国家重点基础研究发展计划(2003CB515509)
- 作品数：17 被引量：57H指数：7
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- 相关机构：解放军第307医院军事医学科学院附属医院华北煤炭医学院更多>>
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- 造血干细胞移植供受体人群HLA-Cw基因遗传多态性研究被引量：7
- 2006年
- 目的调查了人类白细胞抗原(humanleucocyte antigen, HLA)Cw位点在中国汉族人群中的等位基因分布规律,为进一步研究Cw位点的遗传特征提供背景资料。方法采用序列特异性引物扩增技术对1285名无关个体进行HLA-Cw基因特异性分析,并对其分布规律进行统计学分析。结果共检测到23种HLA-Cw位点的等位基因,其中HLA-Cw*01、*03、*07、*08为主要基因型,其基因频率分别为0 .1529、0 .2385、0 .1747、0 .1004 ,并检出HLA-Cw*12、*14、*15、*16、*17等血清学方法不能鉴定的HLA-Cw基因;统计结果表明HLA-Cw位点的基因分布符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=73 .74 ,df=98 ,P>0 .5)。结论本研究结果为中国汉族人群提供了一套较为完整HLA-Cw基因遗传学参数。
- 刘金锋孙玉英金荔梁飞刘楠袁方骆媛刘曙光宋新强奚永志
- 关键词：遗传多态性汉族人群
- 人类白细胞抗原分子遗传中的基因重组被引量：11
- 2005年
- 深入研究人类白细胞抗原(humanleucocyteantigen,HLA)基因重组的分子生物学特性,对于揭示其等位基因多样性形成的演化机理以及人体所具有的抵抗多样致病微生物的防御能力具有重要意义。国外学者通过家系调查研究、统计学分析等方法估算了HLA的重组频率,证实了一些重组发生的热点,并且对重组的单倍型特异性、序列基序特异性、性别特异性等进行了深入研究。本文就HLA重组的交换频率、重组热点以及其它特性的研究现状作一综述。
- 骆媛孙玉英奚永志
- 关键词：人类白细胞抗原分子遗传基因重组同源染色体
- 一种罕见的人类白细胞抗原HLA-B/Cw座位间的基因重组被引量：7
- 2006年
- 目的探讨人类白细胞抗原复合体HLA-B/C座位间的基因重组。方法采集拟进行造血干细胞移植的一例患者(男,39岁)及其妻女的外周血标本,首先对其HLA-Ⅰ、Ⅱ类区域的5个经典基因位点进行顺序特异引物PCR(PCR-SSP)低、高分辨基因分型及SBT分析,然后再进行遗传家系分析研究,确定HLA基因重组相关位点。结果HLA高分辨基因分型的结果证实患者(AML-M5患者)的2条单倍型分别为A2402101-Cw030401/0402-B1301-DRB10406-DQB1030302/0303与A02011-Cw150201/0202-B4002-DRB11405-DQB105031;其女儿的2条单倍型分别为A02011-Cw150201/0202-B1301-DRB10406-DQB1030302/0303与A2406-Cw0602-B1302-DRB1070101/0102-DQB10202;患者配偶的2条单倍型则分别为A330301/0302-Cw030201/0202-B5801-DRB117-DQB10202与A2406-Cw0602-B1302-DRB1070101/0102-DQB10202。从遗传家系分析显示,患者的女儿所携有的父源A02011-Cw150201/0202是源自父亲的一条染色单体,而B1301-DRB10406-DQB1030302/0303则源自父亲的另一条染色单体,这表明父亲的2条染色单体在减数分裂时HLA-B和-Cw基因座位间发生了重组,即2条染色体间发生了交换,重组后的单倍型又完整地遗传给了女儿。结论首次在国际上发现并证明了一例罕见的中国汉族人群HLA-B/C基因座位间的基因重组家系,这为更深入的研究HLA重组机制奠定了坚实基础。
- 骆媛孙玉英金荔梁飞刘楠宋新强袁方刘曙光刘金锋奚永志
- 关键词：人白细胞抗原
- 我国部分省份(地区)汉族人群HLA-I类基因多态性地区差异分析被引量：7
- 2008年
