陕西省自然科学基金(2007F27)
- 作品数：4 被引量：4H指数：2
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- CoClique:从生物网络中挖掘频繁关联相似模式
- 2011年
- 以前的许多研究已经充证明了挖掘频繁子图是非常有意义的。从单个图中很难挖掘出一些潜在的很有意义的频繁模式,因而应该从多个图中去挖掘频繁模式。以前的研究诸如相似模式(Quasi-Clique)不能解决图中的中心问题。介绍了一个新的概念关联相似模式(Correlated-Quasi-Clique)同时也介绍了一个有效的算法,CoClique,该算法可以解决挖掘过程中所存在的中心问题并且提高挖掘频繁关联相似模式的效率。同时,也提出了一些有效的剪枝策略来缩小搜索空间。在真实数据集上的实验分析结果证明了所提出的算法比以前的算法更有效,结果更好。
- 雷小刚尚学群王淼
- 基于权值图的基因芯片数据差异双聚类挖掘算法被引量：2
- 2011年
- 研究了从基因芯片中挖掘差异双聚类的算法。差异双聚类中的基因在不同类别的数据中表达水准不同,这样的差异双聚类可以有效地找出影响基因表达水平的关键实验因素以及对实验条件敏感的基因。传统的双聚类方法采取分别在两类基因数据中找出聚类,再进行比较以得到最终的差异双聚类,该策略的时间效率不高。为了快速地找出差异双聚类,提出一个全新的基于权值图的差异双聚类方法,该方法的主要创新之处在于直接在由两类数据构成的权值图上挖掘双聚类,避免了分别挖掘再比较的步骤。实验结果证实该算法具有较高的运行效率。
- 刁静霓尚学群王淼缪苗
- 关键词：聚类子空间聚类
- 一种衡量基因语义相似度的新方法被引量：2
- 2011年
- 提出了一种新的方法来衡量基因之间的语义相似度。本方法的主要原则是同时依赖于GO拓扑结构图中基因注释项之间的路径长度和基因注释项的公共祖先节点在GO拓扑结构图中的深度。用人工数据和取自酵母基因数据库的基因数据进行了实验,结果表明本方法比传统方法更有效。
- 张少华尚学群王淼
- 从基因芯片数据快速有效地挖掘共调控基因
- 2010年
- 针对基因芯片数据高噪音、列(基因)数比行(实验条件)数多几个数量级的特殊性,为了进一步提高从基因芯片数据挖掘共调控基因的时间效率和挖掘结果的有效性,首先根据所有两两基因对之间的Pearson相关系数对原始完整数据集进行分组,然后使用列(基因)枚举方法对各组数据分别进行闭合频繁模式挖掘,并对活化和抑制共调控关系的挖掘分别进行处理。实验结果证明:算法快速有效地挖掘出了两种共调控基因。
- 赵倩尚学群
- 关键词：基因芯片数据
