国家自然科学基金(39730030)
- 作品数:24 被引量:77H指数:6
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- 相关机构:中山大学复旦大学国家人类基因组北方研究中心更多>>
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- 斜纹夜蛾核多角体病毒基因组全序列分析
- 已完成斜纹夜蛾核多角体病毒(Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)基因组全序列测定。SpltMNPV基因组全长139,341bp,碱基组成...
- 王立华胡晓晖余健秀庞义包维东李刚陈冲韩华胡松年杨焕明
- 关键词:斜纹夜蛾核多角体病毒基因组全序列
- 文献传递
- SpltNPVp49基因的克隆和序列分析被引量:12
- 2000年
- 根据新发现的杆状病毒凋亡抑制基因p4 9基因的序列设计了一对引物 ,以SpltNPV基因组DNA为模板 ,通过PCR扩增获得了预期大小的约 1 3kb的DNA片段 ,将此片段克隆到pGEM T载体上并直接测序 .序列分析表明 ,该片段为SpltNPV完整的p4 9基因开放读码框 .与已知的杆状病毒p4 9基因的序列同源性为 87% ,与之对应的氨基酸序列的同源性高达 93% .它是首次从SpltNPV中克隆到的抑制细胞凋亡的基因 .
- 李镇龙綮新张余光王章庞义
- 关键词:克隆凋亡抑制基因
- 杆状病毒糖蛋白的结构与功能被引量:7
- 2003年
- 杆状病毒是以无脊椎动物为专性寄主的多家族病毒 ,作为有效的生物杀虫剂 ,有着广泛的应用前景。它所含的糖蛋白在病毒繁殖、感染宿主的生命周期中 ,特别是在细胞识别、分泌以及在蛋白质的加工、折叠和稳定方面 ,都起着不容忽视的重要作用。不同的糖蛋白 ,不同的连接方式具有不同的功能。研究表明 ,N 聚糖的初级作用是诱导其发挥功能所必需的构象 ,杆状病毒GP6 4蛋白是一种受体细胞连接蛋白 ,也是病毒粒子端粒的成分。GP3 7糖蛋白可能在昆虫病毒复制周期中起重要作用。在研究细胞质和细胞核内的蛋白质的糖基化水平发现 ,当T淋巴细胞激活时 ,核内糖基化水平迅速增加 ,而细胞质内的蛋白质糖基化水平则降低。因此在生物合成期间 ,糖蛋白缺乏某些聚糖或阻断糖基化的某一步都会使分子在细胞内的运输受损及其功能异常。
- 李充壁刘小强庞义
- 关键词:杆状病毒糖蛋白
- 斜纹夜蛾核多角体病毒gp37及其邻近序列的克隆及分析被引量:8
- 2001年
- 从斜纹夜蛾核多角体病毒 (Spodopteralituranucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)基因组中克隆了 gp37基因 .分子生物学软件分析表明 ,在 gp37基因内部存在糖基化位点 .含有晚期表达基因的启动子序列(ATAAG) ,推测为晚期表达的病毒膜糖蛋白基因 .通过GP37蛋白的同源性比较 ,绘制了以 gp37基因为基础的杆状病毒进化树 ,发现与以多角体蛋白基因 (polyhedrin)为基础所绘制的杆状病毒分子进化树有较大差异 .以polyhedrin基因为基础绘制的杆状病毒分子进化树将家蚕核多角体病毒 (Bombyxmorinucleopolyhedrovirus,BmNPV)与杆状病毒代表种———苜蓿丫纹夜蛾核多角体病毒 (Autographacalifornicamultinucleocapsidnucleopolyhedrovirus,AcMNPV)分开 ,根据 gp37基因分析则将二者归到同一分枝 。
- 李充璧李朝飞闫庆生胡国栋庞义
- 关键词:斜纹夜蛾核多角体病毒克隆
- 斜纹夜蛾核多角体病毒DNA XbaI 4.0 kb片段锌指蛋白基因及重复序列分析
- 2001年
- 测定了斜纹夜蛾核多角体病毒 (Spodopteralituranucleopolyhedrovirus,SpltNPV)中山大学分离株基因组DNAXbaI4.0kb片段全序列 ,该片段包括一个锌指蛋白基因及三个区域的DNA重复序列 (SR1、SR2、SR3)。该锌指蛋白基因读码框为 2 196个核苷酸 ,编码 731个氨基酸的蛋白质 ,分子量为 83 .0 9kD ,该蛋白的等电点为 4.6 1。在其 5′非编码区内有一个杆状病毒早期启动子基序GAGT及一个TATA盒 ,在其终止密码的下游有 5个真核生物转录mRNA时poly(A)加尾信号AATAAA。在 2 2 3~ 2 41氨基酸残基之间有一个锌指蛋白基序 ,这一基序属于锌指蛋白基序中的C3HC4类 ,即环指 (Ringfinger)类基序。在 32 3~ 340氨基酸残基区域为一个核定位信号。该蛋白可能为一个高度折叠的蛋白质。在该片段中存在三个DNA重复序列区域 (SR1、SR2、SR3) ,其中SR1与SR3区域存在更大量的重复序列 ,SR1区域其中的一个重复序列长达 41bp ,SR1、SR3重复序列区域可能作为该病毒转录的增强子 ,或者作为DNA复制的起始点。
