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中国疾病预防控制中心青年科研基金(2012A104)
作品数:
1
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H指数:1
相关作者:
蒋明
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广州管圆线虫线粒体基因组比较分析
被引量:2
2014年
目的:比较我国大陆地区广州管圆线虫线粒体基因组的多态性。方法在种群遗传学研究基础上,选取7条雌虫进行线粒体基因组的测定。根据广州管圆线虫线粒体基因组已知序列(GQ398121)设计12对引物,进行PCR扩增,并对目的片段进行测序和拼接。利用多种生物学软件对测定的线粒体基因组进行基因定位、结构图绘制、核苷酸及变异位点分析、进化关系分析。结果获得5个不同遗传类型的线粒体基因组。这些基因组的大小相似、结构相同,即13491~13502对碱基,含12个蛋白编码基因,2个核糖体基因,22个tRNA基因,2个较大的非编码区。上述基因紧密地排列在同一条DNA链上,并具有相同的转录方向。通过对这些基因组的比对发现,变异位点745个,占整个基因组的5.5%。其中,缺失/插入突变59个,碱基颠换105个,碱基转换581个。这些突变位点均匀地分布在整个线粒体基因组中。结论本研究提供了丰富的广州管圆线虫线粒体基因的突变位点,为构建种内鉴别诊断技术提供了基础。
吕山
张仪
郭云海
刘和香
周正斌
蒋明
顾文彪
关键词:
广州管圆线虫
线粒体基因组
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