国家植物种质资源共享平台建设项目(2005DKA21001-06)
- 作品数：5 被引量：118H指数：5
- 相关作者：宗绪晓关建平顾竟刘金张晓艳更多>>
- 相关机构：中国农业科学院作物科学研究所张家口市农业科学院中国农业大学更多>>
- 发文基金：国家植物种质资源共享平台建设项目农业部作物种质资源保护项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 国外栽培豌豆遗传多样性分析及核心种质构建被引量：32
- 2008年
- 从111对备选SSR引物中筛选出能扩增出清晰稳定单一带的多态性引物21对及其最佳退火温度,并优化了豌豆SSR标记实验体系。利用上述引物,对来自于67个国家的731份豌豆栽培种质(Pisum sativum L.)进行遗传多样性分析与核心种质构建。共扩增出109条多态性带,每对引物平均扩增出5.19个等位变异。SSR等位变异在各大洲间分布不均匀,有效等位变异数、Shannon's信息指数(I)洲际间差异明显。各大洲资源群间遗传多样性差异显著,其中亚洲最高(I=1.1753),欧洲其次(I=1.1387),俄罗斯联邦(I=1.0285)、美洲(I=1.0196)、非洲(I=0.9254)、大洋洲(I=0.8608)依次降低。利用Popgene1.32软件,依豌豆栽培资源洲际间Nei78遗传距离可聚类成2个组群和4个亚组群;基于Structure 2.2软件分析,国外栽培豌豆资源实际由3大类群组成,并与Popgene 1.32聚类结果呼应得较好。上述两种分析方法均表明,国外栽培豌豆类群的遗传多样性与其地理分布相关。设计并实践了一套基于Structure分析的科学可靠、逻辑性强的核心种质构建标准化方案,并依此构建了一套以6.57%的资源(48份)涵盖总体84.4%等位变异的国外栽培豌豆核心种质。
- 宗绪晓关建平王述民刘庆昌Robert R ReddenRebecca Ford
- 关键词：核心种质国外资源
- 木豆种质资源AFLP标记遗传多样性分析被引量：22
- 2007年
- 利用AFLP分子标记技术,以木豆野生种(Cajanus scarabaeiodes)为对照,对来自印度、中国、非洲和美洲的139份栽培木豆(Cajanus cajan)种质遗传多样性进行研究。17对引物共扩增出502条清晰可辨的带,其中多态性带494条。遗传相似性系数UPGMA聚类图,揭示木豆种内存在足够的遗传多样性,可用于种质资源的准确鉴别与分类。借助遗传距离的ME进化树又将参试种质分成8个组群。分析结果表明,印度地方资源遗传多样性广泛,育成品种遗传基础广阔;非洲、美洲资源遗传多样性较丰富,且与印度资源的亲缘关系较密切。中国地方资源遗传多样性独特,且与印度、非洲、美洲栽培木豆资源亲缘关系不明显。研究结果基本支持印度木豆起源和多样性中心、非洲次生多样性中心的观点,并提出中国次生起源中心和遗传多样性中心假说。研究还发现,木豆核质互作雄性不育系(A)和保持系(B)间存在独特的AFLP谱带差异,可能有助于分子标记辅助的木豆杂种优势利用和杂交种培育。
- 闫龙关建平宗绪晓
- 关键词：木豆AFLP聚类分析
- 小扁豆种质资源SSR标记遗传多样性及群体结构分析被引量：19
- 2008年
- 从145对SSR引物中筛选到14对多态性引物,对选取国家种质库的440份小扁豆种质资源进行SSR标记遗传多样性分析,共检测出87个等位变异,平均每个SSR位点6.2143个;平均Shannon-Weaver指数(I)为1.1869。16个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,国外群体的遗传多样性水平(0.9837)远高于国内群体(0.3485)。PCA、UPGMA法聚类分析和Structure群体结构分析结果相互间完全吻合。440份参试材料从遗传结构上可划分为8个组群,揭示国外群体遗传分化大,群体间的亲缘关系较远;国内群体与之相反。研究结果显示,山西、宁夏和甘肃省是我国小扁豆资源遗传多样性最丰富、遗传关系较复杂的地区,应对该区域小扁豆资源进一步搜集、保护和研究;同时,应继续加强小扁豆资源的国外引种与交流,做进一步系统研究和开发利用。
