广东省自然科学基金(S2013010015459)
- 作品数：4 被引量：12H指数：2
- 相关作者：黄珂黄杰庭付涌水许茹廖峭更多>>
- 相关机构：广州血液中心南方医科大学第三附属医院广州医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金广州市医药卫生科技项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- IL-28B基因多态性与丙型肝炎自然转归的相关性研究被引量：1
- 2015年
- 目的:探讨IL-28B单核苷酸多态性与丙型肝炎病毒(HCV)感染自然转归的相关性。方法:采用Sanger基因测序法检测广州地区无偿献血人群中266名HCV感染者(107名自发清除者和159名慢性感染者)和97名健康献血者IL-28B rs12979860位点基因型和等位基因,并统计分析其在HCV感染者与健康献血者,HCV慢性感染者与健康献血者,HCV自发清除者与慢性感染者中的分布差异。结果:159名HCV慢性感染者,107名自发清除HCV者和97名健康献血者多表现为CC基因型,分别占83.6%、95.3%和86.6%,CT基因型分别占16.4%、4.7%和13.4%,未发现TT基因型。HCV感染者和健康献血者,HCV慢性感染者和健康献血者CC/CT基因型分布差异均无统计学意义(χ2=0.204,P=0.652;χ2=0.406,P=0.524),但在HCV慢性感染者和自发清除HCV者中CC/CT基因型分布差异有统计学意义(χ2=8.474,P=0.004),自发清除组中CC基因型比率高于慢性感染组,自发清除组C等位基因的频率高于慢性感染组(χ2=7.949,P=0.005)。结论:在广州献血人群中,IL-28B rs12979860基因多态性与HCV的易感性不相关,但与HCV感染的自发清除相关,表现为C等位基因有利于丙型肝炎病毒(HCV)的自发清除。
- 陈秋宇熊华平许茹王敏廖峭黄珂黄杰庭戎霞付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒基因多态性
- 机体自发清除丙型肝炎病毒和主要组织相容性复合体区域单核苷酸多态性关联的初步研究被引量：2
- 2014年
- 目的了解中国丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染人群机体自发清除HCV和主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)区域单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的关联性。方法选择96名抗-HCV阳性并成功随访1年的献血者为研究对象,分为自发清除组(HCV RNA阴性)和慢性感染组(HCV RNA阳性),采用Illumina MHC Mapping Panel试剂盒对两组人群进行MHC区域的SNPs检测,利用SPSS16.0分析软件、Matlab软件编程,采用t检验、χ2检验及分层分析等方法对各SNP位点及性别、年龄因素与HCV清除与否进行关联性分析。结果获得HCV自发清除组和慢性感染组样本分别为19份和77份。两组间年龄差异无统计学意义(t=0.610,P=0.543),HCV自发清除组中女性感染者的比例明显高于男性(χ2=17.668,P=2.63×10-5)。检测的1 293个SNPs中,rs2246626(χ2=10.777,P=0.001)、rs12386522(χ2=7.725,P=0.005)、rs2534679(χ2=7.522,P=0.006)和rs1264457(χ2=6.821,P=0.009)与HCV的自发清除显著相关。结论MHC区域共发现4个与HCV自发清除存在显著性关联的SNPs,女性发生HCV自发清除比例高于男性。该结果将为进一步研究机体自发清除HCV和MHC基因的关联奠定基础。
- 戎霞王敏黄杰庭黄珂许茹廖峭熊华平付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒主要组织相容性复合体单核苷酸多态性
- 蛋白磷酸酶1调节亚基11基因多态性与丙型肝炎病毒自发清除的相关性分析
- 2014年
- 目的 探讨蛋白磷酸酶1调节亚基11（PPP1R11）基因多态性与丙型肝炎病毒（HCV）感染自发清除的相关性.方法 选择2009年1月至2013年5月于广州血液中心行无偿献血的献血者中,血液样品HCV抗体的酶联免疫吸附试验（ELISA）检测结果呈阳性的328例献血者为研究对象.将研究对象随访结果中,HCV RNA检测结果呈阴性,但经重组免疫印迹试验（RIBA）确证为HCV抗体呈阳性献血者纳入自发清除组（n=134）;HCV RNA检测结果呈阳性献血者纳入慢性感染组（n=194）.采用序列特异性引物聚合酶链反应（PCR-SSP）检测PPP1 R11基因rs3807031位点基因型,分析其与HCV自发清除的相关性.结果 自发清除组献血者的平均年龄为（28.8±10.2）岁低于慢性感染组的（31.0±9.0）岁.二者比较,差异有统计学意义（t=2.135,P=0.034）.自发清除组中女性比例为35.8％,高于慢性感染组的21.6％.二者比较,差异有统计学意义（x2 =7.994,P=0.005）. rs3807031的等位基因A和C在自发清除组的基因频率分别为30.6％和69.4％,在慢性感染组中则为22.4％和77.6％.两组献血者rs3807031等位基因频率比较,差异有统计学意义（x2 =5.538,P=0.023）.多因素非条件logistic回归分析结果表明,性别（OR=1.957,95％CI：1.118～3.224,P=0.008）和rs3807031基因型（OR=0.650,95％CI：0.450～0.973,P=0.021）是HCV自发清除的独立影响因素.结论 PPP1R11基因rs3807031位点基因型与HCV自发清除显著相关,可作为HCV感染自发清除的预测因素,为进一步研究机体自发清除HCV的机制及分子标志物提供了科学证据.
- 黄杰庭戎霞熊华平许茹王敏黄珂廖峭付涌水
- 关键词：肝炎病毒基因型
- 广东地区临床患者和献血者HCV感染者HCV基因分型比较被引量：9
- 2014年
- 目的了解广东地区临床患者和献血者HCV基因型(亚型)分布。方法收集广东地区临床患者HCV RNA阳性标本191(人)份、无偿献血者HCV RNA阳性标本222(人)份,采用逆转录巢式PCR对HCV E1基因扩增并测序;应用MEGA5软件构建分子进化树并对其做基因分型。采用SPSS16.0软件对2组人群中不同基因亚型的分布做比较。结果共检测出HCV-1a、1b、2a、3a、3b、6a和6n等7个基因亚型,其中临床患者分别为1.05%(2/191)、66.49%(127/191)、8.90%(17/191)、2.62%(5/191)、2.62%(5/191)、17.80%(34/191)和0.52%(1/191);献血者分别为0.45%(1/222)、41.44%(92/222)、6.76%(15/222)、8.56%(19/222)、4.95%(11/222)、37.39%(83/222)和0.45%(1/222)。2组人群比较,临床患者1b的比例高于献血者(P<0.01),献血者中3a、6a的比例高于临床患者(P<0.05及P<0.01)。结论广东地区临床患者和献血者中的HCV基因亚型主要是HCV-1b和6a,但HCV-1b、3a和6a亚型在2组人群中所占的比例不同。
- 戎霞郑英熊华平许茹黄杰庭王敏黄珂廖峭付涌水
- 关键词：献血者丙型肝炎病毒基因亚型
