山东省自然科学基金(Y2005D12)
- 作品数：9 被引量：10H指数：2
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- 高压诱导小蛋白Chignoli变性的分子动力学研究
- 2009年
- 在温度为300K,压强为200、1000和2000MPa时,分别对小蛋白Chignolin进行了50ns的分子动力学模拟,模拟中考虑了水的压缩性系数随压强的改变情况.结果表明,在高压下Chignolin的构象产生非常显著的变化,出现了完全去折叠.通过研究水和Chignolin之间氢键作用发现,两者之间的氢键数目变化趋势与蛋白质构象变化相一致.进一步研究还发现,压强的增大还会抑制Chignolin的去折叠;同时对高压诱导小蛋白变性的机理进行了分析.
- 于家峰王吉华
- 关键词：分子动力学模拟去折叠
- 光照时间对测量杯延迟发光的影响
- 2009年
- 用生物超微弱发光探测技术测定了荧光、X光光照不同时间后测量杯的发光现象.结果表明:荧光和X光照射均会使测量杯有明显的发光现象;随着荧光光照时间的增加,发光的衰减速度没有明显的变化;随着X光光照时间的增加,发光的衰减明显加快,发光的衰减参数明显降低.
- 王红梅
- 关键词：延迟发光荧光X光
- 在高压诱导蛋白质变性过程中水产生的压缩对它的影响被引量：3
- 2008年
- 实验表明水的压缩系数随着压强的改变会发生变化,这种改变将对高压致蛋白质变性的充分含水动力学模拟结果产生直接影响,然而很多高压变性的分子动力学模拟并没有考虑这一点.在温度为300 K,压强为200 MPa、1000 MPa时,利用GROMACS软件包对两种小蛋白Chignolin和Trpcage进行了总计300ns的分子动力学模拟,模拟中考虑了水的压缩系数随压强的改变情况,然后将模拟结果与压缩系数维持在0.1 MPa时的情况进行了比较.结果发现,压缩系数对蛋白质高压变性的影响很大,依据实验数据对不同压强的压缩系数进行调整后,小蛋白Chignolin在高压变性中出现完全去折叠.这为分子动力学模拟研究蛋白质高压变性提供了正确的途径和理论依据.
- 于家峰于家峰窦相华
- 关键词：分子动力学模拟去折叠
- 用Z曲线对禽流感病毒的简要分析
- 2007年
- 由Z曲线理论根据相应的软件绘制出禽流感病毒(Avian Influenza Virus,AIV)部分片断的Z曲线,并通过对其分析得出禽流感病毒的一些基本特征。
- 杨延玲王吉华刘辉兰
- 关键词：Z曲线碱基高致病性禽流感
- 不同宿主禽流感病毒的Z曲线分析
- 2008年
- 禽流感病毒正在全球以越来越大规模的趋势爆发,已经严重威胁人类的健康并对世界许多国家造成巨大的经济损失.基于对其现状的分析,选取2004年中国广西爆发的禽流感在不同宿主上的病毒H5N1序列,利用Z曲线理论,由相应的软件绘制出对应序列的Z曲线.通过对其简要分析得出禽流感病毒的一些特征.
- 杨延玲王吉华刘辉兰
- 关键词：禽流感Z曲线碱基
- 高压诱导小蛋白Trpcage变性的研究
- 2008年
- 在温度为300 K,压强为2000 bar、10000 bar时,对小蛋白Trpcage的去折叠过程进行了分子动力学模拟,模拟中考虑了水的压缩系数随压强改变情况.结果发现,高压会导致Trpcage变性.然后对其变性原因进行了分析.
- 于家峰窦相华
- 关键词：分子动力学模拟
- 非编码RNA的Z曲线研究
- ＜正＞DNA序列作为一种遗传语言,遗传信息不仅体现在编码序列之中,而且隐含在非编码序列之中.人们已经逐渐认识到非编码区在蛋白质翻译过程中起着非常重要的调控作用。
- 杨延玲王吉华
- 关键词：非编码区NCRNAMICRORNAZ曲线
- 文献传递
- MD模拟研究Mini-protein Chignolin去折叠过程中残基的构象熵
- 2007年
- 采用分子动力学模拟方法,对Chignolin在260 K、300 K、350 K和400 K进行去折叠模拟,计算8个残基(2—9位点)的构象熵.研究发现,构象熵值可大致分为低熵组、中熵组和高熵组.影响残基熵值的因素主要为温度、残基的原子数、残基所在位点、与邻近残基的相互作用等.还发现残基的构象熵有短时间急剧变化——阶梯跃变的现象.这意味着蛋白质的去折叠可能是不连续的.提示蛋白质的折叠过程可能也是不连续的.
- 刘贵忠于家峰
- 关键词：构象熵去折叠
- 非编码RNA的Z曲线研究
- 2009年
- DNA序列作为一种遗传语言,遗传信息不仅体现在编码序列之中,而且隐含在非编码序列之中.
- 杨延玲杨延玲
- 关键词：非编码区NCRNAMICRORNAZ曲线
- 温度胁迫对叶片超弱发光的影响被引量：7
- 2008年
- 用BPCL型微弱发光测量仪测定了不同温度和不同胁迫时间对绿宝石喜林芋叶片延迟发光的影响.结果表明:随着温度的升高,延迟发光的衰减参数先增加后减小,在15℃时有一最大值;延迟发光的最大强度也会随温度的不同而发生改变,当温度达到50℃时,叶片基本上不再具有延迟发光的特性;随35℃处理时间的延长,延迟发光的衰减逐渐加快,延迟发光的衰减参数成下降趋势;延迟发光的最大强度也会随处理时间的延长而逐渐降低.
- 杨海莲王红梅于家峰李光王吉华
- 关键词：温度叶片延迟发光