- 刘金关建平徐东旭张晓艳顾竟宗绪晓
- 关键词：小扁豆种质资源SSR标记
- 豌豆属(Pisum)SSR标记遗传多样性结构鉴别与分析被引量：21
- 2009年
- 【目的】评价豌豆属(Pisum L.)2个种5个亚种下,共8个资源类群的遗传多样性水平,揭示豌豆属下资源群体结构及其遗传关系远近,验证传统植物学分类的可靠程度,为充分发掘、利用豌豆野生种质提供必要信息。【方法】利用21对豌豆多态性SSR引物,对来自世界5大洲62个国家的豌豆属94份栽培种质(P.sativum ssp.sativum var.sativum)及其1个近缘野生种(P.fulvum),3个野生亚种(P.sativum ssp.abyssinicum、P.sativum ssp.asiaticum、P.sativum ssp.transcaucasicum)和3个野生变种(P.sativum ssp.elatius var.elatius、P.sativum ssp.elatius var.pumilio、P.sativum ssp.sativumvar.arvense)的103份野生种质进行SSR标记遗传多样性分析;利用NTSYSpc2.2d软件估算其遗传距离,进行主成分分析(PCA)并绘制三维空间聚类图;利用Popgene V1.32估算种质群间的Nei78遗传距离等参数并进行UPGMA聚类分析,采用MEGA3.1绘制种质群间聚类图;采用Popgene V1.32估算种质群的等位位点分布等参数,利用Fstat V2.9.3.2进行种质群间遗传多样性差异显著性测验。【结果】21对豌豆多态性SSR引物共扩增出104条多态性带,每对引物平均扩增出4.95个等位变异,其中有效等位变异占65.56%;PSAD270,PSAC58,PSAA18,PSAC75,PSAA175和PSAB72等SSR引物最为有效。SSR等位变异在豌豆属植物学分类单位中分布均匀,但分类单位种质群间的遗传多样性在多数情况下差异显著。豌豆属野生种P.fulvum的遗传多样性远低于栽培种P.sativum;豌豆栽培种下,P.sativum ssp.sativum var.sativum和P.sativum ssp.asiaticum的遗传多样性最高,P.sativum ssp.elatius var.elatius和P.sativum ssp.transcaucasicum次之,P.sativum ssp.elatius var.pumilio、P.sativum ssp.sativum var.arvense和P.sativumssp.abyssinicum最低。PCA分析发现,豌豆属种质资源由4个差异明显的基因库构成。"fulvum"基因库主要由野生种Pisum fulvum资源构成,"abyssinicum"基因库主要由栽培种下的P.sativum ssp.abyssinicum亚种资
- 宗绪晓Rebecca FordRobert R Redden关建平王述民
- 关键词：SSR基因库
- 小扁豆种质资源形态标记遗传多样性分析被引量：43
- 2008年
- 选取国家种质库保存的481份小扁豆种质资源进行形态标记遗传多样性分析,表明14个形态性状的平均变异类型达8.79个,平均遗传多样性指数(I)为1.8149。16个不同地理来源群体间显示出显著的形态标记遗传多样性差异,国外群体的遗传多样性水平略高于国内群体。国内山西小扁豆种质资源的I值(1.573)仅次于I值最高的国外ICARDA群体(1.683)。研究结果显示,西北部省份是我国小扁豆资源遗传多样性最丰富的地区,应加强该区域小扁豆资源的进一步搜集、保护和研究。Structure群体遗传结构分析将481份参试资源划分为6大组群,各组群特征表现各异,变化丰富。
- 刘金关建平徐东旭张晓艳顾竟宗绪晓
- 关键词：小扁豆种质资源
