中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610142011002)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 相关作者：冀颖田云龙牛静刘卫德蒋细良更多>>
- 相关机构：中国农业科学院植物保护研究所中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 哈茨木霉几丁质合酶基因ThChsC的克隆及序列分析被引量：4
- 2011年
- 【目的】克隆哈茨木霉几丁质合酶基因全序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)和染色体步移技术(genome walking)克隆几丁质合酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,对蛋白质的三维结构进行预测。【结果】从哈茨木霉(Trichoderma harzianum Th-33)中扩增得到几丁质合酶基因ThChsC(GenBank登录号HQ419000),编码区(CDS)长为2 835 bp,由4个外显子和3个内含子组成,开放阅读框(ORF)长2 688 bp,编码895个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该基因与串珠状赤霉(Gibberella moniliformis,ACY08039.1)和禾生刺盘孢菌(Colletotrichum graminicola,AAL23718.1)几丁质合酶基因相似性最高,分别为80%和81%;相应的氨基酸序列同源性均为80%,系统进化分析表明,ThChsC属于III型几丁质合酶亚家族。几丁质合酶ThChsC含有1个Chitin_synth_1结构域,1个Chitin_synth_1N结构域,1个Chitin_synth_2结构域,3个跨膜结构域,不含信号肽,为膜结合蛋白。对预测的三维结构分析表明,ThChsC含有糖基转移酶的保守DHD结构域。【结论】从哈茨木霉Th-33中克隆得到几丁质合酶基因ThChsC,对该基因的深入研究有助于探索哈茨木霉几丁质合成的机制。
- 冀颖李梅田云龙刘卫德牛静蒋细良
- 关键词：哈茨木霉基因克隆
