国家自然科学基金(81172809)
- 作品数：10 被引量：21H指数：3
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- HIV-1广谱中和活性感染者假病毒的中和表型分析被引量：2
- 2017年
- 目的分析HIV-1广谱中和活性感染者基于膜蛋白基因(env)的假病毒对自体血浆和代表性广谱单克隆中和抗体(bm NAbs)的中和表型。方法单基因组扩增(SGA)广谱中和活性感染者第0月血浆的env基因并克隆至pc D-NA^(TM)3.1 Directional TOPO表达载体,将env表达质粒与HIV-1骨架质粒p SG3△env共转染293T/17细胞制备假病毒,用假病毒分别与自体连续时间点血浆和代表性bm NAbs进行中和实验分析中和表型。结果共获得11株功能性假病毒,假病毒对8个连续时间点自体血浆的中和敏感性呈现先升高(第0~15月),后下降(第16~32月),之后再上升(第33~45月)的波动。所有假病毒对10E8、PGT121和VRC01中和敏感(IC_(50)<6μg/m L);各有18.2%(2株)的假病毒对12A21和2G12高度敏感(IC_(50)<1μg/m L);所有病毒均对PGT135呈中和抗性。结论假病毒对当前时间点血浆的中和敏感性低,对之后时间点血浆中和敏感性增强,提示感染者体内病毒与中和抗体的动态进化过程。同一时间点假病毒对特定bm-NAbs的敏感性差异明显,提示感染者准种毒株间中和表型的复杂性。
- 邹森张岱胡园园齐中伟侯佳利任莉邵一鸣洪坤学
- 关键词：HIV-1膜蛋白假病毒
- HIV-1 B’亚型病毒感染者辅助蛋白Vpr特异性细胞免疫应答被引量：1
- 2012年
- 目的探讨HIV-1 B’亚型病毒感染者针对辅助蛋白Vpr的细胞免疫(CTL)反应特征及其与病毒复制控制的关系。方法利用检测IFN-γ分泌的ELISPOT方法,以覆盖HIV-1 B亚型Vpr蛋白全长的重叠肽段作为刺激抗原检测143例未接受抗病毒治疗的HIV-1 B’亚型病毒感染者针对Vpr蛋白的特异性细胞免疫反应,并分析其与病毒载量的关系。结果有16.8%的感染者可以产生针对Vpr蛋白的特异性CTL反应;能识别至少一条Vpr多肽的感染者的病毒载量低于不能识别Vpr多肽的感染者的病毒载量,差别有统计学意义(P=0.0191);对VPR-B-3多肽的识别与低病毒载量紧密相关,该多肽可能包含与Vpr蛋白的生物学功能相关的关键氨基酸位点;Vpr蛋白区多肽在人群中的识别水平的差异与其序列变异程度有关。结论Vpr蛋白特异性的CTL反应与宿主对病毒复制的控制具有一定的相关性,对Vpr蛋白区所包含的CTL表位进行鉴定并探讨其在感染过程中的作用,可为HIV疫苗设计提供参考依据。
- 刘沙贾明明郑扬邵一鸣洪坤学
- 关键词：免疫应答细胞毒性T淋巴细胞
- 广谱中和活性样本HIV-1 Env基因的氨基酸及密码子使用特点研究
- 2021年
- 目的:分析具有高广谱中和活性的HIV-1感染者包膜蛋白(Env)基因的氨基酸及密码子使用特点。方法:根据中和宽度是否高于90%将样本分为高广谱中和活性组(hBCN+组)和非高广谱中和活性组(hBCN-组),采用单拷贝基因组扩增法(SGA)分离全长Env基因,通过两组样本Env基因的相对氨基酸使用度(RAAU)的对应性分析(COA),并基于相似性指数D(A,B)计算及与宿主相对密码子使用度(RSCU)的比对探讨两组毒株的氨基酸及密码子使用特点。结果:对应性分析结果显示hBCN+组和hBCN-组毒株RAAU数据沿两个主轴分布形成两个相对独立的簇,表明两组毒株Env基因具有相对独特的氨基酸使用模式;相似性指数分析结果显示hBCN+组(0.097)低于hBCN-组(0.102),且两组毒株相比较,hBCN+组Env基因与人具有相似使用模式的密码子少于hBCN-组,提示hBCN+组毒株在感染者体内的适应性较hBCN-组毒株低。结论:hBCN+和hBCN-两组毒株的Env基因具有相对独特的氨基酸使用模式,hBCN+组毒株对宿主的适应性较hBCN-组毒株低。
- 孙莎莎胡园园刘颖任莉阮玉华马丽英邵一鸣洪坤学
- 关键词：HIV-1膜蛋白
- 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型B'亚型感染者人类白细胞抗原Ⅰ类基因对病毒载量的影响被引量：1
- 2014年
