国家质检总局科技计划项目(2012IK223) 作品数:11 被引量:77 H指数:7 相关作者: 廖俊蕾 贾凤龙 岳巧云 聂维忠 邵柏 更多>> 相关机构: 中山大学 中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心 广东出入境检验检疫局 更多>> 发文基金: 国家质检总局科技计划项目 国家科技支撑计划 广东出入境检验检疫局科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 更多>>
双翅目昆虫线粒体基因组研究进展 被引量:6 2012年 对双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点及线粒体内的基因如蛋白质编码基因、tRNA基因、rRNA基因以及A+T富含区做了总结,包括基因的大小,碱基组成、结构特点、基因重排等。 梅琰 岳巧云 贾凤龙关键词:双翅目 线粒体基因组 新截获中国未见分布种杜比亚丽蝇形态和DNA条形码鉴定 被引量:11 2014年 目的利用DNA条形码技术鉴定外来媒介生物,提高物种鉴定的速度与准确度。方法对2013年9月在中山神湾口岸截获来自澳大利亚的丽蝇进行形态与DNA条形码鉴定,通过与澳大利亚的蝇类专家进行标本交流,进一步确认鉴定结果;并与相似种螳丽蝇进行形态与DNA条形码上的比较。结果通过形态观察与DNA条形码鉴定,所截获的丽蝇为杜比亚丽蝇;经科技查新,确认为中国未见分布种。结论 DNA条形码是传统形态分类的有力补充,对在国境卫生检验检疫工作中及时鉴定媒介生物,减少媒介生物本身及其携带病原体的扩散,减少对公共卫生的安全威胁起到重要作用。 廖俊蕾 岳巧云 邱德义 魏晓雅 刘德星 贾凤龙基于COⅠ基因的媒介蝇类快速分子鉴定研究 被引量:6 2014年 目的为解决蝇类形态学鉴定的不足,建立基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的DNA条形码技术对蝇类进行分子鉴定。方法选取烟台口岸常见的16只蝇类作为研究对象,形态学鉴定后,取蝇的单后足代表微量组织,提取总DNA。依据资料,选取COⅠ国际通用引物LCO1490:5′-GGT CAA CAA ATC ATA AAG ATA TTG G-3′,HCO2198:5′-TAA ACT TCA GGG TGA CCA AAA AAT CA-3′,建立PCR体系,完善PCR程序,有效扩增蝇类的COⅠ基因。纯化PCR产物后进行序列测定和比对。此外,应用Mega5.05软件分别用最大似然法、邻接法、最大简约法分析系统发育,构建系统发育树比较进化关系。结果 16只蝇类COⅠ基因扩增片段长度为690 bp,其中A+T平均含量高达68.53%。序列比对结果及系统进化关系显示,16只蝇类COⅠ基因的分子鉴定与形态学鉴定结果一致。结论应用DNA条形码技术可成功扩增蝇类的COⅠ基因,其分子鉴定与形态学鉴定结果完全一致,尤其适用于微量组织样本的鉴定。 王颖 鲁闽 李金庆 刘明杰 岳巧云关键词:DNA条形码 蝇类 应用DNA条形码技术快速鉴定入境船舶上截获的昆虫蛹 被引量:11 2014年 [目的]利用DNA条形码技术快速准确鉴定从入境船舶上截获的未知双翅目昆虫蛹。[方法]将截获的5只蛹,1只蛹直接冷冻,4只孵化出成蝇;对蛹、蛹壳及孵化出的成蝇进行拍照留档。