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转基因生物新品种培育专项(2013ZX08004-003)
作品数:
1
被引量:17
H指数:1
相关作者:
王洋
柏锡
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相关机构:
东北农业大学
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发文基金:
转基因生物新品种培育专项
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东北农业大学
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王洋
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大豆科学
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2014
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大豆NAC基因家族生物信息学分析
被引量:17
2014年
NAC转录因子是植物特有的具有多种生物功能的一类重要转录因子,广泛参与植物生长发育以及生物与非生物逆境应答等。本文利用生物信息学手段,结合大豆基因组数据库及NCBI数据库,识别、筛选并获得了大豆NAC家族基因的蛋白序列,并对其进化关系、在基因组上的定位分布以及理化特性进行了预测和分析。结果显示具有NAC结构域的152条大豆氨基酸序列认为是假定NAC蛋白质,共分为10个亚家族,连锁群定位结果发现大豆的20条染色体上均有NAC转录因子的分布,其中第12号染色体上分布最多。不同亚族间的大豆假定NAC蛋白质理化特性存在一定的差异,无规则卷曲和α-螺旋是蛋白质二级结构最大量的结构元件,并散布于整个蛋白。本研究结果将为大豆NAC基因家族的进一步功能分析奠定重要的研究基础。
王洋
柏锡
关键词:
大豆
生物信息学
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