国家高技术研究发展计划(2004AA104020)
- 作品数：5 被引量：32H指数：3
- 相关作者：张云泉袁伟李玉成张林波孙家昶更多>>
- 相关机构：中国科学院软件研究所中国科学院数学与系统科学研究院中国科学技术大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 基于消息传递的科学应用通信模式特征分析被引量：1
- 2005年
- 对Grapes,Mx3dg和TH-PaPSM三种应用程序的通信模式进行了分析.重点讨论了点对点消息的数量、大小和目的进程的分布情况,对并行应用程序中的消息局部性进行了量化研究.本研究对设计符合真实应用的测试程序、优化科学应用程序具有较好的参考价值.
- 翟季冬盛田维商海峰陈文光
- 关键词：通信模式通信特征
- 国产万亿次机群系统NPB性能测试分析被引量：15
- 2005年
- 对3个国产万亿次机群系统进行了NPB性能测试分析,重点研究大规模并行处理时(处理器数目达到上千个)的性能特点和趋势.分析了不同的处理器、互连网络等系统配置对NPB性能的影响,发现NPB的8个程序在3个万亿次机器上的性能特点和表现并不一致,表明国产高性能机群在设计上正在逐渐走出同质化的趋势,向多样化发展.进一步分析表明,目前NPB程序的可扩展性可以达到几百个处理器,但尚不能达到上千个处理器,NPB程序能发挥出的系统峰值的百分比仍然徘徊在10%左右,机群系统的并行可扩展性和应用程序对机器运算潜能的利用还需要进一步提高.对于处理器数目达到上千个的万亿次机群系统来说,对集合通信和细粒度通信能力的支持亟需提高.
- 袁伟张云泉孙家昶李玉成
- 关键词：性能评测NPB
- 一种新的MPI Allgather算法及其在万亿次机群系统上的实现与性能分析被引量：11
- 2006年
- 给出一个新的MPIAllgather算法———邻居交换算法(neighborexchange).提出的平均逻辑通信距离的概念和计算公式,可以有效地衡量通信的局部性.通过分析,发现在4种MPIAllgather算法中,邻居交换和环算法均具有最优的通信局部性.在万亿次机群深腾6800和曙光4000A上对4个MPIAllgather算法进行的性能测试和分析结果表明,邻居交换算法的长消息通信性能最优,中长消息通信性能不稳定,短消息通信性能次于递归倍增和Bruck算法.
- 陈靖张云泉张林波袁伟
- 关键词：MPI集合通信性能评测机群
- 万亿次机群系统高性能应用软件运行现状分析被引量：4
- 2005年
- 通过调用PAPI(PerformanceApplicationProgrammingInterface)接口函数[6]对2004年3月～4月之间运行在国家应用“973”计划项目LSSC-II万亿次机群系统上部分应用程序进行了跟踪,收集到了大量宝贵的性能数据。依据这些性能数据信息,对我国当前高性能软件的运行情况给出了初步分析。分析结果表明,目前大部分应用程序性能都处于较低水平,并行程序使用处理器的数目范围一般为1～64个,处理器平均效率低于10%,平均性能低于300Mflops。
- 侯晓吻张林波张云泉
- 关键词：性能分析
- FM-index算法性能测试及并行化被引量：1
- 2005年
- 介绍了FM-index压缩查询技术,详细阐述了FM-index的工作流程,描述了实现计算字符串在压缩文本中出现次数的算法。对FM-index的源代码在Linux平台上进行了测试,从测试结果分析了使用FM-index进行压缩查询的优点和不足。最后给出了加快FM-index压缩速度的一个并行化算法的初步设计思路。
- 张广治张云泉李伟华李玉成
- 关键词：后缀数组