- 目的探讨我国部分省份(地区)汉族人群HLA-I类经典基因座位HLA-A、HLA-B、HLA-Cw位点的群体遗传学特点及其基因频率分布的地区差异。方法选取1014例无关汉族拟行造血干细胞移植治疗患者及其健康家系供者的血液样本,提取基因组DNA后,采用序列特异性引物聚合酶链式反应(PCR-SSP)分型技术进行HLA-A、HLA-B、HLA-Cw位点基因分型,分析不同地区汉族人群及不同种族间的基因频率分布特征。基于文献报道的我国不同地区汉族人群及不同种族的HLA-I类基因频率资料,计算种群间遗传距离(D),比较不同地区汉族人群及不同种族间遗传距离差异。结果Hard-Weinberg吻合度检验表明,本研究抽样群体适于进行遗传学统计分析。HLA-A位点共检测出14种基因型,最常见的是A*02(0.330)、A*11(0.240)、A*24(0.155)、A*33(0.075);HLA-B位点共检测出27种基因型,最常见的是B*13(0.134)、B*15(0.143)、B*40(0.133)、B*46(0.102);HLA-Cw位点共检测出13种基因型,最常见的是Cw*01(0.157)、Cw*03(0.247)、Cw*07(0.181)、Cw*08(0.106)。群体汉族与其他人种间HLA-A、HLA-B基因频率差异均有统计学意义(P<0.05);除兰州汉族人群仅同南方汉族、湖南、山东、江苏、台湾汉族人群间HLA-A、HLA-B基因频率差异有统计学意义(P<0.05)外,其余各地区汉族人群间HLA-A、HLA-B基因频率差异均有统计学意义(P<0.05)。各地区汉族人群间平均遗传距离D=0.164,辽宁和北方汉族人群间遗传距离(D=0.064)最小,江苏与湖南汉族人群间遗传距离(D=0.299)最大;不同地区汉族人群间遗传距离普遍小于种族间遗传距离。结论我国不同地区汉族人群HLA-I类基因频率分布存在显著差异,但其差异要明显小于世界不同人种间的分布差异。我国汉族人群所特有的HLA-I类基因频率分布格局资料对区域性疾病的个性化治疗、遗传易感性及疾病防治等研究具有很好的理论及应用价值。
- 袁方孙玉英梁飞刘楠金荔骆媛谭刘欣奚永志
- 关键词：基因频率
- 焦磷酸测序——HLA基因高分辨分型的新策略被引量：2
- 2005年
- 刘曙光孙玉英奚永志
- 关键词：HLA基因焦磷酸测序异基因造血干细胞移植移植物抗宿主病器官移植
- 参照链介导的构象分析策略在HLA-B位点分型中的临床应用研究
- 2005年
- 目的建立并稳定HLAB位点的参照链介导的构象分析(RSCA)系统,并鉴定RSCA分型策略的优势。方法提取27例造血干细胞移植患者及63名供者的外周血DNA,采用RSCA进行HLAB位点分型,并与序列特异性引物聚合酶链反应技术(PCRSSP)分型结果进行比较,对于疑难标本采用测序鉴定。结果在90份标本中,87份(96.7%)可明确判定结果,其中有1份标本与PCRSSP结果不一致,经测序鉴定RSCA结果正确;67份(74.4%)可直接指定等位基因型别。此外,1份标本(1.1%)因PCR扩增结果太弱而未能获得RSCA分型结果,2份标本只能确定1条等位基因,经测序发现另1条等位基因为已知等位基因,但RSCA数据库中没有其数据。随机选择20份标本进行RSCA重复性实验,重复率为100%。在PCRSSP方法分型中,约有10%的标本需要重复1～3次方能判定结果。结论RSCA具有灵敏、特异、分辨率高、重复性好、可发现变异基因及新的等位基因、大规模和低成本等优点,适用于大规模的无关移植供、受者的选择。
- 赵丹丹孙玉英刘楠梁飞金荔奚永志
- 关键词：介导PCR-SSP方法序列特异性引物外周血DNA基因型别变异基因
- 中国汉族人群人类白细胞抗原HLA不同基因座位间的基因重组被引量：7
- 2007年
- 人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)复合体基因座位间的重组、重组热点、连锁不平衡与疾病易感性的关联性研究已成为免疫遗传学与人类后基因组学等研究领域的研究重点与焦点.本文报道了在中国汉族人群中发现的10例HLA复合体中的基因重组家系.采集重组家系的2～3代家庭成员的外周血标本,首先对其HLA-Ⅰ,Ⅱ类区域的5个经典基因位点进行PCR-SSP低、高分辨率基因分型及SBT分析,然后再进行遗传家系分析研究,确定HLA基因重组相关位点,并对重组家系的单体型进行了群体统计学分析.结果发现,在10例HLA重组家系中有8例重组发生在HLA-A/Cw位点之间,其中4例重组发生在A*02-Cw*03单体型中,2例重组发生在A*24-Cw*03单体型中;1例重组发生在HLA-B/DRB1位点之间,还有1例重组发生在HLA-B/Cw位点之间.群体统计学分析发现,A*02-Cw*03单体型呈一定程度的连锁不平衡但不是很强(?/δ(?)=3.0,?(r)=0.30);另有3个单体型虽呈强连锁不平衡却发生了重组事件,即A*33-Cw*03(?/δ(?)=7.22,?(r)=0.51),A*30-Cw*06(?/δ(?)=10.37,?(r)=0.93)和B*13-Cw*03(?/δ(?)=7.69,?(r)=0.38),这说明重组可能是打破旧的连锁不平衡来产生新的连锁不平衡的重要原因.本文绘制了每个重组家系成员的HLA单体型,并建立了中国汉族人群的HLA重组遗传图谱,初步定位重组发生的范围并分析了位点间重组与连锁不平衡的关系,这为更深入地研究HLA重组事件奠定了基础.