分别从蛹、蛹壳和孵化成蝇中提取基因组DNA;采用动物DNA条形码通用引物(LCO1490和HCO2198)扩增目的片段,并进行纯化、克隆测序和序列分析,与NCBI及BOLD中的序列进行比对,构建NJ树;对孵化成蝇进行形态鉴定。[结果]所检测的蛹、蛹壳以及孵化成蝇的DNA条形码序列与NCBI和BOLD中大头金蝇(Chrysomyia megacephala)的序列相似度达100%;孵化成蝇与大头金蝇的形态特征相符。[结论]根据测定结果,判定截获的未知双翅目昆虫蛹为大头金蝇的蛹;证明DNA条形码技术是一种鉴定未知昆虫蛹的有效手段。对于口岸截获的外来未知昆虫蛹、成虫残肢甚至蛹壳均可直接采用DNA条形码技术进行种类鉴定,大大缩短鉴定周期。 刘德星 聂维忠 邱德义 郭智屏 魏晓雅 陈健 胡佳 岳巧云关键词:DNA条形码 大头金蝇 入境船舶 DNA条形码—医学媒介生物快速准确鉴定的利器 被引量:14 2013年 DNA条形码为一种新兴的物种鉴定方法,为古老的物种鉴定学科注入了新鲜的血液,具有不受发育状态限制,减少对专家的依赖性,数据共享性高,可以建立国际鉴定平台等特点,为媒介生物的快速准确鉴定提供了一种新的利器。本文结合实际工作,参阅已发表的文献,分析传统形态学物种鉴定方法与DNA条形码方法鉴定物种的优缺点,DNA条形码技术的发展现状,DNA条形码数据的基本要求,以及DNA条形码鉴定物种的基本流程等,全面系统地介绍DNA条形码这一新的物种鉴定技术。在目前数据库DNA条形码数据不完善、不充足的情况下,尤其是在建设数据库的过程中,DNA条形码技术的应用离不开形态学鉴定,但当数据库中数据足够充足后,该技术将被广泛应用,对缩短鉴定周期,准确、快速鉴定媒介生物具有重要的意义。 岳巧云 邱德义 胡佳 刘国雄关键词:DNA条形码技术 医学媒介生物 DNA条形码技术在媒介蝇类分子鉴定中的应用 被引量:11 2013年 蝇类隶属双翅目(Diptera),其医学重要性是机械传播疾病。目前已证实,蝇类能携带的细菌有100多种,原虫30多种,病毒20种,此外还可携带螨类体外寄生虫,传播疾病并危害人类健康,是重要的医学媒介生物。蝇类传播疾病的另一特点是孳生习性不同的蝇种其携带病原体的类型也不同。对媒介蝇类进行相关科学研究的基础和前提是鉴定和识别, 王颖 方绍庆 刘明杰 岳巧云 邵柏关键词:医学媒介生物 分子鉴定 蝇类 体外寄生虫 携带病原体 应用DNA条形码技术鉴定口岸截获的国内未见分布蚊种 被引量:15 2014年 [目的]利用DNA条形码技术对口岸截获的形态特征破坏严重的未知蚊类进行种类鉴定。[方法]提取从荷兰进口的废纸中截获的一头形态严重破坏的蚊类的基因组DNA。采用无脊椎动物线粒体细胞色素氧化酶I(COI)的通用引物LCO1490和HCO2198扩增目的片段。然后纯化、克隆测序、序列分析、与BOLD中的序列进行比对。[结果]该未知蚊类的DNA条形码序列与BOLD中环带林蚊(Sylvicola cinctus)的序列相似性超过99.8%;并与原产地专家交流确认截获的蚊种为环带林蚊。经科技查新,确认为首次截获的国内未见分布蚊种。[结论]DNA条形码能克服传统物种鉴定依靠完整的外部形态的局限,有效提高外来物种的种类鉴别能力,大大缩短检测周期,降低外来物种对我国生态和公共卫生安全的危害。 魏晓雅 邱德义 岳巧云 郭智屏关键词:DNA条形码 医学媒介生物微量组织直接扩增DNA条形码序列方法的研究 被引量:3 2014年 目的为保证DNA条形码序列模板DNA来源的单一性,和最大程度减少凭证标本的形态破坏,建立一种从医学媒介生物微量组织中免提取,直接扩增DNA条形码序列的方法。