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国家重点基础研究发展计划(2012CB910603)

作品数:9 被引量:33H指数:5
相关作者:屈锋赵新颖魏强王晓倩杨歌更多>>
相关机构:北京理工大学北京市理化分析测试中心北京蛋白质组研究中心更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家重大科学仪器设备开发专项更多>>
相关领域:理学生物学更多>>

文献类型

  • 9篇期刊文章
  • 7篇会议论文

领域

  • 11篇理学
  • 5篇生物学

主题

  • 11篇毛细管
  • 11篇毛细管电泳
  • 6篇蛋白
  • 6篇蛋白质
  • 6篇适配体
  • 6篇配体
  • 6篇白质
  • 5篇相互作用
  • 4篇核酸
  • 4篇核酸适配体
  • 3篇毛细管电泳技...
  • 2篇亲和毛细管电...
  • 2篇邻位
  • 2篇毛细管电泳法
  • 2篇毛细管区带
  • 2篇毛细管区带电...
  • 1篇蛋白质水平
  • 1篇盐酸克伦特罗
  • 1篇盐酸克仑特罗
  • 1篇质谱

机构

  • 14篇北京理工大学
  • 5篇北京市理化分...
  • 1篇西北大学
  • 1篇中北大学
  • 1篇国家海洋局
  • 1篇北京蛋白质组...

作者

  • 12篇屈锋
  • 6篇魏强
  • 4篇赵新颖
  • 4篇杨歌
  • 3篇龚芮
  • 3篇王晓倩
  • 1篇苏锐
  • 1篇申烨华
  • 1篇张养军
  • 1篇钱小红
  • 1篇洪专
  • 1篇秦伟捷
  • 1篇胡佳薇
  • 1篇高铁
  • 1篇罗爱芹
  • 1篇郭淑元
  • 1篇陈凡
  • 1篇邓玉林
  • 1篇王云
  • 1篇刘亚辉

传媒

  • 5篇色谱
  • 4篇中国化学会第...
  • 1篇分析化学
  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇生命科学仪器
  • 1篇Scienc...
  • 1篇第十届全国生...
  • 1篇第二十届全国...

