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国家自然科学基金(20773168)

作品数:9 被引量:15H指数:2
相关作者:李鸿健豆育升唐红孙世新白明泽更多>>
相关机构:重庆邮电大学电子科技大学教育部更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划博士科研启动基金更多>>
相关领域:理学自动化与计算机技术生物学更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 5篇理学
  • 3篇自动化与计算...
  • 1篇生物学

主题

  • 4篇动力学
  • 4篇光化学
  • 3篇化学反应
  • 3篇光化学反应
  • 2篇动力学模拟
  • 2篇异构化
  • 2篇偶氮
  • 2篇偶氮苯
  • 2篇经典动力学
  • 2篇激光
  • 2篇激光化学
  • 1篇多核
  • 1篇多核处理
  • 1篇多核处理器
  • 1篇虚拟实验
  • 1篇虚拟实验平台
  • 1篇虚拟实验室
  • 1篇入侵
  • 1篇失活
  • 1篇鸟嘌呤

机构

  • 7篇重庆邮电大学
  • 2篇电子科技大学
  • 1篇西北大学
  • 1篇教育部

作者

  • 4篇李鸿健
  • 3篇豆育升
  • 2篇孙世新
  • 2篇唐红
  • 2篇白明泽
  • 1篇袁帅
  • 1篇索兵兵
  • 1篇赵忠献
  • 1篇王丹
  • 1篇李安阳
  • 1篇张文英
  • 1篇田海江
  • 1篇王育彬
  • 1篇韩慧仙
  • 1篇文振翼
  • 1篇蒙平
  • 1篇魏照林
  • 1篇齐志明
  • 1篇王志瑾

传媒

  • 2篇重庆邮电大学...
  • 1篇中国激光
  • 1篇计算机应用
  • 1篇软件
  • 1篇Chines...
  • 1篇湖南科技大学...
  • 1篇Scienc...
  • 1篇中国科学:化...