- 胡国栋王立华胡晓辉杨凯庞义
- 关键词:核型多角体病毒锌指蛋白基因
- 斜纹夜蛾核多角体病毒p49基因在大肠杆菌中的表达及其在昆虫细胞中的表达时相分析被引量:2
- 2004年
- 利用PCR方法从斜纹夜蛾核多角体病毒 (SpltMNPV)基因组中扩增获得了细胞凋亡抑制基因p4 9的完整ORF并将其克隆于pMD1 8 T载体 ,其序列分析结果与文献报道一致。将基因重组于硫氧还蛋白融合表达载体pThioHisC ,在大肠杆菌BL2 1 (DE3)中获得了稳定表达 ,表达的P4 9融合蛋白占菌体总蛋白 30 %左右 ,主要以包涵体形式存在。分离纯化重组表达的SpltMNPVP4 9蛋白作为抗原 ,免疫家兔制备得到效价高于 1∶1 0 0 0 0的抗重组P4 9蛋白多克隆抗体。应用制备的抗体对受SpltMNPV感染的Sl细胞中P4 9蛋白的表达时相进行分析 ,结果显示P4 9蛋白在细胞感染后 3h内便可检测到 。
- 曾美珍王瑾雯李镇龙綮新王珣章
- 关键词:SPLTMNPV凋亡抑制多克隆抗体
- 昆虫种群的一类时空动态模型研究被引量:12
- 2001年
- 昆虫种群的时空动态包括种群的数量变化和空间分布变化。根据密度制约性原理 ,F推导出描述昆虫种群时空动态的非线性偏微分方程模型。该模型由扩散、迁移、出生及死亡等成分组成。建立了模型的差分解法 ,也给出模型参数的拟合方法。模型的初始分布确定为二项分布 ,Poisson分布 ,以及负二项分布。给出产生 3种空间分布的计算方法。给定初始分布类型及参数 ,由各算法组装的计算机模型可得到初始分布 ,田间各点各时刻的昆虫数量 。
- 张文军古德祥
- 关键词:昆虫种群非线性偏微分方程空间分布型
- 小白菜生长发育的模拟模型被引量:2
- 2001年
- 以小白菜各时刻的叶、茎、根干重、鲜重、死亡量、叶面积、土壤含水量等实测数据,建立了各器官的干物质分配函数、死亡函数、以及蒸发蒸腾函数,等。同时,利用小白菜光合作用和呼吸作用的有关数据,建立了光合速率和呼吸速率函数,将各函数组装得到小白菜生长发育的微分方程模拟模型。模型以温度、光照时间、光强以及降水量为输入,可输出各时刻的叶、茎、根干重,可利用的干物质重,以及土壤含水量,耦合已建立的其它模型,还可输出单株面积,单株叶面积,单株叶鲜重及单株叶片数,给出了模拟模型与斜汶夜蛾SJNPV流行病系统的耦合方法。
- 齐艳红刘光华张文军
- 关键词:小白菜生长发育微分方程光合速率呼吸速率斜纹夜蛾
- 斜纹夜蛾核多角体病毒几丁质酶基因上游4.0kb的序列分析被引量:6
- 2001年
- 本文报道了斜纹夜蛾核多角体病毒几丁质酶基因 (chiA)上游约 4.0kb范围内的序列 ,它包括了六个读码框(ORF1~ 6 ) ,其长度分别为 15 6bp、2 97bp、5 40bp、36 9bp、12 81bp和 2 2 8bp ,可编码的氨基酸长度分别为 5 1、98、179、12 2、42 6和 75个 ,分子量分别为 6 .15kD、11.46kD、2 1.70kD、14.6 9kD、47.5 9kD和 9.0 9kD。在ORF1、ORF2、ORF3起始密码前分别有一个、二个及一个杆状病毒早期启动子基序CAGT ;在ORF4、ORF5起始密码前各有一个及二个杆状病毒晚期启动子基序TAAG。在ORF1、ORF4、ORF5终止密码下游有真核生物mRNA转录poly(A)加尾信号。ORF4为AcMNPVORF5 3、BmNPVORF42、OpMNPVORF5 6、LdMNPVORF5 4的同源基因。ORF1、ORF2、ORF6与已知的杆状病毒基因没有同源性 ,可能为三个新的基因。
- 胡国栋庞义杨凯李充璧
- 关键词:斜纹夜蛾核多角体病毒几丁质酶基因
- 斜纹夜蛾核多角体病毒基因组的hr序列分析
- 对斜纹夜蛾核多角体病毒(Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)基因组进行全序列分析,发现共存在16个非编码的同源区(homologous ...
- 胡晓晖王立华余健秀庞义包维东李刚陈冲韩华胡松年杨焕明
- 关键词:斜纹夜蛾核多角体病毒基因组
- 文献传递