广东省科技计划工业攻关项目(2011B031800277)
- 作品数:5 被引量:5H指数:1
- 相关作者:黄怀球袁立燕张静钟毅赵静更多>>
- 相关机构:中山大学附属第三医院中山大学广东省皮肤性病防治中心更多>>
- 发文基金:广东省科技计划工业攻关项目广东省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 申克孢子丝菌的扫描电镜观察被引量:2
- 2012年
- 目的观察耐伊曲康唑申克孢子丝菌的超微结构特征,为申克孢子丝菌的临床鉴定提供基础资料。方法使用玻片法培养申克孢子丝菌,处理后在电镜下观察、拍照及测量。结果孢子丝菌标本图像清晰立体,可见假轴状分生孢子梗,分生孢子通常为孤立、直立生长,圆锥顶端相对,沿着菌丝轴增殖扩散,形成群集的细齿状的分生孢子链,分生孢子链较长,可弯曲。分生孢子为卵形,细长,约2.0μm×3.5μm大小,透明,表面不光滑,有不规则凹陷。结论该方法准确、可靠,可为申克孢子丝菌临床鉴定提供理论依据。
- 黄怀球袁立燕张静钟毅赵静张晓辉薛汝增李美荣陈荣章李文娟
- 关键词:申克孢子丝菌扫描电镜
- 申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白的结构分析与功能预测被引量:1
- 2012年
- 【目的】从cDNA文库中识别申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)的基因并分析预测其结构功能和应用前景。【方法】利用NCBI和ExPASy网站中的各种基因和蛋白的序列结构信息分析工具,结合DNAstar和VectorNTI suite生物信息学分析软件包,从申克孢子丝菌全长cDNA质粒文库中识别TCTP的基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白结构特征和功能。【结果】TCTP基因全长621 bp,编码区具有207个氨基酸。在GenBank同源序列中,其与蓝菌属真菌(Grosmannia clavigera)TCTP氨基酸序列一致性达到78%。理论预测分子质量为64581.4 ku。无质体和线粒体定位序列。预测结果显示编码蛋白含有1个跨膜区、7个亲水性部位和5个主要B细胞表位。与蓝菌属真菌及球毛壳霉(C.globosum)的TCTP进化关系最近。【结论】应用生物信息方法筛选出申克孢子丝菌TCTP的cDNA全长序列并预测其结构与功能、潜在抗原表位,为进一步实验研究该蛋白生物学特性提供了依据。
- 黄怀球钟毅赵静张静孙九峰张晓辉袁立燕
- 关键词:申克孢子丝菌生物信息学
- 申克孢子丝菌SPDS基因的生物信息学分析及分子克隆被引量:1
- 2013年
- [目的]分析预测申克孢子丝菌cDNA中编号为Locus_ 168_Contig_1序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征,并进行分子克隆.[方法]利用NCBI及Expasy网站提供的BLASTx、SignalIP、InterPro Scan等生物信息学软件分析其序列,判断其是否为全长编码序列、同源序列名称,并分析其结构、定位及功能等;将其中的全长编码区利用PCR方法进行扩增后克隆到pET-30a(+)载体,测序验证.[结果]该序列是亚精胺合成酶(SPDS)的同源基因,全长序列为1062 bp,包含完整的编码区190 ~1 062 bp,编码291个氨基酸,在GenBank中,其与粗糙脉孢菌的SPDS基因同源性最高,达88%.理化性质预测其编码蛋白疏水性高;无质体、线粒体等定位序列,不存在跨膜螺旋结构,为非分泌型蛋白.进化树分析结果显示与粗糙脉孢菌同源性最高;PCR扩增及测序结果证实目的基因成功克隆进入pET-30a(+)质粒.[结论]获得申克孢子丝菌SPDS的基因及蛋白结构、功能特点,构建了其重组表达质粒,将为进一步明确其在孢子丝菌病中的致病作用奠定理论基础.
- 袁立燕黄怀球张静冯佩英高文超李玉哲张晓辉黄丽林
- 关键词:申克孢子丝菌生物信息学分子克隆
- 白念珠菌与LDH抗体的交叉免疫研究被引量:1
- 2012年
- 目的识别白念珠菌苹果酸脱氢酶(Candida albicans malate dehydrogenase,CaMDH)保守表位结构。方法本研究利用生物信息学方法,预测CaMDH的结构、功能和进化关系,并选取同源序列中与CaMDH序列一致性较低的日本血吸虫乳酸脱氢酶(Schistosoma japonicum lactate dehydrogenase,SjLDH)免疫血清与白念珠菌总蛋白进行交叉免疫反应。结果发现CaMDH与常见病原生物的同源序列一致性可达43%,其中与SjLDH一致性最低(18.2%)。CaMDH具有乳酸脱氢酶保守区域,7个主要的B细胞表位,其中3处与SjLDH表位相似。苹果酸脱氢酶活化点包含于NAD(P)结合部分中。白念珠菌总蛋白与SjLDH免疫血清交叉免疫反应阳性。结论交叉免疫反应阳性提示识别结合位点为LDH/MDH同源序列高度保守的表位结构,为进一步从高度保守的抗原决定簇中筛选真菌疫苗表位、诊断特异抗体、抗真菌药物治疗靶点提供了实验基础。
- 钟毅黄怀球赵静袁立燕张静张晓辉李美荣
- 关键词:白念珠菌苹果酸脱氢酶交叉免疫
- 翻译控制肿瘤相关蛋白被引量:1
- 2013年
- 翻译控制肿瘤相关蛋白在细胞内和细胞外均起作用。它在翻译和转录水平受到胞外的各种信号调控,在肿瘤、凋亡、免疫等多个方面发挥重要作用。本文对该蛋白的结构组成、生物功能、受调控的机制等方面进行综述。
- 李文娟袁立燕黄怀球周俊杰
- 关键词:免疫肿瘤