河北省自然科学基金(C2007000743) 作品数:7 被引量:47 H指数:5 相关作者: 刘铮铸 巩元芳 张文香 张传生 付志新 更多>> 相关机构: 河北科技师范学院 中国环境管理干部学院 济宁学院 更多>> 发文基金: 河北省自然科学基金 博士科研启动基金 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
波尔山羊与唐山奶山羊杂交三代羔羊体重和体尺的主成分分析 被引量:5 2010年 刘铮铸 巩元芳 张香斋 刘厚茹 李付春 房秀敏关键词:主成分分析 体尺性状 唐山奶山羊 羔羊 波尔山羊 体重 山羊MyoG基因启动子区序列分析与结构预测 被引量:12 2012年 为探明山羊MyoG基因的启动子序列与结构及转录调控机制,本研究设计了1对引物,采用PCR扩增、测序以及序列比对分析,从波尔山羊基因组中扩增出一段长度为969bp的山羊MyoG基因的5′侧翼序列,其GC含量为50.6%。经过生物信息学分析,确定了其转录起始位点及活性区域;发现在转录起始位点上游-24bp处存在1个TATA-box,另外还发现了1个GC-box、2个CAAT-box、2个E-box和1个富含A-T碱基的模体结构;该序列还包含HSF、ADR1和cap等转录因子结合位点。通过比对分析,所得山羊MyoG基因5′侧翼序列与牛、马鹿、人、小鼠和鸡同源序列的相似性在37.22%~96.85%之间,说明不同物种间该序列具有一定的保守性。本研究为进一步探讨山羊MyoG基因的表达和调控机制奠定了理论基础。 刘铮铸 巩元芳 张文香 付志新 张传生 宋瑜 马艳华关键词:山羊 MYOG基因 不同胎次、不同配种季节对波尔山羊及其杂交后代窝产羔数的影响 被引量:8 2012年 为了探明波尔山羊及其杂交后代的繁殖性能,利用SPSS10.0软件分析了胎次和配种季节两因素分别对45窝波尔山羊和103窝波唐杂交后代羊窝产羔数的影响。结果表明,胎次对波尔山羊和波唐杂交后代羊均产生显著或极显著的影响(P﹤0.05或P﹤0.01),波尔山羊和波唐杂交后代羊除第1胎窝产羔数较少外,其它各胎次均为高产胎次。配种季节对波尔山羊窝产羔数影响不显著(P﹥0.05),冬季配种窝产羔数最高,其次是秋季,最差是夏季;对于波唐杂交后代羊,夏季配种窝产羔数最高,其次是秋季,最差是春季,且夏季与冬季达显著差异(P﹤0.05)。 刘铮铸 付志新 任铁艳 张文香 刘谢荣 苏咏梅 任建功 巩元芳关键词:胎次 配种季节 波尔山羊 杂交后代 波尔山羊MyoG基因的鉴定和序列分析 被引量:18 2010年 为了探明山羊MyoG基因的序列结构及其对肌肉的分化调控机制,用PCR产物直接测序的方法获得了波尔山羊MyoG基因2363bp长的DNA序列,并对该序列进行了分析。结果表明,波尔山羊MyoG基因包括3个外显子、2个内含子及部分5′UTR(74bp)和3′UTR(260bp)区,编码序列长675bp,共编码224个氨基酸。结构分析表明,该序列所编码的肽链没有信号肽,第1~138个氨基酸为波尔山羊MyoG基因的bHLH结构域。通过比对分析波尔山羊与已知的GenBank中的人类及其它物种MyoG基因发现,该基因编码区核苷酸以及推测的氨基酸同源性和物种间的亲缘关系相一致,无根系统进化树的聚类结果与这些物种本身的生理特性以及传统分类学中已知的生物分类结果相一致。波尔山羊MyoG基因的鉴定及序列分析为山羊肌肉发育调控的机理以及肉质改良等的研究提供了很好的生物学基础信息。 刘铮铸 巩元芳 张传生 付志新 张文香 李付春 房秀敏关键词:波尔山羊 MYOG基因 山羊MyoG基因内含子Ⅱ变异及其在体质量上的遗传效应分析 被引量:8 2011年 旨在研究MyoG基因内含子Ⅱ多态性与波尔山羊及其级进杂交后代部分生长性状的关系。以纯种波尔山羊及波尔山羊与唐山奶山羊级进杂交一代(F1)、二代(F2)和三代(F3)为研究对象,采用测序和PCR-RFLP方法对山羊MyoG基因遗传多态性进行分析,并研究基因型对初生体质量、1月龄体质量和断奶体质量的影响。