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光诱导香菇菌丝转色形成的机制研究: 香菇是目前世界上一种深受消费者喜欢的重要食用菌品种之一。在其栽培生产中,菌丝转色形成是原基发生和子实体形成前重要阶段,对产量和品质具有重要影响。但香菇菌丝转色形成的机制还知之甚少,尤其是环境因子光线对香菇菌丝转色形成的机...; 唐利华鲍大鹏张雪洪谭琦; 关键词：香菇转色转录组

多烯大环内酯抗生素的结构改造与高产被引量：1: 2017年; 多烯大环内酯抗生素是一类重要的高效广谱抗真菌药物,被广泛用于治疗真菌感染与食品防腐,但多烯大环内酯抗生素的进一步应用因其细胞毒副作用而被限制.多烯大环内酯抗生素的药理性质提升与产量提高是目前亟待解决的问题.本文总结了多烯大环内酯抗生素多烯区域、环外羧基、多元醇区域及糖基配体四方面的结构改造工作,系统阐释了多烯大环内酯抗生素的活性作用机制与构效关系.同时,总结了用于多烯大环内酯抗生素产量提高的调控基因改造、群体感应信号通路改造及前体供给优化等基因工程改造策略,指出了多烯大环内酯抗生素结构改造及产量提高面临的挑战与尚待解决的问题.; 齐震白林泉; 关键词：基因工程

DNA克隆和组装技术研究进展被引量：4: 2015年; DNA克隆和组装技术是重要的分子生物学工具。近年来,随着合成生物学的飞速发展,对大片段DNA元件的快速有效组装就显得尤为关键。同时,各种DNA克隆和组装技术也竞相发展起来。通过对基于非典型酶切连接、PCR、同源重组、单链退火拼接等原理发展起来的各种DNA克隆和组装技术进行综述,为合成生物学的进一步发展提供有效的操作工具。; 史晏榕孙宇辉; 关键词：PCR 同源重组

绿针假单胞菌HT66中ompR基因的功能被引量：1: 2018年; 【背景】植物根部存在大量对植物生长有促进或对病原菌有拮抗作用的有益细菌,是当前农业微生物研究的热点之一。其中,绿针假单胞菌HT66是一株可高效合成吩嗪-1-甲酰胺(PCN)的环境友好型生防菌株。【目的】探究在绿针假单胞菌HT66中ompR基因的生理功能,以及其对菌株生防作用的影响。【方法】通过基因无痕敲除的方法构建HT66菌株的ompR基因缺失突变株,对比研究突变株与野生株在生长速率、渗透压感应、生物膜的合成、pH耐受性、群集运动和PCN产量的变化。【结果】与野生株相比,ompR基因缺失突变株的细胞生物量微量减少,生物膜的合成减少31.5%,群集运动以及对渗透压和pH的耐受性明显下降,但是其PCN产量较野生株提高了57.8%。【结论】在HT66菌株中,ompR基因对其运动性、环境耐受性和生理生防功能均有一定程度的调控作用。本研究丰富了绿针假单胞菌的代谢通路,此报道将对后续PCN合成机制的研究和应用提供一定的理论依据。; 侯博文郭树奇彭华松张雪洪; 关键词：假单胞菌基因敲除 OMPR

绿针假单胞菌高产吩嗪-1-甲酰胺的机制及合成过程强化研究: 绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)HT66是本实验室从水稻根际分离得到的一株生防菌株,它可以分泌吩嗪类物质吩嗪-1-甲酰胺(Phenazine-1-carboxamide,PCN)。在吩嗪类...; 金雪洁; 关键词：基因敲除; 文献传递

重组大肠杆菌HW2利用甘油产氢气的研究被引量：1: 2015年; 从前期得到的一株能在厌氧下高效利用甘油的大肠杆菌突变株HW2出发,通过基因工程改造,提高菌株利用甘油产氢气的能力。首先敲除乳酸脱氢酶基因ldh A和丙酮醛合成酶基因mgs A,得到工程菌株HW2Δldh AΔmgs A。将该菌株在甘油培养基中厌氧培养,结果表明敲除这两基因不影响菌株的生长。培养48 h后,菌株HW2Δldh AΔmgs A的氢气产量为(410.6±33.0)μmol?mg protein-1,是出发菌株HW2的1.6倍。接着在该菌株中过表达经密码子优化的弗氏柠檬杆菌二羟基丙酮激酶来进一步提高氢气的产量。最终获得氢气高产菌株HW2Δldh AΔmgs A p CA24N-dha KL,经过厌氧培养48 h后,氢气产量为(571.5±30.3)μmol?mg protein-1,是出发菌株HW2的2.1倍。; 刘晴熊得王胡洪波张雪洪; 关键词：氢气大肠杆菌甘油乙醇

