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核酸分析方法在土壤微生物多样性研究中的应用被引量：10: 2009年; 土壤微生物多样性一般包括微生物分类群的多样性、遗传(基因)多样性、生态特征多样性和功能多样性。传统的分离培养方法和土壤微生物的生化研究手段具有一定的局限性,核酸分析方法为土壤微生物多样性研究注入了新活力。本文主要综述了近年来国内外研究土壤微生物多样性所采用的核酸提取方法及核酸分析方法。重点阐述了基于PCR的分子指纹技术、核酸杂交技术、基因芯片等核酸分析方法的原理、优缺点和应用。各种土壤微生物多样性研究方法的综合应用可扬长避短,起到相互补充的作用,从而能够提供更加丰富而准确的土壤微生物群落结构及种群丰度变化等方面的信息,也将成为这一领域今后的发展趋势。; 钟文辉王薇林先贵尹睿申卫收; 关键词：土壤微生物多样性 PCR

报告基因技术及其在土壤质量监测中的应用被引量：7: 2009年; 报告基因包括lux、gfp、lacZ、inaZ、luc、cat、xylE及uidA等,其中土壤质量监测中最常用的报告基因有lux、gfp、lacZ和inaZ4种。从不同角度比较了土壤质量监测中最常用的上述4种报告基因,简要阐述了应用于土壤质量监测中的微生物监测报告基因的定义、类别、性质及特点,展示了报告基因表达系统的构建方式与检测方法,总结了报告基因技术在监测土壤重金属、污染物质、营养物质等化学物质以及在土壤微生物及其活动、土壤根际微生物与土壤中原生动物、植物间的相互作用等方面的应用。讨论了目前报告基因技术应用的局限性及未来研究方向和重点。; 茆婷何伟钟文辉林先贵董元华; 关键词：LUX GFP LACZ

Hg^(2+)诱导发光报告基因系统的构建及其检测红壤中残汞的研究被引量：1: 2011年; 将汞诱导型启动子PmerT和其调控基因merR与egfp基因融合构建发光报告基因系统.通过mini-Tn5系统把merR-egfp插入到Pseudomonas putida染色体DNA上,构建成为在Hg2+诱导下能特异性表达绿色荧光蛋白的工程菌,并将其应用于检测江西红壤中汞污染.当土壤中汞含量在0.04～50 mg.kg-1范围内时,采用流式细胞仪测定工程菌表达的荧光强度,发现荧光强度与汞污染的含量呈正相关,且最低检测含量为0.04 mg.kg-1.土壤背景中一定含量的Cr2+、Zn2+、Co2+、Cu2+、Pb2+、Ag+对汞污染测定均无显著影响.正交试验结果表明,孵育温度是影响荧光测定的主要因素,其最佳范围为30～35℃.将初始含量为0.1 mg.kg-1的Hg2+添加入江西红壤并孵育15和30d后,运用原子吸收和工程菌分别对残汞进行检测,结果显示工程菌对可溶性残汞、生物质残汞、有机残汞和剩余残汞均有响应,有效检出35%～64%,其有效性限与传统分析方法一致.; 何伟韩诚钟文辉林先贵; 关键词：发光汞报告基因红壤

一株好氧反硝化菌的分离鉴定及其混合应用特性研究被引量：18: 2009年; 采用溴百里酚(BTB)鉴定培养基和稀释平板法从南京市某市政污水处理厂曝气池污水样本中分离筛选得到1株好氧反硝化细菌,经16SrDNA序列同源性比较和系统发育分析初步鉴定为反硝化产碱杆菌(Alcaligenes denitrificans),并将其命名为菌株BMB-N6。研究了菌株BMB-N6在不同浓度亚硝态氮条件下的反硝化能力,运用正交试验设计探讨了该菌株最适的好氧反硝化条件,并且在实验室和大田条件下分别考察了菌株BMB-N6与蛋白质降解菌BMB-LA和氨氮脱除菌BMB-HKF复配形成的混合菌制剂的反硝化能力。结果表明,菌株BMB-N6在8h内对亚硝态氮的去除率可达94%,其最适亚硝态氮去除条件为摇床转速50r·min-1,C/N比值4,pH6,温度35℃。在实验室条件下以菌株BMB-N6为基础制成的混合菌制剂在12h内可去除90%的亚硝态氮,在大田应用中7d内可去除80%的亚硝态氮。; 何伟王薇王洁宋明良钟文辉; 关键词：好氧反硝化细菌产碱杆菌属生物脱氮水产养殖

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土壤与农业可持续发展国家重点实验室开放基金(0751010017)