国家自然科学基金(30472180)
- 作品数：5 被引量：32H指数：3
- 相关作者：乔延江张燕玲鲍红娟艾路王耘更多>>
- 相关机构：北京中医药大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学化学工程更多>>
- 黄酮化合物色谱保留时间与其三维结构的关系研究被引量：3
- 2006年
- 利用比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法,结合黄酮类化合物含有较多羟基、易形成较强分子内氢键的特点,建立了黄酮类化合物色谱保留时间与其三维结构的关系模型,以探讨黄酮类化合物色谱保留时间预测的新方法。模型交叉验证相关系数q2值为0.705,非交叉验证相关系数r2为0.981,表明模型具有较好的预测能力。该研究结果对进一步开展黄酮类化合物液相色谱保留参数与三维结构关系的研究提供了思路和方法。
- 张燕玲艾路王耘乔延江
- 关键词：液相色谱
- 磷酸二酯酶4抑制剂药效团模型的构建被引量：6
- 2008年
- 目的构建磷酸二酯酶4(PDE4)抑制剂药效团模型,为中草药的相关虚拟筛选研究提供新的方法。方法以22个具有PDE4抑制活性的化合物作为训练集化合物,其半数抑制浓度(IC50)范围在0.042～23000nmol·L-1。利用Catalyst/HypoGen系统,对训练集化合物进行构象分析,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型。结合数据库搜索命中率筛选最优药效团。结果最优药效团模型包含2个氢键受体、1个脂性疏水基团和1个芳香环特征,排除体积数为6个。模型相关系数、Total cost值、Fixedcost值、Null cost值、△cost值和Configuration cost值分别为0.9047、117.7、90.84、180.4、62.7和15.71。利用所得较优模型对MDL药物数据报道数据库进行搜索,该模型的命中已知活性化合物数与命中已知活性化合物总数比值为58.95%。结论利用Catalyst系统构建的PDE4抑制剂药效团具有较好的预测能力,可作为提问结构用于数据库的搜索,有助于中草药中具有抑制PDE4活性的化合物的虚拟筛选研究。
- 鲍红娟张燕玲乔延江
- 关键词：磷酸二酯酶抑制剂药物设计中草药数据库
- 化合物毒性及三维结构参数的定量构效关系研究被引量：2
- 2006年
- 目的:建立小分子化合物毒性的三维定量构效关系模型,探索化合物毒性数据和三维结构参数之间关系的方法。方法:利用比较分子力场分析方法(CoMFA),建立了一组对发光菌有急性毒性的小分子的三维定量构效模型。结果:模型的交叉验证相关系数q2=0.731,非交叉验证相关系数r2=0.973,标准偏差SE=0.122,F=70.910。结论:该模型具有较好的预测能力,表明在甲基的邻对位减小取代基体积或电负性可以降低化合物毒性。
- 郭亦然张燕玲艾路乔延江
- HMG-CoA还原酶抑制剂三维药效团的构建被引量：18
- 2008年
- 以作用于鼠肝脏细胞的21个3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶抑制剂(RI)为训练集,训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值IC50范围在0.3-8000nmol·L-1.利用Catalyst计算HMG-CoA还原酶抑制剂最优药效团由一个氢键受体,一个氢键给体,一个疏水基团和一个芳香环特征组成.药效团模型Fixedcost值,Totalcost值和Configurationcost值分别为88.75、111.5和16.98.训练集化合物活性计算值与实测值相关系数为0.8883,偏差值为1.269,交叉验证结果表明,药效团模型具有较高的置信度,对测试集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索发现新的具有该活性的化合物,也可用于中药或天然产物药物的研究开发.
- 鲍红娟张燕玲乔延江
- 关键词：HMG-COA还原酶抑制剂数据库搜索
- 5-HT_3受体拮抗剂药效团模型的构建被引量：10
- 2008年
- 以31个来源于MDDR数据库中具有抑制鼠Bezold-Jarisch反射作用的5-HT3受体拮抗剂作为训练集化合物,构建5-HT3受体拮抗剂药效团模型.训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值ED50范围为0.05～320μg/kgi.v..利用Catalyst计算5-HT3受体拮抗剂的最优药效团由一个氢键受体、一个疏水基团、一个正电离子化基团、一个芳香环特征和6个排除体积组成;Fixedcost值、Nullcost值、Δcost值和Configurationcost值分别为112.6,172.0,59.4和7.248.训练集化合物活性的计算值与实测值相关系数为0.9031,偏差值为0.8976,基于Fischer的交叉验证结果表明药效团模型具有较高的置信度,所得药效团对训练集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索指导发现新的具有该活性的先导化合物,也可用于中药或天然产物药物研究开发.
- 鲍红娟张燕玲乔延江
- 关键词：5-HT3受体拮抗剂数据库搜索