生防绿针假单胞菌HT66中脂肽的鉴定与功能被引量：3: 2017年; 【目的】脂肽(Lipopeptide,LP)是微生物合成的一类重要的生物表面活性剂,不仅影响细菌的生物学功能,还对多种植物和人类病原菌具有广谱的拮抗作用。然而至今未见绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)中脂肽产物的报道。【方法】通过生物信息学手段预测绿针假单胞菌HT66中脂肽的氨基酸组成及顺序,构建脂肽合成基因缺失突变株HT66Δclp,根据突变株缺失代谢产物的UPLC/QTOF-MS信息验证预测结果,并研究了脂肽对该菌株的生长、吩嗪-1-甲酰胺(PCN)合成、生物膜形成和群集运动性的影响。【结果】预测菌株HT66的脂肽氨基酸顺序为L-Leu–D-Glu–D-allo-Thr–D-Val–L-Leu–D-Ser–L-Leu–D-Ser–L-Ile,通过比对野生型和突变株代谢产物的质谱信息确定该产物为黏液菌素(Viscosin);脂肽合成基因缺失后,菌株HT66的生长无明显变化,但其PCN合成、生物膜形成和群集运动性均有不同程度地下降。【结论】菌株HT66的脂肽产物为黏液菌素,对菌株的代谢、生物膜形成和运动性等生物学功能具有重要的调控作用。研究报道了绿针假单胞菌中一种脂肽分子的结构与功能,为研究其合成和调控机制及开发和应用奠定了基础。; 熊欣侯博文金雪洁彭华松张雪洪; 关键词：假单胞菌脂肽

氨基糖苷抗生素庆大霉素:基础研究的新进展及应用研究的新潜力被引量：20: 2015年; 庆大霉素是临床上重要的氨基糖苷类抗生素。近年来,伴随现代生物技术水平的发展,人们对该抗生素有了更深入的了解。本文综述了近年来国内外关于庆大霉素的作用机制和耐药机制、生物合成途径和结构改造,及其新活性等方面研究成果,并对庆大霉素的应用与发展前景进行展望。; 简心韵邓子新孙宇辉; 关键词：庆大霉素耐药性机制生物合成

17-[16,17-Dihydroxycyclooctatinyl]-hexaketide ester from Streptomyces sp. SR107: 2016年; A new hexaketide acid esterified by the 17-hydroxyl group of 16,17-dihydroxycyclooctatin, namely 17-[16,17-dihydroxycyclooctatinyl]-hexaketide ester(1), a member of the group of rare bacterial diterpenes with a fused 5-8-5 ring system was isolated from strain Streptomyces sp. SR107. The structure was determined on the basis of its spectral data(~1H NMR, ^(13) C NMR, ~1H-~1H COSY, HSQC, HMBC, NOESY, IR and HR-ESI-MS). The antibacterial activity was also evaluated in this paper.; LIU Meng-Yu-JieLI Shan-RenLU Chun-Hua; 关键词：DITERPENES

一株在有氧条件下转化丙酮醇为1,2-丙二醇的大肠杆菌菌株的研究: 2016年; 本实验室在前期构建了一株能高效利用甘油合成丙酮醇的大肠杆菌工程菌株,如果能在有氧条件下将丙酮醇转化为1,2-丙二醇,则可以大幅提高1,2-丙二醇的合成速率。以大肠杆菌BW25113Δglp K为出发菌株,筛选得到一株可以在有氧条件下代谢甘油的突变菌株PDO1。结果表明,该菌株可以在有氧条件下将丙酮醇转化为1,2-丙二醇,1,2-丙二醇的产量达到0.73 g/L,转化率达到0.493 g/g丙酮醇。突变株PDO1的甘油脱氢酶酶活和胞内的NADH百分比分别是对照株的75.9倍和1.64倍,由此推测,甘油脱氢酶酶活的提高以及NADH的相对提高,使得突变株可以在有氧条件下通过甘油脱氢酶途径代谢甘油,并转化丙酮醇为1,2-丙酮醇。; 邓静静胡洪波张雪洪; 关键词：大肠杆菌 1,2-丙二醇甘油

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国家重点基础研究发展计划(2012CB721005)

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