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江苏省卫生厅科技发展基金(H200707)
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
相关作者:
陆祖宏
程璐
陈丹
潘世扬
张寄南
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相关机构:
东南大学
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江苏省人民医院
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相关领域:
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作者
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张丽霞
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张寄南
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1篇
陈丹
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程璐
1篇
陆祖宏
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生物医学工程...
年份
1篇
2008
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APC基因甲基化定量检测芯片的建立
被引量:1
2008年
目的建立抑癌基因APC(adenomatous polyposis coli,APC)启动子1A的甲基化定量芯片检测方法。方法选取一段420bp的APC基因启动子1A CpG密集序列作为靶序列,针对M0、M1、M2、M3、M45个CpG靶位点,设计一套检测甲基化与非甲基化的探针。采用脐带血DNA克隆体作为阴性、阳性质控品。结果甲基化阳性、阴性质控的芯片结果与测序吻合。每组探针中荧光强度由强至弱依次为,阳性质控(甲基化):探针1>2、3>4;阴性质控(非甲基化):探针3>4、1>2。5个位点的5条荧光强度标准曲线,R2范围是0.93~0.99。M0、M1、M2、M3、M45个位点甲基化杂合型的检测范围分别为50.0%±3.6%、50.0%±6.9%、50.0%±3.5%、50.0%±8.5%、50.0%±7.3%。结论建立了APC基因启动子5个CpG位点的甲基化定量检测芯片。
潘世扬
王贤
张丽霞
陆祖宏
程璐
陈丹
张寄南
关键词:
DNA甲基化
芯片
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