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国家自然科学基金(30772291)
作品数:
3
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黄代新
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徐隆昌
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KCNQ1内含子1a中STR基因座遗传多态性及PIA分型
2009年
目的调查汉族群体KCNQ1基因内含子1a中STR基因座的遗传多态性,并采用PIA分型技术确定等位基因的亲代来源。方法用PCR-STR分型技术对230例武汉汉族无关个体样本进行KCNQ1基因内含子1a中STR基因座分型检测;同时选用两种甲基化敏感的限制酶(msRE)HhaⅠ和HpaⅡ对家系中孩子的基因组DNA进行消化后,采用PIA分型技术检测父源等位基因。结果KCNQ1内含子1a中STR基因座在汉族人群中检出10个等位基因、24种基因型,其个体识别能力(PD)、多态性信息含量(PIC)和非父排除率(PE)分别为0.852、0.66和0.484。HhaⅠ和HpaⅡ可消化个体的母源等位基因,PIA分型仅能检测出单一的父源等位基因。结论KCNQ1内含子1a中STR基因座在汉族群体具有较高的遗传多态性,PIA分型技术可以确定个体等位基因的亲代来源,具有较高的法医学应用价值。
黄代新
吴银宝
王功跃
李小廷
杨庆恩
关键词:
法医物证学
STR
DNA甲基化及其与个体年龄相关性研究
被引量:1
2011年
近年来表观遗传学研究发现,基因组DNA甲基化总体水平随年龄增加而降低,同时部分位点的甲基化水平却随年龄增加而升高。本文重点介绍了DNA甲基化与年龄的相关性及其在年龄推断方面的研究进展,旨在为法医学个体年龄推断的研究提供一种新的思路。
徐隆昌
易少华
黄代新
杨庆恩
关键词:
法医物证学
DNA甲基化
年龄推断
亚硫酸氢盐测序法DNA甲基化标记筛查技术的改进研究
被引量:1
2008年
目的改进DNA亚硫酸氢盐测序法(bisulfite genomic sequencing,BGS),建立一种简便快速的甲基化标记筛查技术。方法基因组DNA在亚硫酸氢盐处理、脱盐纯化后直接进入碱性的PCR体系,通过延长预变性时间完成修饰过程,然后进行常规亚硫酸氢盐PCR(bisulfite-PCR,BSP)扩增;首轮扩增产物再用5′端加有高GC标签序列的引物进行2次扩增,达到调整GC含量和直接测序的目的。同时用传统和改进BGS法检测3T3-L1细胞肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因和Hela细胞雄激素受体基因启动子的甲基化情况,以评估改进方案的可行性。并用Alu序列实时定量BSP技术比较传统和改进BGS法的灵敏度。结果无论是高甲基化还是低甲基化片段,改进的BGS法均可实现BSP产物的直接测序,结果与传统法一致。改进法修饰的DNA转化率达到100%,特异度〉93.75%,灵敏度显著高于传统方法(t=2.9782,P〈0.05),并有良好的重复性。结论改进后的BGS方法简单灵敏,可用于甲基化标记的快速筛查。
赵贵森
李凡
郑海燕
薛小琦
艾红伟
黄代新
关键词:
DNA甲基化
聚合酶链反应
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