方法以螨、蚤、蜱单个个体以及小至蝇类后足1/5跗节的组织块为材料,通过优化裂解液浓度、裂解液和缓冲液配比,优化反应体系和反应条件,用KOD FX DNA聚合酶进行DNA条形码序列的直接扩增,反应产物测序,与NCBI基因库中的序列进行比较以验证其是否被污染。结果裂解液优化为NaOH 50 mmol/L;裂解液和缓冲液配比优化为9∶1;反应体积优化为每50μl反应体系中2×KOD FX DNA聚合酶buffer(含Mg2+)25μl、2 mmol/L dNTP 10μl、KOD FX DNA聚合酶(1 U/μl)1μl、正向引物LCO1490(20μmol/L)、反向引物HCO2198(20μmol/L)各1μl;反应条件优化为:95℃3 min;98℃10 s,50℃30 s,68℃1 min,35个循环;68℃7 min。测序结果显示无污染,均为有效序列。结论该方法操作简单而且省去了DNA提取的步骤,节约了时间和费用,适合螨、蚤、蜱单个个体以及小至蝇类后足1/5跗节的组织块DNA条形码序列的直接扩增。 胡佳 岳巧云 邱德义 吴可量 刘德星 汪小东 魏晓雅 陈健 廖俊蕾关键词:医学媒介生物 DNA条形码 DNA条形码技术在肉品防欺诈鉴别中的应用 被引量:22 2013年 以DNA条形码技术鉴别进出口监督抽检的鱼肉等水产制品的种类来源,用以判别其与申报或产品标签是否相符。分别提取鱼肉等样品的基因组DNA,以目前国际上比较公认的动物线粒体细胞色素氧化酶COⅠ基因通用引物进行PCR扩增。PCR产物经测序分析后,将得到的扩增片段序列与Genbank数据库进行序列比对,同时提交Barcoding Life DNA条形码数据库(BOLD)进行鉴定分析。本批次监督抽检的16份鱼肉、鱼丸等水产制品中除1份样品未能成功获得鱼肉COⅠPCR扩增外,其余15份样品均顺利得到种类来源鉴定,鉴定结果约有31.25%的样品与产品标签标示不符。作为一种简单、快速、有效的分子鉴定技术,DNA条形码可以直接应用于鱼肉等动物源性食品的种类鉴定。 邱德义 胡佳 刘德星 魏晓雅 刘国雄 岳巧云关键词:DNA条形码 动物源性食品 国内未见分布蝇种:澳洲麻蝇的形态和DNA条形码鉴定 被引量:12 2015年 目的应用DNA条形码与形态分类相结合的方法,快速、准确鉴定在中山口岸入境船舶截获的1只蝇类。方法 2014年4月30日中山出入境检验检疫局神湾办事处从澳大利亚入境载有鲜葡萄的货船上截获1只蝇类,做成针插标本,并拍照存档。进行形态学鉴定,然后取1条后足提取基因组DNA,采用动物DNA条形码的通用引物(LCO1490和HCO2198)扩增目的片段,并进行纯化、克隆测序和序列分析,与NCBI及BOLD中的序列进行比对,构建NJ树。结果形态学鉴定截获蝇类为雌性麻蝇科种类,由于缺少关于雌性麻蝇鉴定特征描述的参考资料,无法将该蝇鉴定到种,所获得的DNA条形码序列与BOLD中的澳洲麻蝇[Sarcophaga australis(Johnston et Tiegs,1921)]的序列相似度达100%。经过科技查新,确认是中国未见分布种。结论根据鉴定结果,判定所截获的蝇类为雌性澳洲麻蝇,是我国首次截获。应用DNA条形码与形态鉴定相结合可以准确快速鉴定雌性麻蝇种类。 刘德星 岳巧云 廖俊蕾 魏晓雅 陈健 胡佳