河南省教育厅自然科学基金(2008A208017)
- 作品数：2 被引量：6H指数：2
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- 相关机构：河南农业大学河南省农业科学院更多>>
- 发文基金：河南省教育厅自然科学基金河南省基础与前沿技术研究计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 小麦液泡膜反转运蛋白基因TaNHX1的生物信息学分析被引量：2
- 2008年
- [目的]利用生物信息学方法分析基因的功能,[方法]通过生物信息学数据库和因特网上的软件进行分析,对小麦液泡膜Na+/H+反转运蛋白基因TaNHX1的理化性质、结构与功能进行了预测。[结果]TaNHX1基因编码的蛋白是一种相对分子质量为59.7 kD、等电点pI为8.13的疏水性稳定蛋白,富含Leu、Phe、Lle、Gly、Ser、Val、Ala等氨基酸。TaNHX1基因编码的氨基酸序列内含有一段氨氯吡嗪咪的结合域的高度保守序列FF-YLLPI。同源性比较发现TaNHX1与AeNHX1、TiNHX1的亲缘关系很近,分别是99%和97%,推测他们可能为同源基因,具有相似的生物学功能。[结论]该研究为进一步探讨TaNHX1的生物学功能奠定了基础。
- 许海霞李阳程西永董中东李伟崔党群
- 关键词：小麦生物信息学
- 小麦质膜Na^+/H^+逆转运蛋白TaSOS1的表达分析被引量：4
- 2011年
- 为探讨小麦质膜Na+/H+逆转运蛋白TaSOS1在逆境条件下的生物学功能,采用荧光定量PCR(RT-PCR)方法,对TaSOS1基因在4种不同胁迫条件下(200mmol.L-1 NaCl、4℃低温、100μmol.L-1ABA和15%PEG6000)的表达水平进行了定量分析。结果表明,在正常条件下,小麦根中TaSOS1的mRNA表达量要高于叶中的表达量。盐胁迫处理下,根中TaSOS1特异性上调表达,说明TaSOS1基因在根中的功能更强,其表达与盐胁迫有关且具有组织特异性;在4℃低温处理下,TaSOS1在叶中上调表达;而在ABA和PEG6000两种处理条件下,TaSOS1的表达没有规律性,推测TaSOS1的表达途径可能为非ABA依赖型且与盐离子的特异性有关。生物信息学分析的结果表明,小麦质膜Na+/H+逆转运蛋白TaSOS1与拟南芥和水稻的质膜Na+/H+逆转运蛋白AtSOS1和OsSOS1具有高度的同源性,由此可以推测小麦TaSOS1具有与AtSOS1和OsSOS1类似的功能,可以把植物体内Na+排出体外,以减轻Na+对植物的毒害。
- 周扬徐园园江行玉程西永陈锋崔党群姜鸿勋许海霞
- 关键词：小麦胁迫处理基因表达
