中国博士后科学基金(20090461270)
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
- 相关作者：张国范李莉张琳琳韩斐斐亓海刚更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院大连海洋大学更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布被引量：5
- 2011年
- 长牡蛎（Crassostrea gigas）串联重复序列分析研究较少，为了研究其在基因组转录本的基本结构特征并为长牡蛎中遗传多样性研究中提供有益的信息，利用NCBI公共数据库中的57139条长牡蛎ESTs序列对串联重复序列结构类型、分布、丰度等进行系统比较分析。分析结果表明：1）长牡蛎EST中共有小卫星串联重复序列8392个，在大于100bp重复类型中，162～167bp含量最高；2）长牡蛎ESTSSR含量丰富，1954个位点是EST-SSR标记开发的候选资源；3）EST-SSR重复数目和重复类型在5’UTR，CDS和3＇UTR具有显著差异，CDS区承受更大的选择压力。
- 张琳琳李莉张国范
- 关键词：EST串联重复序列
- 长牡蛎基因组微卫星引物的开发和特性描述被引量：2
- 2011年
- 长牡蛎于20世纪80年代从日本引进中国。在我国,长牡蛎已经成为重要的贝类养殖产业之一。本实验从全基因组上筛查微卫星序列,在微卫星筛查的范围、数目和类型上是传统的富集文库法开发微卫星所无法比拟的。利用基因组微卫星序列总共设计了104对引物,54对引物能扩增出目的片段,其中有34对引物显示多态性扩增,占32.7%,20对引物显示单态性扩增,占19.2%。在自然群体48个个体样本中分析了这些位点的多态性,结果表明:等位基因数目在2～8之间,观测杂合度和期望杂合度分别在0.065 2～0.795 5和0.063 8～0.853 4之间。34对微卫星分子标记中有7对符合哈迪-温伯格平衡,27对或多或少的偏离平衡。微卫星分子标记可以用作分子遗传育种、遗传连锁图谱的构建、种群遗传结构的分析、亲缘关系分析等方面。
- 韩斐斐亓海刚李莉张国范闫喜武李慧娟杨霏王琳楠
- 关键词：长牡蛎微卫星基因组