- 目的探讨人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)B′亚型感染者人类白细胞抗原(HLA)-A、-B、-C位点等位基因的分布及其对病毒载量的影响。方法对146例HIV-1B′亚型感染者采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)扩增方法进行HLA-A、-B、-C位点等位基因检测,计算各位点等位基因的频率及其对感染者病毒载量的影响。结果在146例HIV-1B′亚型感染者中分别检出HLA-A位点14个等位基因,-B位点24个等位基因,-Cw位点12个等位基因,其中频率大于0.1的等位基因为HLA-A*02,-A*11,-A*24,-A*30,-B*13,-B*40,-B*51,-Cw*03,-Cw*06,-Cw*08;HLA-A、-B、-C等位基因纯合子携带者的病毒载量高于杂合子(P=0.0013);HLA-A*03(P=0.0314)、-A*30(P=0.0072)、-B*13(P=0.0087)、-Cw*06(P=0.0145)等位基因携带者具有较低病毒载量。结论 HIV-1B′亚型感染者HLA-A*03、-A*30、-B*13、-Cw*06等位基因与低病毒载量相关。
- 马永莉陈燕丽郝金娟阮玉华邵一鸣洪坤学
- 关键词：人类免疫缺陷病毒人类白细胞抗原病毒载量
- 昆明市静脉吸毒感染者HIV-1env基因C2-V4区序列特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的分析昆明市静脉吸毒(intravenous drug user,IDU)感染者艾滋病病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)env基因C2-V4区序列特征及代表性广谱单克隆中和抗体(broadly monoclonal neutralizing antibodies,bm NAbs)的表位变异。方法在昆明市收集165份IDUHIV-1感染者血浆样品,提取RNA,通过逆转录得到cDNA,巢式聚合酶链反应(nested-polymerase chain reaction,nested-PCR)扩增HIV-1膜蛋白基因C2-V4区,应用Bio Edit和MEGA等生物信息软件分析所获得序列的特征,并分析2G12、PGT135、PGT128、b12和VRC01等bm NAbs的表位变异。结果 165条序列主要为CRF08_BC(74.55%)和CRF07_BC(23.03%)重组毒株,各可变环变异程度由小到大为V3区
- 邹森高占齐中伟任莉胡园园王铮洪坤学
- 关键词：人免疫缺陷病毒1型流行病学研究
- 基于二代测序技术的HLA基因分型进展被引量：5
- 2017年
- 人类主要组织相容性复合体（MHC）又称人类白细胞抗原（HLA），是人类最复杂的遗传多态性系统。HLA基因位于人第6号染色体短臂6p21．31，其编码的HLA—I类分子和HLA-Ⅱ类分子在调控机体免疫应答、决定疾病易感性中发挥重要作用。
- 邹森洪坤学
- 关键词：人类白细胞抗原基因分型
- HIV-1感染者CD8^+T细胞表面PD-1表达水平的研究被引量：7
- 2012年
- 目的探索我国HIV感染者CD8+T细胞表面PD-1表达水平及其与疾病进展的关系。方法运用流式细胞术测定72例HIV-1感染者和29例健康对照外周血CD8+T细胞表面PD-1表达水平,分析PD-1表达水平与HIV感染者CD4+T细胞计数和血浆病毒载量的相关性。结果 HIV感染者外周血CD8+T细胞表面PD-1表达水平显著高于健康对照(30.395%vs 18.450%,P=0.001),且与CD4+T细胞计数负相关(r=-0.401,P<0.001),与病毒载量正相关(r=0.247,P=0.0368);CD4+T细胞计数小于200细胞/μl的感染者CD8+T细胞表面PD-1表达水平显著高于CD4+T细胞计数大于500细胞/μl的感染者(P=0.002);PD-1的表达在新发感染期和艾滋病期出现两个高峰;长期不进展者PD-1的表达水平与正常对照组差别无统计学意义。结论 HIV感染可显著上调CD8+T细胞表面PD-1的表达水平,PD-1表达水平的变化与HIV疾病进展密切相关。
- 洪坤学刘真贾明明马鹏飞赵全壁邵一鸣
- 关键词：病毒载量疾病进展