年份

  • 1篇2011
  • 4篇2010
  • 2篇2009
  • 2篇2008
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
偶氮苯调控DNA解链的机理研究被引量:2
2009年
采用半经典动力学模拟的方法研究了偶氮苯、2-甲基偶氮苯及2,6-二甲基偶氮苯3种分子的光致异构化反应,上述3种偶氮分子结构由反式变为顺式的时间顺序是偶氮苯2-甲基偶氮苯2,6-二甲基偶氮苯,说明光致异构化反应的活化能顺序是偶氮苯2-甲基偶氮苯2,6-二甲基偶氮苯。这就意味着2,6-二甲基偶氮苯发生光致异构化反应必须吸收足够高能量形成活化分子,从而克服过渡态能垒。较高的能量状态决定了分子在过渡态的热力学稳定性降低,因此反式的2,6-二甲基偶氮苯在过渡态更容易失活,形成顺式异构体。模拟结果解释了2,6-二甲基偶氮苯对DNA解链过程调控效率最高的实验现象。
袁帅王丹白明泽魏照林蒙平豆育升
关键词:偶氮苯光致异构化动力学模拟
A modified multi-reference second order perturbation theory被引量:2
2010年
A new scheme with extended model space is proposed to improve the calculation of multi-reference second order perturbation theory (MRPT2). The new scheme preserves the concise code structure of the original program, and avoids intruder states in constructions of the potential energy surface, which is confirmed by a series of comparable calculations. The new MRPT2 program is an available tool for the research of molecular excited states and electronic spectrum.
LI AnYang1, HAN HuiXian2, SUO BingBing3, WANG YuBin3 & WEN ZhenYi3 1Institute of Computational Chemistry, Chongqing University of Post and Telecommunications, Chongqing 400065, China
关键词:PERTURBATIONMULTI-REFERENCEINTRUDERSTATE
混合并行技术在激光化学反应模拟中的应用被引量:4
2010年
为提高激光化学反应模拟效率,在半经典分子动力学模拟中引入混合并行技术和双层并行思想。基于MPI+OpenMP混合模型设计并实现激光化学反应双层并行模拟算法,上层基于MPI实现节点间的原子分解并行,下层基于OpenMP实现节点内的多线程矩阵并行乘法。在SMP集群中测试表明,模拟大分子体系激光化学反应并行效率可达60%以上。因此,应用混合并行技术可有效提高激光化学反应模拟效率。
李鸿健白明泽唐红孙世新
关键词:SMP集群
激光诱导化学反应的并行计算机模拟被引量:4
2009年
激光与分子的相互作用是研究光化学反应的关键因素,是激光控制化学反应的一个重要课题。基于一种半经典分子动力学模型模拟超快飞秒激光脉冲诱导的光化学反应,该模型通过含时的派耳斯(Peierls)替代把激光脉冲辐射场的矢势与电子进行耦合,明确引入激光脉冲和分子的相互作用;基于该模型实现了激光诱导化学反应模拟程序,通过环丁烷及C_(60)的光裂解反应的计算机模拟与实验结果进行对比,结果表明该模拟程序能够真实地重复实验结果,并能够得到许多实验上得不到的细节。为提高大分子光化学反应模拟的效率,对模拟算法进行并行设计并实现;在大型计算机系统中进行测试,该方法可高效模拟激光脉冲对光化学反应结果的影响,为激光控制化学反应的试验提供信息。
李鸿健豆育升唐红孙世新
关键词:激光化学光化学反应
并行矩阵乘的光化学反应模拟研究被引量:1
2010年
在Linux环境下,为缩短激光诱导光化学反应模拟运行时间,针对光化学反应模拟中力矩阵的稀疏特征,将力矩阵进行分块划分,采用优化的行列分解算法对分块矩阵进行并行化,运用OpenMP实现光化学反应力计算并行化。实验结果表明,在500个C原子参与运算的情况下,单步计算时间缩短到优化前计算时间的10-2数量级,在十六核处理器上获得了十四倍的加速比和80%以上的效率,为高效模拟大分子体系光化学反应提供平台。
赵忠献李鸿健豆育升
关键词:OPENMP多核处理器加速比
激发态鸟嘌呤无辐射失活的动力学模拟
2011年
为了研究DNA碱基在紫外辐射下损伤-修复的机理,采用半经典动力学方法模拟了激发态的鸟嘌呤分子无辐射失活过程.模拟发现了一条新的失活通道,即N7-C8解离,释放的键能转化为分子动能.C8-H的强烈振动会导致无辐射跃迁,使分子在600 fs以内返回基态,从而避免了鸟嘌呤的光损伤.
张文英齐志明王志瑾
关键词:鸟嘌呤解离
基于虚拟实验平台的C60光裂解反应模拟
2008年
C60具有特殊结构。其结构对称,电子结构简单,在强激光照射下具有极快的反应。基于半经典动力学模型和MPI并行接口,构建了能够模拟激光化学虚拟实验的SMP集群平台。利用虚拟实验平台模拟C60在脉宽为80飞秒(fs)的激光脉冲激发下产生的光裂解反应。通过计算机模拟研究表明,C60在强激光照射下产生C,C2,C3等产物,与实验结果的对比表明,该平台能够真实地重复实验结果,并能够利用该平台研究不同强度激光参数对C60光裂解反应产物的影响,得到许多实验上无法获得的细节。
李鸿健田海江
关键词:虚拟实验室光化学反应
Trans-cis photoisomerization of azobenzene by n→π* excitation:A semiclassical dynamics study被引量:2
2008年
<正>A realistic dynamics simulation study is reported for the trans-cis photoisomerization of azobenzene triggered by the n→π~* excitation and the results show that the formation of cis isomer follows the rotational motion around the N=N bond.The simulation find that the CNN bond angle bending vibrations also play a significant role in the vibronic coupling between the HOMO and LUMO,which essentially leads a nonadiabatic transition of the molecule to the electronic ground state.
Shuai YuanWei Feng WuYusheng DouJian She Zhao
关键词:偶氮苯光异构化
多参考态二级微扰方法的改进
2010年
本文提出一个新的扩大模型空间的方案用于改进多参考态二级微扰理论(MRPT2)计算.新方案保持了原方案中扩大模型空间之前的简单程序结构,理论上完全可以避免势能面计算中入侵态的出现,并在一系列比较计算中得到证实.新MRPT2程序是研究分子激发态和电子光谱的有用工具.
李安阳韩慧仙索兵兵王育彬文振翼
关键词:微扰理论
共1页<1>
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