪接体的克隆及生物信息学分析
- 2008年
- 目的:克隆钙离子调节亲环素配体(CAML)及其不同剪接体,并应用生物信息学进行分析。方法:以Jurkat、HepG2细胞提取的cDNA为模板,PCR扩增CAML基因,选用pGEM-T-easy载体进行TA克隆,利用VectorNTI9.0软件与CAML基因所在染色体进行比对分析,并对CAML全长基因进行生物信息学分析。结果:CAML基因克隆成功,并证实CAML基因在细胞中存在3种剪接体,分别为缺失全长CAML cDNA序列中634~698、173~633和173~698 bp的CAML序列,大小分别为825、429和363 bp。这些剪接体的组成中均包含了CAML与其他蛋白相互结合的亲水的N末端,以及CAML发挥调节钙离子内流作用所必需的第2、3跨膜结构域,说明这些剪接体均具有发挥CAML基本功能的可能。结论:成功克隆了CAML基因,并首次证实CAML基因在细胞中存在不同剪接体。
- 程勇前成军刘妍王琳徐东平钟彦伟曲建慧赵平
- 关键词：剪接体生物信息学分析