- HIV-1B’亚型感染者HLA—A03超型的分布及与病毒载量关系的研究
- 2014年
- 目的分析HIV-1B’亚型感染者HLA—A03超型（HLA—A03s）和相关等位基因的分布及与病毒载量的关系。方法采用聚合酶链反应．序列特异性引物（PCR-SSP）扩增和序列分析技术（SBT）对222例HIV感染者HLA．A位点等位基因进行分型并根据表位肽结合特异性进行超型归类，分析HLA—A03s和相关等位基因与病毒载量的相关性。结果222名感染者中有146人（65．77％）至少携带一个HLA—A03s等位基因；携带HLA-A03s的感染者病毒载量中位数为17900拷贝／ml，显著低于不携带该超型的感染者（35760拷贝／ml，P=0．0005）；携带HLA-A＊1101（Mann-Whitney U=8994，P=0．0096）或HLA-A＊3001（Mann—Whitney U=4048，P=0．0139）等位基因的感染者的病毒载量显著低于不携带者的病毒载量。结论携带HLA-A03s、HIA—A＊1101或HLA—A＊3001等位基因的感染者具有较低的病毒载量。
- 郝金娟刘真任国良赵全璧胡园园阮玉华邵一鸣洪坤学
- 关键词：人类免疫缺陷病毒人类白细胞抗原超型病毒载量
- HIV-1广谱中和活性样本膜蛋白基因序列特征分析被引量：2
- 2016年
- 目的分析广谱中和活性感染者不同时间点HIV-1膜蛋白基因的序列特征。方法应用单拷贝基因组扩增技术（Single genome amplification,SGA）扩增获得不同时间点样本的全长膜蛋白（Env）基因,分析Env基因可变区序列长度、糖基化位点数目、细胞嗜性及中和表位关键氨基酸的变异。结果系统进化分析显示在5个不同时间点获得的98条全长Env基因为HIV-1 B’亚型毒株;毒株序列随时间推移基因距离增加,V1V2区序列长度变化大于V4区,V3区与V5区序列长度保持恒定;Env基因共享序列有27个潜在糖基化位点（PNGS）,V1V2区的糖基化位点数目变化较大,MPER区次之,V3区数目恒定;部分毒株嗜性随时间推移发生了从CCR5到CXCR4的转变;Env基因与广谱中和活性相关的特征氨基酸位点的突变率在4.76%-100.00%间。结论广谱中和活性感染者不同时间点的Env基因序列差异随时间推移而增加,中和单抗识别的关键位点氨基酸存在不同类型和不同程度的突变,表明广谱中和活性感染者体内毒株在免疫压力下持续进化。
- 齐中伟邹森侯佳利朱美玲梁华任莉邵一鸣洪坤学
- 关键词：人类免疫缺陷病毒膜蛋白基因中和抗体
- HIV-1 B’亚型感染者Nef蛋白CTL表位变异与病毒载量的相关性
- 2016年
- 目的探讨HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白细胞毒性淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位变异及其与病毒载量的相关性。方法从137例HIV-1 B’亚型毒株感染者的血浆样本中提取病毒RNA,经逆转录及巢式PCR扩增获得Nef基因并测序,将获得的Nef基因序列翻译为蛋白序列,然后与HIV免疫学数据库中经过实验证实的CTL表位进行比对,分析Nef蛋白CTL表位变异与感染者病毒载量的关系。结果与HIV免疫学数据库中CTL表位的比较发现,本研究137例HIV-1 B’亚型毒株感染者病毒Nef蛋白大部分CTL表位相对保守,只有5个表位的变异频率超过10%,CTL表位旁序列的变异程度较锚着位点变异大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,表位氨基酸总变异频率、锚着位点和表位旁序列的氨基酸变异频率与病毒载量呈正相关,非锚着位点氨基酸的变异与病毒载量无相关性。结论 HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白大部分CTL表位较保守,CTL表位旁序列变异程度较锚着位点大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,推测表位旁序列氨基酸的变异可能是Nef蛋白CTL逃逸突变的主要方式,Nef蛋白CTL表位变异与病毒适应性损伤的关系还需进一步研究。
- 胡园园陈燕丽张岱邹森侯佳莉任莉郝彦玲
- 关键词：HIV-1NEF蛋白CTL表位病毒载量
