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国家自然科学基金(81172736)

作品数:3 被引量:5H指数:1
相关作者:王志锐穆成谢彤赵慧巨韩芳更多>>
相关机构:天津市疾病预防控制中心天津市结核病控制中心更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 4篇医药卫生

主题

  • 4篇结核
  • 4篇结核分枝杆菌
  • 4篇分枝杆菌
  • 4篇杆菌
  • 3篇基因
  • 3篇基因型
  • 2篇多态
  • 2篇多态性研究
  • 2篇生物进化
  • 2篇片段
  • 2篇基因缺失
  • 1篇液态
  • 1篇芯片
  • 1篇芯片技术
  • 1篇耐药
  • 1篇耐药性
  • 1篇抗药
  • 1篇抗药性
  • 1篇基因分型
  • 1篇基因分型方法

机构

  • 4篇天津市疾病预...
  • 2篇天津市结核病...

作者

  • 4篇谢彤
  • 3篇巨韩芳
  • 3篇赵慧
  • 3篇穆成
  • 3篇王志锐
  • 2篇王撷秀
  • 2篇孙蕊
  • 2篇王春花
  • 1篇王春花
  • 1篇王艳楠

传媒

  • 2篇中国防痨杂志
  • 1篇中华结核和呼...

年份

  • 2篇2018
  • 1篇2015
  • 1篇2014
3 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究被引量:4
2018年
目的揭示结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)北京基因型菌株的进化路径,在进化过程中产生的各个进化分支,以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株,首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207(RD207)的缺失情况,以鉴定收集的菌株是否为北京基因型;然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况,以及菌株基因组NTF(noise transfer function)区中插入序列6110(IS6110)的存在情况。结果567株临床分离的MTB菌株中,517株(91.2%)为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中,447株(86.5%)为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株;70株(13.5%)为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析,北京基因型菌株被分为5个亚型,其中RD181(+)的北京基因型菌株为22株(4.3%),且全部为北京基因型古代株。RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的北京基因型古代株分别为41株(7.9%)和7株(1.4%)。447株现代菌株中,RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的分别为404株(78.1%)和43株(8.3%)。结论MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株;北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支,其中RD181(-)/RD150(+)的北京基因型现代株为主要的流行分支。
谢彤孙蕊巨韩芳王春花穆成王志锐赵慧
关键词:基因型基因缺失生物进化
结核分枝杆菌北京基因型亚型的流行及与耐药性的关系研究被引量:1
2015年
目的通过分析Mtb北京基因型基因组NTF(noisetransferfunction)区插入序列IS6110,揭示北京基因型在进化过程中所形成的古代株和现代株2个亚型在天津市的流行情况及其与耐药表型的关系。方法收集20122014年天津市临床分离的816株Mtb菌株。采用PCR试验分析菌株基因组中差异区域(Regionofdifference,RD)RD207和RD105片段是否有缺失,以鉴定是否为北京基因型。通过检测北京基因型菌株基因组NTF区中IS6110插入序列的数目,了解北京基因型菌株中古代株和现代株所占的比例,并进一步分析这两种亚型与菌株耐药表型间的关系。计数资料采用卡方检验进行分析,以P〈0.05为差异有统计学意义。结果在所分析的816株临床分离的Mtb菌株中,764(93.63%)株为北京基因型菌株。764株北京基因型菌株中,110株(14.40%)为古代株,654株(85.60%)为现代株。现代株中仅有1株为北京基因型w株。在古代株和现代株中,耐异烟肼菌株分别占26.36%(29/110)和10.70%(70/654)(X2=20.47,P〈0.01);耐利福平菌株分别占14.55%(16/110)和6.57%(43/654)(X2=8.40,P〈0.01);耐乙胺丁醇菌株分别占8.18%(9/110)和3.21%(21/654),(X2=6.17,P〈0.05)。此外,MDR-TB患者中古代株和现代株分别占13.64%(15/110)和4.74%(31/654)(X2=13.17,P〈0.01)。结论Mtb北京基因型中的现代株是天津市的主要流行株,但古代株与耐药结核病的关系更为密切,提示在天津市,对抗结核药物产生耐药并不是导致北京基因型广泛流行的主要因素。
谢彤巨韩芳王春花王志锐穆成赵慧王艳楠孙蕊王撷秀
关键词:结核分枝杆菌基因型抗药性表型
应用液态芯片技术建立结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸基因分型方法
2014年
在结核病的分子流行病学研究中,间隔区寡核苷酸基因分型法(spaceroligonucleotidetyping,Spoligotyping)是主要的MTB基因分型方法,其分型原理是根据MTB基因组中存在多拷贝的正向重复序列,在特定的2个正向重复序列之间的是否存在非重复间隔序列,不同的菌株可能存在差别。Spoligotyping分型通过分析MTB基因组中43个正向重复间隔序列存在的多态性来区分不同菌株,并根据相邻3个间隔序列的存在情况,
谢彤王撷秀王春花巨韩芳王志锐穆成赵慧
关键词:基因分型方法寡核苷酸结核分枝杆菌SPOLIGOTYPING芯片技术液态
结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究
目的揭示结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)北京基因型菌株的进化路径,在进化过程中产生的各个进化分支,以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至201...
谢彤孙蕊巨韩芳王春花穆成王志锐赵慧
关键词:基因型基因缺失生物进化
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