甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW-2011-21)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
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- 虹鳟MHC-UBA基因遗传多样性分析被引量：1
- 2013年
- 主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)是存在于脊椎动物体内,与免疫功能密切相关的高度多态性基因群,也是研究适应性进化过程的最佳候选基因之一。采用PCR-SSCP及克隆测序的方法分析了184尾虹鳟MHCⅠ类UBA基因第2外显子的遗传多样性。结果共检出12个等位基因,其中有11个为首次发现。单个个体最多存在4种等位基因,预示虹鳟UBA基因可能存在2个以上拷贝位点。12种等位基因同源性在98.08%-99.23%之间,核苷酸变异位点百分率6.13%,氨基酸变异位点百分率17.44%。抗原肽结合区(PBR)和非抗原肽结合区(non-PBR)的非同义替换率(dN)均显著大于同义替换率(dS)(P<0.001),说明虹鳟UBA基因在进化过程中受到正向选择的作用。氨基酸组分和密码子使用偏性分析表明各同义密码子使用频率不均衡。系统发育分析结果显示,虹鳟UBA基因与大西洋鲑UBA基因亲缘关系较近。研究结果表明,虹鳟UBA基因具有丰富的遗传多样性,可望作为抗病育种应用中的一个潜在遗传标记。
- 胡丹丹刘哲邵淑娟杨娟王建福
- 关键词：虹鳟克隆测序
- 基于MHC-DAB基因内含子序列的3种虹鳟养殖群体遗传结构分析
- 2013年
- 虹鳟是当前全球性养殖品种，采用PCR—SSCP的方法，分析了甘肃金鳟、道氏虹鳟和美国金鳟三个虹鳟养殖群体各30个个体MHC-DAB基因第2内含子序列（308bp）的遗传变异。108个阳性克隆经SSCP筛选及测序，共获得11种不同的核苷酸序列（I～XI），单个个体最多存在4种等位基因。等位基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅵ是三个群体共有的；Ⅳ仅存在于道氏虹鳟中；VII仅存在于甘肃金鳟中；IX、X、Ⅺ仅存在于美国金鳟中。甘肃金鳟、道氏虹鳟、美国金鳟群体内核苷酸多态位点分别为17个、19个、22个，核苷酸多样性指数（Pi）分别为0．005、0．008、0．013，平均核苷酸位点差异数（K）分别为1．200、2．000、3．333。甘肃金鳟群体与道氏虹鳟群体间的遗传距离最小（O．231），与美国金鳟群体间的遗传距离最大（O．539），三个群体间的遗传分化均达到了种群的分化标准（D〉0．05）。群体遗传分化系数G。，为0．097，表明变异主要来源于群体内个体间。
- 杨娟刘山东施海娜胡丹丹王建福宋超张久盘刘哲
- 关键词：遗传分化
- MHC基因在鱼类遗传育种中的研究与应用被引量：2
- 2013年
- 主要组织相容性复合体(MHC,Major histoeompatibility complex)是最具多态性的免疫分子。其多态性主要取决于群体内MHC基因的大量等位基因及等位基因间高度的序列变异。等位基因的序列变异主要发生在抗原肽结合区(peptide binding region,PBR),这决定了不同基因型个体的免疫力差异。鱼类受多倍化影响,MHC基因的多态性还表现在同一基因存在多个基因座位(多拷贝)。MHC的高度多态性及与机体免疫力的相关性,使其在鱼类遗传进化、抗病育种等方面倍受关注。本文介绍了有关鱼类MHC基因的结构、功能及其在遗传育种中的应用。
- 胡丹丹刘哲
- 关键词：鱼类MHC基因多态性遗传育种