结果在MyoG基因内含子Ⅱ的1 823bp处(依据序列号:FJ607135)发现了1个SNP(C→T),且存在3种基因型(AA、AB和BB),这3种基因型在波尔山羊和波唐级进杂交后代4个群体中的分布基本一致,B等位基因为优势等位基因。通过对有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(H)、Shannons信息指数(I)和多态信息含量(PIC)等群体遗传参数的计算,发现此SNP是1个中、低多态位点。最小二乘分析结果表明,AA基因型与其它2种基因型比较有较小的初生体质量且达到显著水平(P<0.05),而对于1月龄体质量和断奶体质量,3种基因型间虽未达显著水平(P>0.05),但具AA基因型个体的表型值明显低于具其它2种基因型个体的表型值,AA、AB和BB 3种基因型在这3个生长性状的大小排列顺序均为BB>AB>AA。推测MyoG基因对山羊生长性状存在一定影响,提示选择带有B等位基因的个体有望提高山羊体质量相关的生长性状。 刘铮铸 巩元芳 付志新 张传生 张文香 宋瑜 马艳华关键词:山羊 MYOG基因 遗传多态性 波尔山羊MyoG基因的鉴定及序列分析 <正>引言MyoG基因是生肌调节因子MRFs家族的主要成员之一,该家族基因具有一个保守的碱性螺旋-环-螺旋结构(bHLH),其包括肌细胞生成素(MyoG)、生肌决定因子D(MyoD)、生肌因子5(MYF5)和生肌调节因子... 刘铮铸 巩元芳 付志新 张传生 张文香关键词:波尔山羊 MYOG基因 文献传递 山羊MyoG基因Csp6I酶切多态性分析 被引量:10 2009年 采用限制性内切核酸酶Csp6I对山羊MyoG基因的959 bp扩增产物进行PCR-RFLP多态性分析,检测到3种基因型,其酶切位点分别由2种共显性基因控制;对该片段的纯合型(AA、BB)分别测序发现,BB型在1791位点发生了T→C的突变。上述结果为首次试验证实山羊MyoG内含子二区域存在多态性。 刘铮铸 张文香 张传生 巩元芳 刘谢荣关键词:山羊 MYOG 遗传多态性 RFLP Bioinformatics Analysis on A223C Polymorphism at the 3'UTR of OLR1 Gene in Cow 2010年 [Objective] The aim was to explore the molecular mechanisms of the A223C polymorphism at 3'UTR of oxidized low density lipoprotein receptor 1(OLR1)which was closely related to milk fat percentage in cow.[Method]The putative microRNA targets located in the 3'UTR of OLR1 were predicted with the software miRanda(1.0)which could carry the microRNA database of cow.[Result]Total 16 microRNA targets were found.The A223C SNP was located in complementary region of bta-miR-370 target sequence.[Conclusion]OLR1 3'UTR A→C mutation had led to the disappearing of bta-miR-370 target,which had provided basis for the further research on the molecular mechanisms of the A223C polymorphism at 3'UTR of OLR1 gene which was closely related to milk fat percentage in cow. 张传生 耿立英 尹春光 曹顶国 刘铮铸 付志新关键词:BIOINFORMATICS MICRORNA