- 骆媛袁方孙玉英金荔梁飞刘楠宋新强刘曙光刘金锋王丹薛红孔繁华奚永志
- 关键词：基因重组家系研究
- HLA-A*110104新等位基因的克隆与序列分析被引量：2
- 2006年
- 目的识别并确认中国人群HLA新等位基因。方法采用基因克隆、测序及生物信息学技术,分析HLA新等位基因与HLA已知基因序列的差异。建立HLA新等位基因序列特异引物聚合酶链反应(PCR-SSP)分型方法,并对1200名HLA-A*11阳性的造血干细胞移植无关供者(包含100名HLA-A*11纯合子个体)进行HLA新等位基因筛选和频率分析。结果HLA新基因与A*110101的差异只是在外显子3区域中279位碱基发生C→T突变,导致93位密码子由CAC变为CAT,但氨基酸未发生变化,并最终被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-A*110104。该新基因出现在2个无关家系中,分别具有2～3代遗传史。在1200名无关供者中未发现其他带有新基因的个体。其基因频率为0．000 83。结论HLA-A*110104新基因具有稳定的遗传性和一定的普遍性,对无关供者的选择和人类学、遗传学等的研究具有一定意义。
- 刘曙光孙玉英骆媛刘金锋金荔梁飞袁方刘楠奚永志
- 关键词：等位基因碱基突变造血干细胞移植
- HLA-Cw位点低分辨基因分型“纯合子”的等位基因特性研究
- 2009年
- 目的研究HLA—Cw位点低分辨基因分型“纯合子”的等位基因特性，为临床移植配型提供精确资料。方法在43例血缘关系造血干细胞移植（HSCT）供受者中，对中国最常见的低分辨基因分型Cw＊03和Cw＊07的“纯合子”个体采用聚合酶链反应-序列特异性引物（PCR—SSP）高分辨基因分型方法进行等位基因定型，并采用自主研制的三维结构匹配软件系统（HLA Stnic Markversion 1.0）对其等位基因产物进行三维结构匹配，以预测不同分辨率分型结果对移植物抗宿主病（GVHD）发生的影响。结果低分辨基因分型Cw＊03、Cw＊07“纯合子”个体的高分辨基闵分型结果显尔Cw＊03及Cw＊07的纯合子分别为14％和43％，其余均为Cw＊03及Cw＊07杂合子个体。可见其低分辨基因分型易造成供受者间等位基因的错配；在有家系校正的情况下，标本的低分辨模糊结果可以通过家系遗传分析来校正定型；在无家系校正的情况下，应通过高分辨基因分型来确定等位基因，三维结构差异分析则显示这些错配有可能造成HSCT后GVHD的发生。结论当低分辨基因分型结果只出现Cw位点“纯合子”时，有家系的标本应当以家系分型结果校正定型，无家系校正的标本应当用高分辨基因分型方法进行核实，从而为临床移植提供棒确的配型报告，以防止无关供-受者HSCT后因等位基因错配而引起的严重GVHD。
- 梁飞刘楠金荔袁方刘金锋孙玉英奚永志
- 关键词：等位基因聚合酶链反应
- 次要组织相容性抗原研究进展
- 2008年
- 王红艳张庆波孙玉英奚永志
- 关键词：多态性免疫应答
