中央高校基本科研业务费专项资金(JB-ZR1112)
- 作品数：5 被引量：10H指数：3
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- 米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 采用PCR技术从米曲霉CICC2012菌株基因组中克隆6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd),并利用生物信息学手段对其氨基酸序列、进化树、理化性质、蛋白质结构等进行分析。序列测定和分析结果表明,gnd基因序列长为1 723bp,包含1个1 551bp的开放阅读框,编码516个氨基酸;gnd基因编码的6PGDH氨基酸序列与黄曲霉6PGDH基因的同源性为99%,存在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有11、2和6个;6PGDH蛋白分子量为57.3kD,等电点为5.63;gnd基因编码蛋白二级结构α-螺旋区域占44.57%,β-折叠区域占12.79%,无规则卷曲区域占42.64%;氨基酸残基11～195位点为NADP+结合区域。
- 吴晶晶洪志宏张卡陈宏文
- 关键词：米曲霉克隆生物信息学
- 米曲霉磷酸果糖激酶基因克隆及序列分析
- 2013年
- 磷酸果糖激酶(PFK)是糖酵解途径的重要调控酶。以酿酒米曲霉CICC2012为材料,克隆获得PFK基因pfkA(GenBank登录号:KC113503.1)。序列分析表明:pfkA序列长度为2 722bp,含有2个内含子,开放阅读框长2 358bp;PFK为785个氨基酸组成的亲水蛋白,分子量86.0kDa,等电点6.38,含有2个PFK家族指纹结构;二级结构包含42.68%的α-螺旋,14.27%的β-折叠和43.06%的无规则卷曲;同源建模三级结构PFK含有N端和C端的2个结构域,底物果糖-6-磷酸结合于N端结构域。采用进化树分析,发现米曲霉PFK与丝状真菌PFK亲缘性较近。
- 张卡杜钰陈宏文
- 关键词：米曲霉克隆
- 米曲霉6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因gsdA的克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化6-磷酸葡萄糖生成6-磷酸葡萄糖酸,并生成NADPH,是微生物胞内磷酸戊糖途径(PPP)的关键酶。本研究以食品安全菌米曲霉CICC2012为材料,克隆获得6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因(GenBank登录号:JN123468)。序列分析表明,该酶是由222个氨基酸组成的亲水性蛋白;128～134位氨基酸序列DHYLGKE为活性区域;170～176位氨基酸序列GTEGRGG可能为辅因子结合位点。进化树分析表明,米曲霉6-磷酸葡萄糖脱氢酶同其他丝状真菌及酵母的G6PDH较相似。
- 刘薇吴晶晶陈宏文
- 关键词：克隆生物信息学分析
- 米曲霉木糖还原酶基因的克隆及序列分析
- 2013年
- 木糖还原酶(XR,EC 1.1.1.21)是真菌微生物代谢木糖的关键酶之一。本文以米曲霉基因组DNA为模板,克隆木糖还原酶基因(xr,GenBank登录号:FJ957890.1),并对XR的序列、系统进化树、理化性质及蛋白结构等进行生物信息学分析。结果表明:xr基因序列长1449 bp,其中开放阅读框长960 bp,编码319个氨基酸,蛋白质分子质量35.9 kDa,等电点为5.78;米曲霉XR与其他菌种XR有较高的同一性,含有醛酮还原酶家族的两个指纹结构和一个参与辅酶结合活性位点指纹结构,以及醛酮还原酶家族典型的(β/α)8TIM桶结构,说明米曲霉XR属于醛酮还原酶家族。
- 洪志宏杜钰林毅陈宏文
- 关键词：米曲霉木糖还原酶克隆
- 工业微生物还原型辅酶Ⅱ的代谢调控研究进展被引量：4
- 2012年
- 还原型辅酶Ⅱ(NADPH)主要参与细胞合成代谢,是微生物代谢网络中含量最丰富的氧化还原辅酶之一。辅酶工程作为代谢工程的重要分支,通过改变微生物胞内辅酶再生途径,进而改变细胞内代谢产物构成。本文在归纳NADPH产生途径和调控的基础上,分析和评述了工业微生物基于辅酶工程的NADPH代谢调控研究进展,包括过量表达NADPH代谢相关酶、敲除NADPH代谢相关基因及引入特定代谢途径等策略,指出今后的研究重点在于深入理解NADPH调控与中心碳代谢网络的相互作用,为利用代谢工程进行细胞工厂改造提供基础。
- 陈宏文刘薇杜钰陈国方柏山
- 关键词：代谢调控工业微生物