年份

  • 9篇2016
  • 3篇2015
  • 2篇2014
  • 1篇2013
  • 1篇2012
9 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
2015年毛细管电泳技术年度回顾被引量:8
2016年
本文为2015年毛细管电泳(CE)技术的年度回顾。归纳了ISI Web of Science中检索的2015年度CE技术相关的论文,从毛细管电泳-质谱(CE-MS)联用技术、方法学研究、检测与富集、手性分子拆分及CE技术应用5个方面进行了分类说明;简要介绍了2015年涉及CE技术的国际会议6个,国内会议2个以及各会议的研究报道情况。最后,介绍了目前国内外的单克隆抗体、水质、酒类和食品分析中涉及的毛细管电泳的方法标准。
王晓倩赵新颖刘品多魏强屈锋
关键词:毛细管电泳
邻位连接分析中毛细管电泳的应用
<正>邻位连接分析(Proximity ligation assay,PLA)是一种新型蛋白质定量检测方法1,2。利用PCR扩增技术,可将微量蛋白的检测转化为具有放大效应的核酸检测。邻位连接分析基于核酸检测蛋白质的关键是...
龚芮屈锋
关键词:毛细管区带电泳核酸探针
文献传递
色谱保留时间预测算法分析与比较
2016年
随着对复杂生物体系蛋白质组质谱数据挖掘和蛋白质功能分析的深入进行,科学家迫切需要获得大量蛋白质的信息,依赖于LC-MS的蛋白组学技术为此提供了新的思路和解决办法。肽段的色谱保留时间已经被用于了蛋白质的鉴定和定量工作中。目前,研究人员已经建立了多种肽段色谱保留时间预测模型,通过分析肽段的理化性质,色谱条件的变化,预测肽段的色谱保留行为。SSRCalc和ELUDE是目前使用较广泛的两个预测模型。本文以标准蛋白酶切产物为研究对象,分别采用两种预测模型对肽段的保留时间进行预测,同时对这些肽段进行了LC-MS/MS分析,得到实验保留时间,通过比较分析肽段的预测保留时间和实验保留时间,评价同一色谱条件下,两个预测模型的准确性。结果表明,运用SSRCalc模型,选择孔径100的C18色谱柱,流动相含有0.1%甲酸的条件下,建立的拟合曲线判定系数为0.85,是两个预测模型中最优的。
刘亚辉苏锐王云王玉琢邓玉林
关键词:色谱
多层开管毛细管酶反应器的制备及在蛋白质酶切中的应用被引量:5
2012年
以石英毛细管作为酶固定化的载体,在毛细管内壁上逐步合成树枝形大分子聚酰胺-胺(PAMAM),再通过交联剂戊二醛将胰蛋白酶直接键合到该大分子的末端氨基上,并对酶固定化条件进行了优化,制备了多层酶反应器.利用该酶反应器对马心细胞色素C等蛋白质进行了酶切,并对酶切的条件进行了优化.实验结果表明,该固定化酶反应器具有较高的酶切效率、良好的重现性和稳定性,可用于蛋白质组学的研究.
胡佳薇申烨华秦伟捷张养军钱小红
关键词:开管柱
A novel method for identification and relative quantification of N-terminal peptides using metal-element-chelated tags coupled with mass spectrometry
2014年
By means of the reaction between a DOTA-NHS-ester bifunctional reagent and N-terminal peptides of proteins,and then chelation of lanthanide metal ions as tags,we established a novel method for the identification of N-terminal peptides of proteins and their relative quantification using metal-element-chelated tags coupled with mass spectrometry.The experimental results indicate that metal elements are able to completely label N-terminal peptides at the protein level.The N-terminal peptides are enriched as the peptides digested with trypsin are selectively eliminated by isothiocyanate-coupled silica beads.We successfully identified the N-terminal peptides of 158 proteins of Thermoanaerobacter tengcongensis incubated at 55 and 75°C,among which N-terminal peptides of 24 proteins are partially acetylated.Moreover,metal-element tags with high molecule weights make it convenient for N-terminal peptides consisting of less than 6 amino acids to be identified;these make up 55percent of the identified proteins.Finally,we developed a general approach for the relative quantification of proteins based on N-terminal peptides.We adopted lysozyme and ribonuclease B as model proteins;the correlation coefficients(R2)of the standard curves for the quantitative method were 0.9994 and 0.9997,respectively,with each concentration ratio ranging from0.1 to 10 and both relative standard derivations(RSD)measured at less than 5%.In T.tengcongensis at two incubation temperatures,80 proteins possess quantitative information.In addition,compared with the proteins of T.tengcongensis incubated at 55°C,in T.tengcongensis incubated at 75°C,7 proteins upregulate whereas 16 proteins downregulate,and most differential proteins are related to protein synthesis.
YAN HuiHAO FeiRanCAO QiChenLI JiaBinLI NanNanTIAN FangBAI HaiHongREN XiaoJunLI XianYuZHANG YangJunQIAN XiaoHong
关键词:N-末端质谱联用蛋白质水平
毛细管电泳技术在核酸适配体研究中的应用
<正>毛细管电泳作为高效、快速、低成本的微量分析技术在全细胞、微生物和生物大分子蛋白质、核酸以及药物分析研究中有很大的应用潜力和应用空间。本课题组利用毛细管电泳技术进行了如下研究:
屈锋
文献传递
蛋白质的核酸适配体筛选的研究进展被引量:8
2016年
核酸适配体是通过指数富集系统配体进化(SELEX)筛选获得的,与靶标具有高亲和力和特异性结合的单链DNA或RNA。蛋白质是生命进程中的关键功能分子。近年来,以蛋白质为靶标的适配体筛选在蛋白质相关的基础及应用研究领域受到广泛关注。核酸适配体应用性能的优劣取决于其亲和力、特异性与稳定性。目前,适配体筛选方法的优化主要是提高筛选效率、提升适配体性能及降低筛选成本。适配体主要筛选步骤包括复合物分离、核酸库优化、次级库的富集、适配体序列分析以及亲和力表征等。迄今为止,以蛋白质-核酸复合物的分离为核心步骤的适配体筛选方法有20余种。本文归纳总结了2005年以来以蛋白质为靶标的适配体筛选技术,讨论了各方法的缺陷与局限。介绍了核酸库的设计优化方法、适配体的序列特征,以及常用的亲和力表征方法。
杨歌魏强赵新颖屈锋
关键词:核酸适配体蛋白质
全细胞的核酸适配体筛选的研究进展被引量:9
2016年
核酸适配体(aptamer)是从人工合成的随机单链DNA(ssDNA)或RNA文库中筛选得到的,能够高亲和力、高特异性地与靶标结合的ssDNA或RNA。核酸适配体的靶标范围广,可包括小分子、蛋白质、细胞、微生物等多种靶标。其中以细胞为靶标的适配体在生物感应、分子成像、医学诊断、药物传输和疾病治疗等领域有很大的应用潜能。但全细胞的核酸适配体筛选过程复杂,筛选难度大,筛选的适配体性能不佳是导致目前可用的适配体非常有限的主要原因。由于细胞表面蛋白质在提取纯化过程中分子结构和形态会发生改变,故以膜表面蛋白质为靶标筛选的适配体很难应用于识别整体细胞。以全细胞为靶标的核酸适配体筛选则不需要准确了解细胞表面的分子结构,筛选过程中可保持细胞的天然状态,以全细胞为靶标筛选出的核酸适配体有望直接用于全细胞识别。本文总结了2008~2015年全细胞的核酸适配体筛选的研究进展,介绍了靶细胞的分类、核酸库的设计、筛选条件和方法以及核酸适配体的亲和力表征方法等。并列出全细胞靶标的核酸适配体序列。
刘品多屈锋
关键词:核酸适配体细胞
2014年毛细管电泳技术年度回顾被引量:5
2015年
本文为2014年毛细管电泳(CE)技术的年度回顾。介绍了2014年涉及CE技术的国际会议5个,国内会议2个,总结了各会议的研究报道情况;归纳了在ISI Web of Science中检索到的2014年度发表的与CE技术相关的论文,并对以上论文在生物医药研究、检测器使用以及重要分析化学杂志发表的情况进行了分类说明。最后,回顾和比较了2012-2014年的CE进展。
王晓倩赵新颖屈锋胡猷浩龚芮魏强
关键词:毛细管电泳
蛋白质靶标与不同长度核酸库相互作用的比较
<正>在蛋白质靶标的适配体筛选过程中,初始核酸库的优化是成功筛选适配体的关键。常规的核酸库由两端的引物序列与中间的随机序列构成,随机序列长度一般为20至60个碱基。核酸库的结构多样性随着随机序列长度的增加呈指数倍增长(4...
杨歌魏强屈锋
关键词:适配体蛋白质毛细管电泳相互作用
文献传递
共2页<12>
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